Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0BDB0

Protein Details
Accession X0BDB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-184KMPFRRRAKPRTGSQSPKREHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-181RRHDPRYLPPKKASEDTRVAKMPFRRRAKPRTGSQSPK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9.5, cyto_nucl 6.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003615  HNH_nuc  
Pfam View protein in Pfam  
PF13391  HNH_2  
Amino Acid Sequences MSNTTVTPRMRSYGWNTHFVATSRAFHFAGVYQHHDNAFLTFRDIVDELRLCFELPDSTKKEDSWNEIAFGLDKRNRNNSDLAIFVKEEELDTVVPSLPSPDAQERAVVRYHVVRHGQCNLPEGSSLEDHLKASCATHIPRPERRHDPRYLPPKKASEDTRVAKMPFRRRAKPRTGSQSPKREHSGSVSPDKDGEETQHISDMIVPVTEDINRTYAQRIMDSFRSSVMVSAKRCAVTRKGQSWCISPAIGPSLQACHIVPQQQFHVYPDSSNGQDMQFSSRRLHEAWLSTWAPANGILMMSHIHEFFDARLFSIHPETFRIRAFVPYDAILDYHGSIANVPQDVDRAALAHHYDMCCIENMAANMLLPELTTTLTSRAATSGTNSPFTARSDLPATPGPDTSGDPSKRTRIIQDASEEGLDPVAQYYQDGGVDARKLKRQRVEVFNVEDTERIREMRFDSYITSYNSQNFLADVDFELGKLVDYGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.5
3 0.5
4 0.49
5 0.5
6 0.45
7 0.42
8 0.35
9 0.36
10 0.31
11 0.33
12 0.3
13 0.27
14 0.27
15 0.25
16 0.27
17 0.26
18 0.3
19 0.29
20 0.32
21 0.32
22 0.32
23 0.29
24 0.25
25 0.24
26 0.19
27 0.19
28 0.17
29 0.16
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.19
34 0.21
35 0.19
36 0.21
37 0.21
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.18
42 0.2
43 0.28
44 0.29
45 0.34
46 0.36
47 0.37
48 0.43
49 0.41
50 0.45
51 0.44
52 0.41
53 0.37
54 0.36
55 0.35
56 0.3
57 0.27
58 0.27
59 0.26
60 0.29
61 0.33
62 0.42
63 0.45
64 0.47
65 0.49
66 0.44
67 0.41
68 0.39
69 0.36
70 0.29
71 0.25
72 0.23
73 0.19
74 0.16
75 0.14
76 0.12
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.13
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.25
95 0.21
96 0.19
97 0.22
98 0.24
99 0.26
100 0.31
101 0.31
102 0.34
103 0.39
104 0.42
105 0.38
106 0.4
107 0.34
108 0.29
109 0.27
110 0.23
111 0.2
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.14
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.21
125 0.28
126 0.34
127 0.43
128 0.48
129 0.53
130 0.59
131 0.66
132 0.68
133 0.67
134 0.67
135 0.68
136 0.74
137 0.74
138 0.7
139 0.67
140 0.66
141 0.63
142 0.62
143 0.56
144 0.53
145 0.55
146 0.51
147 0.5
148 0.47
149 0.45
150 0.43
151 0.46
152 0.48
153 0.49
154 0.53
155 0.58
156 0.63
157 0.71
158 0.77
159 0.77
160 0.76
161 0.77
162 0.78
163 0.8
164 0.8
165 0.81
166 0.73
167 0.7
168 0.66
169 0.58
170 0.5
171 0.45
172 0.43
173 0.38
174 0.42
175 0.38
176 0.33
177 0.33
178 0.32
179 0.28
180 0.21
181 0.18
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.18
208 0.19
209 0.18
210 0.15
211 0.16
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.17
217 0.18
218 0.2
219 0.19
220 0.2
221 0.21
222 0.22
223 0.25
224 0.31
225 0.37
226 0.38
227 0.42
228 0.43
229 0.42
230 0.39
231 0.33
232 0.26
233 0.19
234 0.17
235 0.14
236 0.13
237 0.11
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.2
251 0.19
252 0.21
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.18
268 0.2
269 0.2
270 0.21
271 0.19
272 0.19
273 0.18
274 0.22
275 0.21
276 0.2
277 0.2
278 0.18
279 0.16
280 0.13
281 0.13
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.15
301 0.16
302 0.13
303 0.17
304 0.18
305 0.2
306 0.2
307 0.21
308 0.17
309 0.2
310 0.21
311 0.19
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.08
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.14
368 0.2
369 0.2
370 0.22
371 0.22
372 0.23
373 0.24
374 0.26
375 0.27
376 0.2
377 0.21
378 0.22
379 0.22
380 0.24
381 0.27
382 0.27
383 0.24
384 0.24
385 0.22
386 0.2
387 0.22
388 0.22
389 0.27
390 0.27
391 0.29
392 0.33
393 0.37
394 0.4
395 0.41
396 0.41
397 0.4
398 0.42
399 0.44
400 0.44
401 0.4
402 0.37
403 0.36
404 0.31
405 0.23
406 0.19
407 0.14
408 0.1
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.12
419 0.16
420 0.21
421 0.25
422 0.31
423 0.37
424 0.44
425 0.51
426 0.58
427 0.63
428 0.67
429 0.71
430 0.7
431 0.71
432 0.67
433 0.61
434 0.52
435 0.45
436 0.37
437 0.33
438 0.27
439 0.23
440 0.2
441 0.21
442 0.24
443 0.27
444 0.28
445 0.24
446 0.26
447 0.29
448 0.33
449 0.34
450 0.33
451 0.31
452 0.33
453 0.34
454 0.31
455 0.27
456 0.23
457 0.19
458 0.17
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.13
465 0.11
466 0.11