FuNGI

X0C6A7

Protein Details

Accession

X0C6A7

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
169-195	IDATQDKSNKDRKRKRKNENDDLEGRY	Hydrophilic
462-481	FPPMLPRKLRVTRAKDPRKT	Hydrophilic
524-543	GRSAAVQQRHKKRPSTQGAS	Hydrophilic
573-601	PKDLKLGKKGKGKGRSSRPQNRGARRAAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
178-185	KDRKRKRK
466-493	LPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKNV
567-606	SAKDGTPKDLKLGKKGKGKGRSSRPQNRGARRAAEWKKKS

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MSFSVAGQKECTRVDNFSNSAQTVLNLTQWQNGKLPILDTFTDKDLTKNSSKGLTASSKAVDPTLDALFASSAGPVQAPAKSRYSTLVEQKVREPPKPRVQLEEQDADDEVLSEISEELSFEEDGPSDEEEDGSDASEPEGESEDEQEQEEESSDEPMKDAPVELDDIIDATQDKSNKDRKRKRKNENDDLEGRYLDKLVAEEEAERAGKRQKNDALNKTEKAVAEDEDAGNDSDIPVHETLAKDSKSSDLEKAARTVFLANVSTEAINSKAAKKTLMAHLSSILDKDATPPQTIESLRFRSVAFAGGSLPKRAAYITKSLMDATTKSANAYVVYSTSAAARKAAAELNGTQVLERHLRVDSVAHPSPTDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNTNADGDTTEKKKNKTPSDVEEGLWRTFSTQGKVENVRVVRDSKTRVGKGFAYVQFYDGNDVEAALLLDGKKFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKNVVPSGAAKSTKYKHKATPEEQSMAGRTSKLLGRSAAVQQRHKKRPSTQGASEDAQNIPSNIKGPEQFVFEGRRASAKDGTPKDLKLGKKGKGKGRSSRPQNRGARRAAEWKKKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.39
3	0.39
4	0.4
5	0.42
6	0.38
7	0.37
8	0.33
9	0.28
10	0.24
11	0.22
12	0.2
13	0.19
14	0.2
15	0.24
16	0.27
17	0.29
18	0.28
19	0.29
20	0.28
21	0.26
22	0.27
23	0.24
24	0.25
25	0.24
26	0.24
27	0.25
28	0.24
29	0.26
30	0.25
31	0.24
32	0.24
33	0.3
34	0.31
35	0.31
36	0.32
37	0.33
38	0.34
39	0.32
40	0.34
41	0.34
42	0.31
43	0.32
44	0.31
45	0.29
46	0.29
47	0.28
48	0.22
49	0.17
50	0.18
51	0.15
52	0.13
53	0.11
54	0.11
55	0.1
56	0.11
57	0.1
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.06
62	0.07
63	0.08
64	0.11
65	0.15
66	0.18
67	0.22
68	0.23
69	0.24
70	0.28
71	0.32
72	0.36
73	0.41
74	0.48
75	0.48
76	0.49
77	0.53
78	0.58
79	0.57
80	0.57
81	0.54
82	0.54
83	0.6
84	0.67
85	0.64
86	0.63
87	0.65
88	0.67
89	0.66
90	0.62
91	0.52
92	0.44
93	0.42
94	0.35
95	0.27
96	0.2
97	0.14
98	0.07
99	0.07
100	0.06
101	0.05
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.07
107	0.07
108	0.08
109	0.08
110	0.08
111	0.09
112	0.1
113	0.11
114	0.1
115	0.1
116	0.09
117	0.09
118	0.1
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.08
125	0.07
126	0.07
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.11
131	0.12
132	0.11
133	0.12
134	0.11
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.08
139	0.08
140	0.1
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.08
149	0.08
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.09
160	0.11
161	0.12
162	0.19
163	0.29
164	0.37
165	0.48
166	0.57
167	0.65
168	0.75
169	0.85
170	0.89
171	0.91
172	0.93
173	0.93
174	0.9
175	0.86
176	0.8
177	0.73
178	0.63
179	0.52
180	0.42
181	0.31
182	0.24
183	0.17
184	0.11
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.17
196	0.2
197	0.21
198	0.28
199	0.33
200	0.42
201	0.51
202	0.57
203	0.58
204	0.61
205	0.6
206	0.54
207	0.5
208	0.41
209	0.34
210	0.28
211	0.2
212	0.17
213	0.18
214	0.16
215	0.13
216	0.13
217	0.11
218	0.1
219	0.08
220	0.06
221	0.05
222	0.06
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.09
227	0.09
228	0.11
229	0.16
230	0.16
231	0.14
232	0.15
233	0.17
234	0.18
235	0.2
236	0.19
237	0.19
238	0.22
239	0.23
240	0.25
241	0.22
242	0.2
243	0.18
244	0.17
245	0.12
246	0.11
247	0.11
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.08
256	0.09
257	0.11
258	0.13
259	0.14
260	0.14
261	0.15
262	0.17
263	0.22
264	0.26
265	0.23
266	0.21
267	0.22
268	0.23
269	0.22
270	0.19
271	0.12
272	0.08
273	0.08
274	0.1
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.13
279	0.13
280	0.17
281	0.18
282	0.19
283	0.19
284	0.21
285	0.22
286	0.22
287	0.22
288	0.19
289	0.19
290	0.18
291	0.13
292	0.1
293	0.1
294	0.14
295	0.14
296	0.13
297	0.13
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.12
302	0.1
303	0.14
304	0.16
305	0.17
306	0.17
307	0.17
308	0.17
309	0.16
310	0.15
311	0.13
312	0.13
313	0.12
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.11
319	0.09
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.09
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.1
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.13
342	0.12
343	0.11
344	0.1
345	0.1
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.17
350	0.19
351	0.18
352	0.17
353	0.18
354	0.24
355	0.3
356	0.32
357	0.28
358	0.28
359	0.31
360	0.32
361	0.33
362	0.28
363	0.26
364	0.23
365	0.21
366	0.2
367	0.17
368	0.16
369	0.13
370	0.12
371	0.08
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.07
383	0.12
384	0.15
385	0.23
386	0.27
387	0.29
388	0.36
389	0.45
390	0.5
391	0.54
392	0.57
393	0.56
394	0.6
395	0.6
396	0.54
397	0.51
398	0.46
399	0.37
400	0.31
401	0.25
402	0.17
403	0.2
404	0.22
405	0.18
406	0.18
407	0.21
408	0.26
409	0.29
410	0.3
411	0.31
412	0.3
413	0.29
414	0.28
415	0.28
416	0.26
417	0.28
418	0.31
419	0.32
420	0.4
421	0.41
422	0.4
423	0.41
424	0.39
425	0.38
426	0.42
427	0.37
428	0.34
429	0.31
430	0.31
431	0.29
432	0.27
433	0.27
434	0.18
435	0.17
436	0.11
437	0.11
438	0.1
439	0.08
440	0.08
441	0.05
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.09
448	0.09
449	0.11
450	0.2
451	0.28
452	0.37
453	0.46
454	0.52
455	0.59
456	0.66
457	0.74
458	0.74
459	0.75
460	0.75
461	0.77
462	0.82
463	0.8
464	0.79
465	0.77
466	0.73
467	0.66
468	0.65
469	0.64
470	0.63
471	0.59
472	0.59
473	0.61
474	0.58
475	0.58
476	0.51
477	0.41
478	0.39
479	0.38
480	0.34
481	0.26
482	0.26
483	0.28
484	0.32
485	0.33
486	0.27
487	0.32
488	0.36
489	0.45
490	0.48
491	0.5
492	0.52
493	0.61
494	0.7
495	0.68
496	0.73
497	0.69
498	0.66
499	0.61
500	0.56
501	0.47
502	0.4
503	0.35
504	0.24
505	0.18
506	0.18
507	0.2
508	0.21
509	0.22
510	0.2
511	0.21
512	0.24
513	0.32
514	0.35
515	0.39
516	0.45
517	0.52
518	0.62
519	0.7
520	0.73
521	0.73
522	0.74
523	0.79
524	0.81
525	0.8
526	0.77
527	0.74
528	0.73
529	0.67
530	0.61
531	0.52
532	0.42
533	0.36
534	0.29
535	0.23
536	0.19
537	0.17
538	0.17
539	0.16
540	0.19
541	0.19
542	0.21
543	0.23
544	0.26
545	0.26
546	0.28
547	0.32
548	0.29
549	0.3
550	0.28
551	0.31
552	0.28
553	0.31
554	0.34
555	0.35
556	0.43
557	0.44
558	0.5
559	0.5
560	0.49
561	0.51
562	0.52
563	0.5
564	0.5
565	0.54
566	0.56
567	0.6
568	0.68
569	0.7
570	0.74
571	0.8
572	0.8
573	0.82
574	0.84
575	0.86
576	0.89
577	0.86
578	0.86
579	0.87
580	0.87
581	0.85
582	0.82
583	0.77
584	0.72
585	0.76
586	0.76

X0C6A7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer