Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDW5

Protein Details
Accession C1HDW5    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MPAITAKPTKNQLKRAKRKAKKNELKPSQNSPAPKHydrophilic
144-167EEATGPKLSKKKRKEMNKLSVAELHydrophilic
608-627MIASESRKRLKKEEEKRGKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-26KNQLKRAKRKAKKNELK
151-157LSKKKRK
614-627RKRLKKEEEKRGKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007180  DUF382  
IPR006568  PSP_pro-rich  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG pbl:PAAG_08958  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04037  DUF382  
PF04046  PSP  
Amino Acid Sequences MPAITAKPTKNQLKRAKRKAKKNELKPSQNSPAPKGDTVEEVVETKDYKQNCPPSSEAPPSEAAPPERNDSGNANVDGNTNTNADTNPTDPENLYDSLDPLYEMYRDVLTKFEKLERNEDSLSKEPDKPEVYFDDDNDIPDEEEEATGPKLSKKKRKEMNKLSVAELKALVRKPETVEWTDTSASDPRLLVHIKAYRNVVPVPTHWSLKREYLSSKRGVEKPPFALPKFIQETGIAEMRDAALEKQEQATLKQKQRERVQPKMGKLDIDYQKLYEAFFRFQTKPELTRYGEVYYEGKEYETNLRHLRPGELSDELKDALNIPPGAPPPWLINQQRFGPPPSYPALKIPGLNAPPPPGAMWGYHPGGYGKPPVDEHNRPLYGGDIFGVLQTQSNVQLGEPVEKELWGELQAPEEEEEEEESEEEEGGSGDEGDEEEGRVRMGLQTPSGLETPSGMVSTIPSEFGGAESVVGASGEFDVRKHTRGTETEESPAAYHRSAYTVVPERAAAVKGFFGGDRAYDLKAAGASASTSGAAAHGNLPVLGVDDQSRKRKKPGDVDVSVDLDALQGSDGTGIDKERLKGLYEKGRREEGVGGVGSANWGFQEDLSDMIASESRKRLKKEEEKRGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.89
3 0.91
4 0.9
5 0.93
6 0.94
7 0.95
8 0.94
9 0.94
10 0.94
11 0.93
12 0.94
13 0.9
14 0.88
15 0.86
16 0.81
17 0.75
18 0.69
19 0.67
20 0.61
21 0.56
22 0.49
23 0.41
24 0.39
25 0.36
26 0.32
27 0.25
28 0.21
29 0.2
30 0.19
31 0.18
32 0.18
33 0.2
34 0.21
35 0.24
36 0.32
37 0.41
38 0.42
39 0.47
40 0.48
41 0.49
42 0.55
43 0.58
44 0.51
45 0.44
46 0.43
47 0.39
48 0.39
49 0.37
50 0.33
51 0.31
52 0.32
53 0.34
54 0.34
55 0.33
56 0.32
57 0.31
58 0.33
59 0.33
60 0.32
61 0.28
62 0.26
63 0.26
64 0.25
65 0.23
66 0.2
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.18
78 0.2
79 0.21
80 0.2
81 0.2
82 0.18
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.1
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.21
99 0.27
100 0.31
101 0.34
102 0.41
103 0.4
104 0.43
105 0.43
106 0.43
107 0.42
108 0.41
109 0.44
110 0.41
111 0.41
112 0.37
113 0.41
114 0.42
115 0.37
116 0.34
117 0.32
118 0.35
119 0.32
120 0.31
121 0.3
122 0.28
123 0.28
124 0.25
125 0.22
126 0.16
127 0.14
128 0.15
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.14
137 0.21
138 0.3
139 0.4
140 0.48
141 0.57
142 0.66
143 0.76
144 0.82
145 0.86
146 0.87
147 0.87
148 0.8
149 0.74
150 0.7
151 0.6
152 0.5
153 0.4
154 0.31
155 0.27
156 0.26
157 0.24
158 0.2
159 0.21
160 0.23
161 0.26
162 0.29
163 0.27
164 0.3
165 0.29
166 0.31
167 0.29
168 0.26
169 0.24
170 0.22
171 0.19
172 0.17
173 0.16
174 0.13
175 0.16
176 0.17
177 0.15
178 0.19
179 0.23
180 0.24
181 0.27
182 0.3
183 0.28
184 0.3
185 0.3
186 0.26
187 0.22
188 0.22
189 0.26
190 0.25
191 0.26
192 0.25
193 0.26
194 0.26
195 0.3
196 0.31
197 0.26
198 0.3
199 0.35
200 0.39
201 0.42
202 0.44
203 0.45
204 0.48
205 0.51
206 0.51
207 0.48
208 0.46
209 0.49
210 0.49
211 0.44
212 0.43
213 0.38
214 0.4
215 0.39
216 0.36
217 0.29
218 0.24
219 0.25
220 0.23
221 0.25
222 0.17
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.22
237 0.28
238 0.33
239 0.39
240 0.42
241 0.49
242 0.56
243 0.64
244 0.63
245 0.64
246 0.69
247 0.68
248 0.68
249 0.67
250 0.6
251 0.5
252 0.44
253 0.44
254 0.39
255 0.36
256 0.33
257 0.25
258 0.26
259 0.25
260 0.24
261 0.18
262 0.15
263 0.13
264 0.15
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.27
269 0.26
270 0.27
271 0.29
272 0.32
273 0.28
274 0.29
275 0.3
276 0.25
277 0.23
278 0.21
279 0.18
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.15
287 0.16
288 0.19
289 0.21
290 0.21
291 0.23
292 0.24
293 0.24
294 0.18
295 0.18
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.14
316 0.2
317 0.21
318 0.23
319 0.26
320 0.28
321 0.32
322 0.31
323 0.3
324 0.25
325 0.23
326 0.23
327 0.22
328 0.22
329 0.18
330 0.19
331 0.21
332 0.2
333 0.2
334 0.18
335 0.21
336 0.2
337 0.21
338 0.2
339 0.18
340 0.17
341 0.17
342 0.15
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.15
354 0.15
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.17
359 0.24
360 0.26
361 0.3
362 0.34
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.29
367 0.21
368 0.19
369 0.14
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.1
383 0.1
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.1
391 0.1
392 0.08
393 0.09
394 0.08
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.11
428 0.12
429 0.11
430 0.12
431 0.13
432 0.15
433 0.15
434 0.13
435 0.1
436 0.09
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.03
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.12
464 0.14
465 0.17
466 0.18
467 0.2
468 0.25
469 0.28
470 0.37
471 0.37
472 0.38
473 0.38
474 0.38
475 0.36
476 0.3
477 0.3
478 0.24
479 0.17
480 0.15
481 0.13
482 0.15
483 0.15
484 0.15
485 0.2
486 0.25
487 0.26
488 0.26
489 0.25
490 0.24
491 0.25
492 0.26
493 0.19
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.08
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.07
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.11
531 0.18
532 0.25
533 0.35
534 0.43
535 0.44
536 0.53
537 0.6
538 0.66
539 0.7
540 0.74
541 0.74
542 0.7
543 0.71
544 0.66
545 0.6
546 0.51
547 0.4
548 0.29
549 0.19
550 0.15
551 0.1
552 0.06
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.07
559 0.08
560 0.12
561 0.16
562 0.17
563 0.2
564 0.21
565 0.23
566 0.28
567 0.35
568 0.42
569 0.47
570 0.54
571 0.55
572 0.6
573 0.57
574 0.54
575 0.5
576 0.42
577 0.38
578 0.31
579 0.26
580 0.2
581 0.19
582 0.18
583 0.13
584 0.11
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.12
596 0.15
597 0.13
598 0.18
599 0.25
600 0.32
601 0.39
602 0.44
603 0.52
604 0.6
605 0.7
606 0.75
607 0.79