Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0CQI5

Protein Details
Accession X0CQI5    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-171EVIKITGKSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTTKKQSSKAASKDHHydrophilic
176-201DNDDDKQKKVKPAKPRKKTGTMSSHFHydrophilic
318-342MAPDKSPTKKAPKKKKPRTITELATHydrophilic
380-408KNAKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPKPVLLSHydrophilic
668-694APPATTSSPKKPRGRPRKNSINAPEPQHydrophilic
697-722PPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-169KSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTTKKQSSKAASK
181-194KQKKVKPAKPRKKT
321-335DKSPTKKAPKKKKPR
382-403AKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPK
676-749PKKPRGRPRKNSINAPEPQEPPPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSIPGAASPSKPKSAAKPKRVVASPRRKKAT
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MVSSNAFGTSPLGDTRRQPLHVNSSSPDLPSLRDVLTTKATSQPSAHNGSGAAVLSIDGPSGFISARQLYPATESAPKVISTPSTGLPWTLSHPGEVTGLAEDVSGNGGFIAGDNEPPKEREEHIEVIKITGKSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTTKKQSSKAASKDHSPAEDNDDDKQKKVKPAKPRKKTGTMSSHFPPPKESKDLEKAKQIDVNEPLHLEQAPARRLDWTPPAQKTIVDLDSDSSVFKNLGSSEADQRLPVFKNLVDGYSCMEGPNESISHSITNASDEDSSFLKKRKRIELLATKGTDAPAMAPDKSPTKKAPKKKKPRTITELATAAYRVPSQPDTEPPNASILDHFSTTNKEAGSVADEQTKNAKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPKPVLLSPSAALAQVANQDFVFGTSSQLAREESPTVLRDLQAALRQSDQNHDMDFAMPLNSDAIESPQQRSNLWDAAARDAEGDLFDVEVINLADDTGLSEVGHVSNPFGYQLGADDSVICVESRVLDDHIPPAKPRNDIPSPDEKDLVDSRASSPYFSDSELSTSTNVHRPPLAQTEVSQANQMTTAEEPESLPELPAQPPRPNYEAFTDIRLAREIKRFGFKPIKRRSAMIALLDQCWQSKTRMGQASLHTSTKLSSPTKTTRAAPPATTSSPKKPRGRPRKNSINAPEPQEPPPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSIPGAASPSKPKSAAKPKRVVASPRRKKATAKSVIEIPDSEDNESDEFASSPDTNAEQMFSSPPPLDMSLTTNDGTPLTATQSDQEALLFDHITNAVTSAPRTTNPQEPSWHEKILIYDPIVLEDLASWLNTGELSRVGYDGEVNPNDVKKWCESKSICCLWRISLRGKERKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.31
3 0.36
4 0.38
5 0.41
6 0.44
7 0.52
8 0.54
9 0.54
10 0.48
11 0.49
12 0.47
13 0.43
14 0.39
15 0.3
16 0.27
17 0.26
18 0.27
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.24
23 0.29
24 0.29
25 0.28
26 0.32
27 0.34
28 0.32
29 0.34
30 0.36
31 0.36
32 0.41
33 0.39
34 0.33
35 0.31
36 0.3
37 0.29
38 0.22
39 0.16
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.05
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.11
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.21
58 0.22
59 0.21
60 0.23
61 0.23
62 0.24
63 0.25
64 0.24
65 0.21
66 0.22
67 0.2
68 0.19
69 0.21
70 0.2
71 0.21
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.23
78 0.22
79 0.2
80 0.2
81 0.21
82 0.2
83 0.19
84 0.15
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.08
99 0.06
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.22
108 0.26
109 0.3
110 0.34
111 0.35
112 0.4
113 0.37
114 0.36
115 0.4
116 0.33
117 0.28
118 0.29
119 0.3
120 0.32
121 0.43
122 0.51
123 0.56
124 0.67
125 0.76
126 0.8
127 0.86
128 0.89
129 0.88
130 0.89
131 0.86
132 0.83
133 0.81
134 0.75
135 0.71
136 0.67
137 0.66
138 0.64
139 0.67
140 0.67
141 0.7
142 0.76
143 0.81
144 0.85
145 0.87
146 0.88
147 0.9
148 0.88
149 0.89
150 0.86
151 0.84
152 0.81
153 0.8
154 0.72
155 0.67
156 0.66
157 0.59
158 0.54
159 0.47
160 0.41
161 0.38
162 0.39
163 0.35
164 0.33
165 0.39
166 0.37
167 0.36
168 0.41
169 0.38
170 0.44
171 0.53
172 0.55
173 0.57
174 0.67
175 0.76
176 0.8
177 0.86
178 0.85
179 0.86
180 0.85
181 0.84
182 0.83
183 0.76
184 0.71
185 0.64
186 0.65
187 0.57
188 0.51
189 0.48
190 0.43
191 0.45
192 0.45
193 0.44
194 0.43
195 0.5
196 0.58
197 0.55
198 0.58
199 0.55
200 0.51
201 0.52
202 0.46
203 0.41
204 0.38
205 0.37
206 0.29
207 0.27
208 0.25
209 0.23
210 0.21
211 0.16
212 0.15
213 0.19
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.23
219 0.26
220 0.3
221 0.32
222 0.37
223 0.39
224 0.42
225 0.39
226 0.39
227 0.37
228 0.34
229 0.28
230 0.21
231 0.19
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.1
243 0.12
244 0.14
245 0.19
246 0.22
247 0.22
248 0.21
249 0.21
250 0.24
251 0.23
252 0.22
253 0.18
254 0.15
255 0.19
256 0.19
257 0.2
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.2
286 0.24
287 0.28
288 0.34
289 0.41
290 0.47
291 0.49
292 0.56
293 0.61
294 0.62
295 0.65
296 0.59
297 0.51
298 0.45
299 0.4
300 0.3
301 0.2
302 0.14
303 0.11
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.13
308 0.19
309 0.21
310 0.24
311 0.27
312 0.36
313 0.44
314 0.54
315 0.64
316 0.69
317 0.79
318 0.86
319 0.9
320 0.89
321 0.9
322 0.88
323 0.84
324 0.77
325 0.7
326 0.61
327 0.51
328 0.42
329 0.32
330 0.24
331 0.17
332 0.13
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.18
339 0.23
340 0.25
341 0.26
342 0.24
343 0.25
344 0.22
345 0.21
346 0.17
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.12
361 0.12
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.2
366 0.23
367 0.21
368 0.2
369 0.22
370 0.19
371 0.28
372 0.38
373 0.46
374 0.5
375 0.59
376 0.68
377 0.69
378 0.77
379 0.79
380 0.8
381 0.8
382 0.82
383 0.82
384 0.84
385 0.9
386 0.9
387 0.89
388 0.85
389 0.8
390 0.76
391 0.7
392 0.63
393 0.54
394 0.45
395 0.35
396 0.28
397 0.22
398 0.17
399 0.12
400 0.08
401 0.07
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.16
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.1
453 0.11
454 0.13
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.19
459 0.2
460 0.17
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.16
465 0.17
466 0.14
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.07
471 0.07
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.09
517 0.14
518 0.17
519 0.17
520 0.17
521 0.22
522 0.24
523 0.26
524 0.27
525 0.3
526 0.31
527 0.33
528 0.38
529 0.42
530 0.43
531 0.43
532 0.42
533 0.34
534 0.34
535 0.32
536 0.28
537 0.19
538 0.15
539 0.15
540 0.19
541 0.19
542 0.16
543 0.15
544 0.16
545 0.16
546 0.16
547 0.16
548 0.11
549 0.13
550 0.13
551 0.14
552 0.11
553 0.12
554 0.13
555 0.17
556 0.17
557 0.16
558 0.16
559 0.16
560 0.2
561 0.24
562 0.24
563 0.2
564 0.2
565 0.24
566 0.26
567 0.26
568 0.23
569 0.18
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.11
574 0.08
575 0.09
576 0.08
577 0.09
578 0.08
579 0.09
580 0.11
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.11
585 0.13
586 0.19
587 0.22
588 0.24
589 0.26
590 0.31
591 0.33
592 0.32
593 0.32
594 0.3
595 0.31
596 0.28
597 0.28
598 0.26
599 0.24
600 0.24
601 0.23
602 0.21
603 0.21
604 0.27
605 0.27
606 0.27
607 0.33
608 0.33
609 0.39
610 0.48
611 0.48
612 0.53
613 0.6
614 0.66
615 0.6
616 0.61
617 0.58
618 0.55
619 0.53
620 0.45
621 0.41
622 0.33
623 0.33
624 0.32
625 0.28
626 0.21
627 0.19
628 0.17
629 0.13
630 0.16
631 0.18
632 0.25
633 0.31
634 0.32
635 0.36
636 0.39
637 0.45
638 0.44
639 0.42
640 0.34
641 0.29
642 0.27
643 0.24
644 0.27
645 0.21
646 0.2
647 0.26
648 0.32
649 0.37
650 0.4
651 0.41
652 0.42
653 0.47
654 0.47
655 0.42
656 0.4
657 0.41
658 0.41
659 0.44
660 0.41
661 0.44
662 0.5
663 0.58
664 0.63
665 0.67
666 0.74
667 0.8
668 0.87
669 0.87
670 0.88
671 0.9
672 0.88
673 0.89
674 0.85
675 0.82
676 0.75
677 0.72
678 0.67
679 0.59
680 0.54
681 0.49
682 0.42
683 0.37
684 0.4
685 0.37
686 0.33
687 0.32
688 0.35
689 0.39
690 0.47
691 0.52
692 0.53
693 0.57
694 0.65
695 0.73
696 0.78
697 0.81
698 0.83
699 0.84
700 0.87
701 0.88
702 0.83
703 0.8
704 0.76
705 0.72
706 0.62
707 0.53
708 0.44
709 0.34
710 0.31
711 0.26
712 0.22
713 0.22
714 0.25
715 0.27
716 0.29
717 0.3
718 0.39
719 0.48
720 0.56
721 0.59
722 0.64
723 0.65
724 0.71
725 0.75
726 0.74
727 0.74
728 0.75
729 0.76
730 0.77
731 0.79
732 0.74
733 0.74
734 0.75
735 0.75
736 0.74
737 0.68
738 0.62
739 0.62
740 0.61
741 0.56
742 0.46
743 0.4
744 0.36
745 0.32
746 0.29
747 0.23
748 0.22
749 0.21
750 0.21
751 0.17
752 0.11
753 0.1
754 0.09
755 0.12
756 0.11
757 0.11
758 0.12
759 0.13
760 0.13
761 0.13
762 0.14
763 0.11
764 0.12
765 0.14
766 0.13
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.17
771 0.17
772 0.17
773 0.16
774 0.19
775 0.19
776 0.22
777 0.21
778 0.19
779 0.18
780 0.17
781 0.16
782 0.13
783 0.11
784 0.12
785 0.13
786 0.13
787 0.14
788 0.16
789 0.16
790 0.15
791 0.14
792 0.12
793 0.12
794 0.13
795 0.12
796 0.09
797 0.11
798 0.11
799 0.11
800 0.1
801 0.1
802 0.1
803 0.11
804 0.12
805 0.14
806 0.16
807 0.16
808 0.23
809 0.27
810 0.34
811 0.37
812 0.41
813 0.43
814 0.48
815 0.56
816 0.54
817 0.52
818 0.44
819 0.42
820 0.41
821 0.4
822 0.38
823 0.3
824 0.28
825 0.26
826 0.26
827 0.26
828 0.21
829 0.16
830 0.12
831 0.12
832 0.09
833 0.09
834 0.07
835 0.06
836 0.07
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.08
841 0.1
842 0.1
843 0.11
844 0.11
845 0.11
846 0.13
847 0.15
848 0.21
849 0.21
850 0.23
851 0.26
852 0.27
853 0.29
854 0.29
855 0.29
856 0.29
857 0.36
858 0.36
859 0.44
860 0.46
861 0.52
862 0.59
863 0.65
864 0.61
865 0.56
866 0.56
867 0.52
868 0.56
869 0.53
870 0.52
871 0.52
872 0.59
873 0.66