Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0CF38

Protein Details
Accession X0CF38    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-104PESLQRSISPPKKRDRKLTVVKSPWQLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 12, nucl 7.5, cyto 1, plas 1, pero 1, golg 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MTIASQTPSRLISSFSTSPCWGIVSRNYPQINITPICQGLLPASQHPQLPSASPYHQTTTMNRPVKRQRMEEPDAQTPESLQRSISPPKKRDRKLTVVKSPWQLTWIRDLPEGDNQDAVTLKDLLSDPLISECWEFNFLHDIPFLMNSFDPDTRHLVKVHLVHGFWKREDANRIALENASSEFENIKTHIAPMPEMFGTHHSKMMILFRHDGTAQVIIHTANMIPKDWTNMSNGVWKSPLLPKLSGAQNFQASPEDHSVGSGQRFKIDLLNYLKAYDRRKIICKPLTDKLTHYDFSSIKAALVASVPGKHDARDMSETSWGWAALKRCLQHVPCQDHGDSDIVVQVSSIATLGAKDDWLQKTLFEPLTRSKNPGLGRPRFKVVFPTADEIRRSLDGYASGGSIHTKIQSSQQAKQLEYLRPIFHHWANDSPRGAKLPEDTPLRDSGRKRAAPHIKTYIRSNKSSIDWGLLTSANISKQAWGEAARPTGEMRIASWEIGVLVWPELIEQDSIMVGTFKTDMPENTPSTGEKDGCKSIVGLRMPYNTPLQRYASEEIPWVASMSHTEPDWAGQTWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.34
4 0.33
5 0.33
6 0.31
7 0.3
8 0.23
9 0.23
10 0.29
11 0.31
12 0.35
13 0.43
14 0.43
15 0.41
16 0.43
17 0.42
18 0.41
19 0.35
20 0.32
21 0.28
22 0.27
23 0.27
24 0.24
25 0.21
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.19
30 0.23
31 0.25
32 0.28
33 0.28
34 0.29
35 0.25
36 0.25
37 0.25
38 0.25
39 0.26
40 0.28
41 0.3
42 0.32
43 0.34
44 0.35
45 0.37
46 0.41
47 0.48
48 0.52
49 0.5
50 0.56
51 0.63
52 0.7
53 0.72
54 0.69
55 0.68
56 0.69
57 0.74
58 0.72
59 0.67
60 0.65
61 0.61
62 0.56
63 0.46
64 0.38
65 0.38
66 0.34
67 0.28
68 0.2
69 0.21
70 0.26
71 0.36
72 0.43
73 0.46
74 0.51
75 0.61
76 0.71
77 0.75
78 0.8
79 0.79
80 0.82
81 0.83
82 0.86
83 0.86
84 0.83
85 0.82
86 0.79
87 0.72
88 0.62
89 0.55
90 0.47
91 0.38
92 0.4
93 0.37
94 0.32
95 0.32
96 0.33
97 0.32
98 0.36
99 0.38
100 0.29
101 0.26
102 0.23
103 0.22
104 0.21
105 0.19
106 0.13
107 0.11
108 0.1
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.18
125 0.17
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.13
130 0.15
131 0.14
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.22
140 0.23
141 0.26
142 0.25
143 0.23
144 0.26
145 0.29
146 0.3
147 0.27
148 0.24
149 0.27
150 0.34
151 0.36
152 0.31
153 0.32
154 0.3
155 0.32
156 0.37
157 0.34
158 0.34
159 0.32
160 0.32
161 0.29
162 0.27
163 0.22
164 0.18
165 0.16
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.14
185 0.19
186 0.19
187 0.2
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.23
192 0.22
193 0.19
194 0.21
195 0.2
196 0.21
197 0.21
198 0.2
199 0.16
200 0.16
201 0.13
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.22
220 0.22
221 0.19
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.21
226 0.24
227 0.2
228 0.21
229 0.21
230 0.25
231 0.3
232 0.3
233 0.27
234 0.25
235 0.24
236 0.23
237 0.23
238 0.2
239 0.16
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.15
248 0.16
249 0.14
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.18
254 0.17
255 0.21
256 0.21
257 0.24
258 0.23
259 0.23
260 0.25
261 0.26
262 0.28
263 0.25
264 0.26
265 0.26
266 0.32
267 0.35
268 0.42
269 0.43
270 0.45
271 0.46
272 0.48
273 0.48
274 0.44
275 0.41
276 0.37
277 0.35
278 0.31
279 0.26
280 0.24
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.17
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.12
299 0.14
300 0.16
301 0.17
302 0.15
303 0.18
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.13
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.17
313 0.16
314 0.18
315 0.23
316 0.24
317 0.29
318 0.36
319 0.38
320 0.39
321 0.41
322 0.39
323 0.35
324 0.34
325 0.27
326 0.19
327 0.13
328 0.11
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.11
344 0.12
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.2
350 0.21
351 0.16
352 0.18
353 0.22
354 0.31
355 0.31
356 0.34
357 0.3
358 0.34
359 0.35
360 0.4
361 0.44
362 0.44
363 0.5
364 0.49
365 0.53
366 0.49
367 0.48
368 0.47
369 0.41
370 0.38
371 0.33
372 0.35
373 0.32
374 0.35
375 0.35
376 0.29
377 0.27
378 0.22
379 0.21
380 0.16
381 0.15
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.16
395 0.24
396 0.28
397 0.32
398 0.39
399 0.41
400 0.41
401 0.45
402 0.46
403 0.41
404 0.41
405 0.4
406 0.34
407 0.32
408 0.35
409 0.34
410 0.31
411 0.31
412 0.28
413 0.32
414 0.36
415 0.4
416 0.38
417 0.34
418 0.34
419 0.32
420 0.3
421 0.25
422 0.23
423 0.2
424 0.25
425 0.28
426 0.28
427 0.28
428 0.34
429 0.36
430 0.38
431 0.38
432 0.41
433 0.46
434 0.49
435 0.5
436 0.54
437 0.61
438 0.59
439 0.64
440 0.65
441 0.6
442 0.59
443 0.65
444 0.65
445 0.6
446 0.59
447 0.54
448 0.49
449 0.46
450 0.48
451 0.4
452 0.33
453 0.28
454 0.25
455 0.25
456 0.2
457 0.18
458 0.15
459 0.16
460 0.13
461 0.14
462 0.14
463 0.14
464 0.14
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.17
469 0.19
470 0.22
471 0.2
472 0.2
473 0.2
474 0.2
475 0.2
476 0.18
477 0.14
478 0.18
479 0.19
480 0.18
481 0.17
482 0.15
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.08
503 0.08
504 0.1
505 0.12
506 0.13
507 0.19
508 0.25
509 0.26
510 0.27
511 0.28
512 0.27
513 0.29
514 0.33
515 0.3
516 0.27
517 0.3
518 0.32
519 0.31
520 0.3
521 0.27
522 0.27
523 0.32
524 0.32
525 0.3
526 0.31
527 0.35
528 0.36
529 0.38
530 0.42
531 0.38
532 0.39
533 0.4
534 0.4
535 0.37
536 0.41
537 0.42
538 0.36
539 0.34
540 0.32
541 0.29
542 0.27
543 0.25
544 0.2
545 0.16
546 0.13
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.15
551 0.16
552 0.16
553 0.18
554 0.21