FuNGI

X0CMN8

Protein Details

Accession

X0CMN8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
451-482	APVLSAKAAKKEKKRKSKETSDKKQKKGQSIP	Hydrophilic
521-541	ETKLAASKSKKQKTNRAGSPD	Hydrophilic
573-596	ASTPVTSSKKQRKLKEASVPAPRQ	Hydrophilic
621-654	QPPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKKETPV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
457-479	KAAKKEKKRKSKETSDKKQKKGQ
621-650	QPPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPYKVHSLNKHIENTKKGLSAEAQFNRRPSNRAATIKKESSDPNNIFANNDGDDDDESGSGSDSDSSSDGPADFISKLTSTTKPASATPRRRSKDDEIADSDAERNASKKSTSVKKTAPAKSKPQSSSDSSSEDESDDEKTKAKTNGTSPTKASESTSSSSESGSDSDSDEEDKKAPKPSTKKQDDSASTSDSSSEDESEDEADAKAKPALNGKAATTPDSSSEDSDSESEDEEQDAKPAAKPAAKPVAPEPGSSSSEEEDSDDEMVDESMHIEDREGQLALPNFIAPDFVLRKGDDGTNGRDVAEICNKANLEGKQFWYFTVPSNVPISVVQNLEIPMNQSQSTDKLFSHNGEDYGVSFESIAPKGNIQIMIPSDRPQYQPATKQIDQVMQVKKITQLGSPNSVAPVPKPAPRAQPTGLKARYQPIGVNEPMGSIGDDEDVEMGDAPVLSAKAAKKEKKRKSKETSDKKQKKGQSIPEPPSSRTTEAPTPDTRKNKRKLAASEDDAVAVAEQLQEETKLAASKSKKQKTNRAGSPDLGSEPASAAAKKYTPVLPPAIPTAGTPTPKSASTPVTSSKKQRKLKEASVPAPRQSVVPIPSIPHSSPPRSSPARAPASQPPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKKETPVVPPVHLSSSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.7
3	0.71
4	0.69
5	0.65
6	0.62
7	0.57
8	0.5
9	0.45
10	0.43
11	0.41
12	0.45
13	0.47
14	0.49
15	0.48
16	0.51
17	0.57
18	0.55
19	0.53
20	0.49
21	0.51
22	0.54
23	0.6
24	0.64
25	0.64
26	0.7
27	0.71
28	0.66
29	0.61
30	0.58
31	0.56
32	0.59
33	0.52
34	0.47
35	0.47
36	0.46
37	0.42
38	0.38
39	0.34
40	0.24
41	0.23
42	0.19
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.15
47	0.11
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.07
55	0.09
56	0.09
57	0.1
58	0.1
59	0.11
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.1
65	0.1
66	0.11
67	0.11
68	0.13
69	0.16
70	0.18
71	0.21
72	0.25
73	0.27
74	0.27
75	0.32
76	0.4
77	0.47
78	0.55
79	0.6
80	0.67
81	0.68
82	0.71
83	0.75
84	0.73
85	0.73
86	0.69
87	0.66
88	0.61
89	0.59
90	0.55
91	0.48
92	0.4
93	0.31
94	0.25
95	0.19
96	0.15
97	0.14
98	0.16
99	0.15
100	0.18
101	0.26
102	0.35
103	0.41
104	0.47
105	0.5
106	0.57
107	0.66
108	0.7
109	0.71
110	0.68
111	0.73
112	0.73
113	0.77
114	0.71
115	0.67
116	0.64
117	0.6
118	0.59
119	0.52
120	0.48
121	0.4
122	0.38
123	0.34
124	0.28
125	0.23
126	0.18
127	0.18
128	0.17
129	0.17
130	0.18
131	0.19
132	0.24
133	0.27
134	0.29
135	0.31
136	0.34
137	0.43
138	0.46
139	0.49
140	0.44
141	0.45
142	0.43
143	0.39
144	0.36
145	0.3
146	0.28
147	0.26
148	0.27
149	0.24
150	0.23
151	0.22
152	0.2
153	0.17
154	0.14
155	0.13
156	0.12
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.13
161	0.14
162	0.14
163	0.16
164	0.18
165	0.2
166	0.27
167	0.3
168	0.35
169	0.43
170	0.52
171	0.6
172	0.66
173	0.68
174	0.66
175	0.72
176	0.68
177	0.65
178	0.59
179	0.51
180	0.42
181	0.38
182	0.33
183	0.24
184	0.21
185	0.16
186	0.13
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.18
201	0.2
202	0.22
203	0.23
204	0.23
205	0.26
206	0.26
207	0.27
208	0.22
209	0.2
210	0.19
211	0.21
212	0.21
213	0.17
214	0.18
215	0.16
216	0.15
217	0.15
218	0.14
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.12
231	0.14
232	0.16
233	0.16
234	0.22
235	0.3
236	0.29
237	0.3
238	0.29
239	0.36
240	0.34
241	0.33
242	0.31
243	0.27
244	0.28
245	0.28
246	0.27
247	0.18
248	0.18
249	0.18
250	0.15
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.11
271	0.11
272	0.12
273	0.09
274	0.09
275	0.07
276	0.07
277	0.08
278	0.04
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.15
289	0.17
290	0.18
291	0.19
292	0.18
293	0.17
294	0.17
295	0.16
296	0.19
297	0.17
298	0.14
299	0.16
300	0.16
301	0.16
302	0.2
303	0.18
304	0.18
305	0.19
306	0.21
307	0.22
308	0.22
309	0.22
310	0.2
311	0.19
312	0.16
313	0.19
314	0.17
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.14
319	0.14
320	0.14
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.11
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.15
341	0.17
342	0.16
343	0.15
344	0.14
345	0.14
346	0.11
347	0.12
348	0.11
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.08
361	0.1
362	0.1
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.18
369	0.18
370	0.22
371	0.23
372	0.28
373	0.33
374	0.39
375	0.38
376	0.41
377	0.4
378	0.38
379	0.37
380	0.39
381	0.35
382	0.29
383	0.29
384	0.26
385	0.26
386	0.26
387	0.24
388	0.19
389	0.21
390	0.21
391	0.25
392	0.25
393	0.24
394	0.21
395	0.21
396	0.19
397	0.14
398	0.19
399	0.17
400	0.2
401	0.23
402	0.26
403	0.34
404	0.37
405	0.42
406	0.38
407	0.43
408	0.43
409	0.49
410	0.47
411	0.41
412	0.39
413	0.38
414	0.37
415	0.3
416	0.29
417	0.23
418	0.26
419	0.24
420	0.24
421	0.2
422	0.18
423	0.17
424	0.15
425	0.11
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.07
443	0.08
444	0.16
445	0.24
446	0.32
447	0.42
448	0.53
449	0.63
450	0.71
451	0.8
452	0.83
453	0.85
454	0.9
455	0.9
456	0.91
457	0.92
458	0.92
459	0.92
460	0.89
461	0.87
462	0.82
463	0.81
464	0.78
465	0.77
466	0.77
467	0.76
468	0.75
469	0.76
470	0.73
471	0.65
472	0.61
473	0.55
474	0.47
475	0.39
476	0.38
477	0.34
478	0.35
479	0.38
480	0.39
481	0.41
482	0.46
483	0.54
484	0.59
485	0.63
486	0.68
487	0.72
488	0.72
489	0.75
490	0.74
491	0.73
492	0.72
493	0.66
494	0.61
495	0.53
496	0.46
497	0.38
498	0.3
499	0.21
500	0.12
501	0.08
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.09
511	0.09
512	0.16
513	0.2
514	0.29
515	0.4
516	0.48
517	0.55
518	0.62
519	0.73
520	0.76
521	0.83
522	0.81
523	0.79
524	0.74
525	0.68
526	0.63
527	0.54
528	0.45
529	0.36
530	0.28
531	0.2
532	0.17
533	0.16
534	0.14
535	0.12
536	0.12
537	0.13
538	0.13
539	0.14
540	0.17
541	0.19
542	0.2
543	0.24
544	0.28
545	0.27
546	0.28
547	0.3
548	0.28
549	0.24
550	0.21
551	0.24
552	0.24
553	0.26
554	0.25
555	0.25
556	0.26
557	0.27
558	0.29
559	0.27
560	0.27
561	0.27
562	0.3
563	0.35
564	0.4
565	0.46
566	0.53
567	0.6
568	0.65
569	0.71
570	0.76
571	0.77
572	0.79
573	0.83
574	0.83
575	0.83
576	0.8
577	0.82
578	0.78
579	0.71
580	0.65
581	0.56
582	0.46
583	0.38
584	0.37
585	0.29
586	0.28
587	0.26
588	0.26
589	0.29
590	0.33
591	0.31
592	0.33
593	0.37
594	0.39
595	0.41
596	0.43
597	0.48
598	0.49
599	0.52
600	0.51
601	0.54
602	0.57
603	0.55
604	0.56
605	0.57
606	0.6
607	0.59
608	0.51
609	0.46
610	0.43
611	0.45
612	0.44
613	0.38
614	0.41
615	0.46
616	0.52
617	0.58
618	0.62
619	0.7
620	0.76
621	0.84
622	0.84
623	0.87
624	0.91
625	0.93
626	0.94
627	0.94
628	0.95
629	0.94
630	0.94
631	0.93
632	0.92
633	0.91
634	0.9
635	0.84
636	0.79
637	0.78
638	0.74
639	0.71
640	0.69
641	0.62
642	0.55
643	0.53
644	0.5

X0CMN8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer