Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GR38

Protein Details
Accession C1GR38    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-437LSSFVKKKKRASGTPESSGKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
424-425KK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_00983  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MADASPQSCSPTNDTDAPASESSLELKRAQLADLIERASAKDAIKDYDTAADLYSQATELQAELNGEMSVNNADLLYLYGKSLYNVAVRKSDVLGSKVAGQASTAPKNGIPINGATKTSSESPNKQSLIGNAIAEGSATDEKAVEGITEKTKVGSSSLFQFIGDETLDSDSNEEDGGEEGDGAEQEDDDEFANAYEMLDLARILLLRKMEEMGSEKQSEERKIKERLADIYDLQAEISLEGERFENAVADLRAALDLKTKLFPLEDPSVAECYYKLSLGLEFSSIMLEKAEDGQDTTDAKVTKVDKKLREEAAKHMEIAIQSCKLRISKEQQKLESITEEETIIKMKQSIDDVKEVVSDMELRLIELNRPPVSINDATRNLEGSNALNGILSQVLGQNSSADKDSILQEAVKGANDLSSFVKKKKRASGTPESSGKRQLEQEPEVADETSSAKRVRLDDDGSDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.36
4 0.37
5 0.32
6 0.27
7 0.23
8 0.2
9 0.21
10 0.22
11 0.22
12 0.19
13 0.2
14 0.24
15 0.24
16 0.24
17 0.24
18 0.23
19 0.25
20 0.26
21 0.26
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.22
27 0.18
28 0.2
29 0.21
30 0.24
31 0.25
32 0.25
33 0.24
34 0.24
35 0.24
36 0.2
37 0.18
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.16
72 0.18
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.24
77 0.24
78 0.26
79 0.24
80 0.23
81 0.22
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.17
87 0.14
88 0.18
89 0.23
90 0.26
91 0.23
92 0.22
93 0.22
94 0.25
95 0.26
96 0.22
97 0.17
98 0.16
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.2
103 0.19
104 0.21
105 0.23
106 0.27
107 0.27
108 0.31
109 0.36
110 0.42
111 0.42
112 0.42
113 0.39
114 0.35
115 0.33
116 0.29
117 0.23
118 0.16
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.04
132 0.06
133 0.08
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.08
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.12
199 0.14
200 0.16
201 0.17
202 0.16
203 0.2
204 0.23
205 0.26
206 0.25
207 0.27
208 0.3
209 0.34
210 0.37
211 0.36
212 0.35
213 0.35
214 0.34
215 0.31
216 0.25
217 0.22
218 0.2
219 0.16
220 0.13
221 0.1
222 0.07
223 0.05
224 0.06
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.16
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.17
257 0.17
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.16
288 0.19
289 0.24
290 0.32
291 0.39
292 0.42
293 0.48
294 0.55
295 0.57
296 0.61
297 0.56
298 0.55
299 0.56
300 0.5
301 0.44
302 0.38
303 0.33
304 0.26
305 0.26
306 0.2
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.23
314 0.31
315 0.38
316 0.47
317 0.54
318 0.54
319 0.57
320 0.57
321 0.52
322 0.45
323 0.36
324 0.28
325 0.21
326 0.2
327 0.16
328 0.14
329 0.14
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.13
335 0.17
336 0.22
337 0.23
338 0.26
339 0.26
340 0.24
341 0.24
342 0.22
343 0.17
344 0.12
345 0.1
346 0.07
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.17
354 0.23
355 0.2
356 0.21
357 0.22
358 0.2
359 0.26
360 0.27
361 0.27
362 0.29
363 0.32
364 0.34
365 0.34
366 0.34
367 0.27
368 0.24
369 0.22
370 0.16
371 0.14
372 0.12
373 0.12
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.07
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.14
388 0.11
389 0.11
390 0.13
391 0.15
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.13
396 0.16
397 0.17
398 0.15
399 0.13
400 0.11
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.23
406 0.26
407 0.32
408 0.41
409 0.45
410 0.53
411 0.61
412 0.67
413 0.68
414 0.74
415 0.78
416 0.78
417 0.81
418 0.81
419 0.76
420 0.69
421 0.68
422 0.61
423 0.54
424 0.52
425 0.5
426 0.5
427 0.49
428 0.49
429 0.43
430 0.43
431 0.4
432 0.34
433 0.27
434 0.2
435 0.19
436 0.18
437 0.21
438 0.19
439 0.2
440 0.24
441 0.27
442 0.31
443 0.34
444 0.35