Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0CHA2

Protein Details
Accession X0CHA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
459-482SGFFSSRKDEEKRKKVQKKRSVHFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-478EEKRKKVQKKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046936  BIM1-like  
Amino Acid Sequences MLDENLPTYRFKTSSENPLNNILYFTHNGSDPTPEYLIKRPAPSEANGQYALGIFDSQNTSVIYAEVDVKPDWVAPTLSAAEIRAQNGNPPPKTPIIPDNFAVSLYNPDQAIPVKQQPGSWGKTGAWEFELPERSFKLPSASQIDQEDRPSLAELVPKVVFRWKRDGRLSKDMTCYMTGRNVGGKKSKEPDITVAFFRAKHDSTLTIYEPNMARVEIEDRRGLEIALLMSAETIKDLYLNPSQDPFHLQTSSNGRRRQNSRPAASSSAGPTMAGALNNNRPSSPPRAQASPQQSSNQAQREAEVEAETRRLQAMVAEEERKRLEREAQEEDERKRIQKMLETEEQERRKRDAEVEQETERLRREYGMAGQDFQSPTSPGHPSPPLPPRPQFASGALNPPNNLPQRPNSVGPTPYGAPQPNFAPPPSQAQPGPSESGKKRHGLGGLLQGPYAGPAAASVSGFFSSRKDEEKRKKVQKKRSVHF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.54
3 0.56
4 0.54
5 0.61
6 0.6
7 0.51
8 0.46
9 0.36
10 0.31
11 0.28
12 0.27
13 0.21
14 0.2
15 0.22
16 0.21
17 0.25
18 0.22
19 0.24
20 0.24
21 0.24
22 0.26
23 0.31
24 0.39
25 0.38
26 0.41
27 0.38
28 0.41
29 0.43
30 0.42
31 0.45
32 0.4
33 0.4
34 0.36
35 0.35
36 0.3
37 0.26
38 0.24
39 0.15
40 0.12
41 0.08
42 0.1
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.12
49 0.13
50 0.1
51 0.09
52 0.13
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.13
62 0.1
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.15
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.22
74 0.3
75 0.38
76 0.34
77 0.35
78 0.37
79 0.37
80 0.39
81 0.38
82 0.39
83 0.37
84 0.39
85 0.37
86 0.37
87 0.34
88 0.32
89 0.29
90 0.2
91 0.19
92 0.17
93 0.18
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.18
99 0.18
100 0.23
101 0.25
102 0.26
103 0.26
104 0.31
105 0.36
106 0.36
107 0.33
108 0.3
109 0.26
110 0.32
111 0.32
112 0.27
113 0.23
114 0.2
115 0.2
116 0.23
117 0.29
118 0.23
119 0.25
120 0.26
121 0.25
122 0.25
123 0.25
124 0.24
125 0.19
126 0.24
127 0.29
128 0.27
129 0.28
130 0.31
131 0.34
132 0.3
133 0.31
134 0.27
135 0.2
136 0.2
137 0.18
138 0.15
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.21
147 0.24
148 0.25
149 0.35
150 0.36
151 0.43
152 0.53
153 0.61
154 0.61
155 0.67
156 0.69
157 0.63
158 0.62
159 0.56
160 0.49
161 0.41
162 0.35
163 0.26
164 0.24
165 0.2
166 0.17
167 0.2
168 0.21
169 0.22
170 0.28
171 0.28
172 0.3
173 0.33
174 0.38
175 0.35
176 0.35
177 0.37
178 0.35
179 0.35
180 0.31
181 0.29
182 0.25
183 0.23
184 0.23
185 0.22
186 0.18
187 0.17
188 0.17
189 0.16
190 0.17
191 0.2
192 0.19
193 0.17
194 0.16
195 0.18
196 0.17
197 0.17
198 0.15
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.11
211 0.1
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.07
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.18
237 0.27
238 0.35
239 0.38
240 0.42
241 0.43
242 0.48
243 0.54
244 0.59
245 0.6
246 0.6
247 0.57
248 0.55
249 0.56
250 0.53
251 0.48
252 0.4
253 0.31
254 0.24
255 0.2
256 0.16
257 0.12
258 0.1
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.14
264 0.17
265 0.17
266 0.16
267 0.17
268 0.2
269 0.28
270 0.3
271 0.31
272 0.31
273 0.35
274 0.37
275 0.43
276 0.47
277 0.44
278 0.42
279 0.37
280 0.38
281 0.37
282 0.41
283 0.38
284 0.32
285 0.27
286 0.25
287 0.25
288 0.22
289 0.2
290 0.14
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.2
304 0.2
305 0.23
306 0.24
307 0.24
308 0.23
309 0.21
310 0.26
311 0.27
312 0.32
313 0.37
314 0.4
315 0.45
316 0.49
317 0.49
318 0.48
319 0.45
320 0.41
321 0.37
322 0.36
323 0.31
324 0.32
325 0.36
326 0.36
327 0.41
328 0.43
329 0.45
330 0.51
331 0.56
332 0.54
333 0.52
334 0.48
335 0.43
336 0.42
337 0.42
338 0.41
339 0.43
340 0.45
341 0.47
342 0.45
343 0.45
344 0.44
345 0.41
346 0.35
347 0.27
348 0.21
349 0.17
350 0.18
351 0.18
352 0.22
353 0.27
354 0.26
355 0.26
356 0.26
357 0.3
358 0.28
359 0.26
360 0.22
361 0.16
362 0.16
363 0.18
364 0.2
365 0.17
366 0.22
367 0.25
368 0.25
369 0.32
370 0.41
371 0.45
372 0.49
373 0.51
374 0.51
375 0.53
376 0.55
377 0.49
378 0.43
379 0.43
380 0.38
381 0.43
382 0.42
383 0.38
384 0.35
385 0.34
386 0.38
387 0.35
388 0.35
389 0.31
390 0.32
391 0.39
392 0.43
393 0.45
394 0.42
395 0.43
396 0.42
397 0.39
398 0.39
399 0.32
400 0.3
401 0.32
402 0.31
403 0.27
404 0.29
405 0.3
406 0.31
407 0.32
408 0.31
409 0.29
410 0.26
411 0.33
412 0.34
413 0.35
414 0.3
415 0.31
416 0.35
417 0.35
418 0.38
419 0.32
420 0.38
421 0.38
422 0.46
423 0.48
424 0.46
425 0.45
426 0.46
427 0.46
428 0.41
429 0.41
430 0.42
431 0.43
432 0.4
433 0.37
434 0.32
435 0.29
436 0.26
437 0.21
438 0.11
439 0.05
440 0.05
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.08
445 0.09
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.17
451 0.2
452 0.28
453 0.34
454 0.44
455 0.55
456 0.65
457 0.74
458 0.79
459 0.86
460 0.89
461 0.93
462 0.92