Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0B3X1

Protein Details
Accession X0B3X1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-37GHSHSSSKSHHPRPLPKSDPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-153GGKKKP
Subcellular Location(s) extr 16, cyto 6.5, cyto_nucl 4.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR006626  PbH1  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0045490  P:pectin catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00502  POLYGALACTURONASE  
Amino Acid Sequences MRFSLLLLGGFIASAFAGHSHSSSKSHHPRPLPKSDPESDHKSDSSSDSHPASGGCNFTTADTAMQHKSSCSTIVLNNVKVPAGKTLDLTKLKDGTTVIFKGVMTFGYAEWLGPLITISGNGLTIEGDAGHCINGQGRRYWDGKGGNGGKKKPKLLALHNVHDSIVQNLNIKDTPVQAVSINTVTNLLVKDVHIDSSLGDKLGGHNTDGFNVGKVDGLVIDGAVVENQDDCVAINSGKNITFTNGHCSGGHGVSIGSVGNKSSNVVENVLISKTMIENSENAIRIKTIAGATGFVTDVTYEDITLRDIDKYGMVFRQDYLNGGPTQQPTKGVPMTGIRIKNVTGTVKPAGKNIFILCANCKDWTFTNIDITGGQSKEKCVGVPAGAFCA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.07
5 0.07
6 0.09
7 0.11
8 0.14
9 0.18
10 0.22
11 0.32
12 0.41
13 0.49
14 0.55
15 0.62
16 0.71
17 0.75
18 0.82
19 0.78
20 0.75
21 0.75
22 0.73
23 0.7
24 0.67
25 0.67
26 0.6
27 0.58
28 0.5
29 0.45
30 0.4
31 0.37
32 0.34
33 0.29
34 0.29
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.23
39 0.22
40 0.2
41 0.19
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.26
62 0.31
63 0.3
64 0.31
65 0.3
66 0.29
67 0.27
68 0.26
69 0.21
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.22
74 0.29
75 0.33
76 0.34
77 0.33
78 0.32
79 0.31
80 0.31
81 0.28
82 0.23
83 0.24
84 0.23
85 0.19
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.08
121 0.12
122 0.13
123 0.15
124 0.17
125 0.21
126 0.23
127 0.24
128 0.26
129 0.25
130 0.25
131 0.3
132 0.35
133 0.37
134 0.4
135 0.45
136 0.47
137 0.49
138 0.5
139 0.45
140 0.45
141 0.45
142 0.47
143 0.52
144 0.5
145 0.51
146 0.5
147 0.47
148 0.4
149 0.36
150 0.29
151 0.21
152 0.17
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.1
184 0.1
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.14
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.11
228 0.14
229 0.14
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.2
234 0.21
235 0.22
236 0.19
237 0.18
238 0.11
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.11
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.12
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.17
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.2
304 0.19
305 0.2
306 0.2
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.24
311 0.22
312 0.25
313 0.24
314 0.25
315 0.23
316 0.29
317 0.29
318 0.25
319 0.25
320 0.26
321 0.31
322 0.35
323 0.36
324 0.31
325 0.31
326 0.31
327 0.31
328 0.31
329 0.29
330 0.23
331 0.26
332 0.31
333 0.35
334 0.35
335 0.38
336 0.37
337 0.34
338 0.36
339 0.31
340 0.31
341 0.28
342 0.29
343 0.28
344 0.31
345 0.31
346 0.3
347 0.3
348 0.28
349 0.28
350 0.3
351 0.3
352 0.27
353 0.3
354 0.29
355 0.29
356 0.25
357 0.26
358 0.28
359 0.24
360 0.26
361 0.21
362 0.23
363 0.27
364 0.27
365 0.24
366 0.22
367 0.25
368 0.24
369 0.27