Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0DBT1

Protein Details
Accession X0DBT1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
312-334GEDKRKRRDYRQARKEQFKRPEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-50KKG
56-74SKATDKPAKEASPPPRKRS
315-332KRKRRDYRQARKEQFKRP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2.5, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSTSHQQTTQKMSAEDDSSDLSSLSSLSPAPSDIELDEPVQEPVAKPKKGIQKYFSKATDKPAKEASPPPRKRSPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRSRFNDAFPKSLAHFGPQELERDIVEPIPGDRAEHFLCALLGLLLNRKQDVKPGHYGRALEDAVSTHKNQWAPAWEDKSPLSGGATFASMNPTQRLTLLRYLILWTLSSSDTVKGLINQSYKQNRHEDDTNQPRSVQPWGSDGDKRRYFLIEGQDDTAFRVYRESNPAGTNRTWWSVAGTIEELKALAEKLHVKDGGPKATKLAQKMFSAVPRFEAGEDKRKRRDYRQARKEQFKRPEPGFSLYEGRTRGKKMKYTYSDDEDIFTTDSTTRRSTRNTGTHTPAETGPVTTASGRQIKAPTRLNPTTGSSAPGSVQGDTSEVDREQSVGPTGRPRRSAAVNHGTTGWAENNKGPRHNASDDSDDESEADFGDDEEDVDEHVPEESEDEDDFDEDEAMMDDDLEEKNRSLVVKLSVTPPKLRNVLGPNSQAGNKLPTPSSDKTGEEHRLRESPLVEMQDAPEATSSKEAQAAAQESPTPNTNFAERNNASPAAIHATSLAFRGSPEKTHAQPVPRPLDVGANHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.29
4 0.25
5 0.22
6 0.22
7 0.18
8 0.14
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.22
31 0.3
32 0.29
33 0.3
34 0.38
35 0.47
36 0.56
37 0.63
38 0.6
39 0.61
40 0.67
41 0.75
42 0.74
43 0.7
44 0.63
45 0.65
46 0.68
47 0.6
48 0.58
49 0.56
50 0.52
51 0.51
52 0.58
53 0.58
54 0.59
55 0.64
56 0.67
57 0.7
58 0.73
59 0.74
60 0.77
61 0.77
62 0.76
63 0.78
64 0.76
65 0.69
66 0.66
67 0.61
68 0.53
69 0.5
70 0.42
71 0.33
72 0.28
73 0.25
74 0.22
75 0.2
76 0.17
77 0.08
78 0.05
79 0.09
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.15
84 0.19
85 0.19
86 0.23
87 0.29
88 0.29
89 0.32
90 0.33
91 0.32
92 0.3
93 0.35
94 0.32
95 0.26
96 0.25
97 0.23
98 0.27
99 0.25
100 0.26
101 0.22
102 0.22
103 0.19
104 0.18
105 0.18
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.16
115 0.16
116 0.17
117 0.16
118 0.13
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.18
130 0.18
131 0.24
132 0.3
133 0.31
134 0.38
135 0.42
136 0.46
137 0.46
138 0.47
139 0.42
140 0.42
141 0.36
142 0.26
143 0.22
144 0.18
145 0.19
146 0.2
147 0.2
148 0.16
149 0.2
150 0.2
151 0.2
152 0.23
153 0.25
154 0.28
155 0.34
156 0.36
157 0.33
158 0.34
159 0.34
160 0.33
161 0.27
162 0.22
163 0.16
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.11
168 0.09
169 0.09
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.15
177 0.17
178 0.17
179 0.21
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.14
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.26
202 0.34
203 0.37
204 0.4
205 0.44
206 0.42
207 0.45
208 0.47
209 0.43
210 0.45
211 0.52
212 0.52
213 0.46
214 0.45
215 0.4
216 0.37
217 0.37
218 0.29
219 0.2
220 0.17
221 0.19
222 0.21
223 0.25
224 0.29
225 0.34
226 0.35
227 0.34
228 0.33
229 0.32
230 0.3
231 0.3
232 0.33
233 0.27
234 0.25
235 0.26
236 0.26
237 0.24
238 0.24
239 0.21
240 0.13
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.14
245 0.2
246 0.21
247 0.21
248 0.23
249 0.24
250 0.26
251 0.25
252 0.24
253 0.2
254 0.21
255 0.19
256 0.17
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.13
261 0.12
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.08
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.06
271 0.09
272 0.1
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.21
277 0.24
278 0.3
279 0.28
280 0.27
281 0.26
282 0.32
283 0.34
284 0.29
285 0.31
286 0.27
287 0.26
288 0.28
289 0.28
290 0.26
291 0.26
292 0.23
293 0.2
294 0.17
295 0.17
296 0.15
297 0.18
298 0.17
299 0.25
300 0.3
301 0.35
302 0.41
303 0.48
304 0.52
305 0.54
306 0.62
307 0.64
308 0.69
309 0.75
310 0.79
311 0.79
312 0.86
313 0.86
314 0.85
315 0.83
316 0.79
317 0.74
318 0.65
319 0.63
320 0.55
321 0.52
322 0.43
323 0.36
324 0.33
325 0.28
326 0.29
327 0.26
328 0.25
329 0.23
330 0.25
331 0.3
332 0.31
333 0.36
334 0.37
335 0.45
336 0.48
337 0.53
338 0.55
339 0.53
340 0.51
341 0.45
342 0.42
343 0.32
344 0.27
345 0.2
346 0.15
347 0.11
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.15
352 0.16
353 0.19
354 0.23
355 0.27
356 0.34
357 0.4
358 0.44
359 0.47
360 0.5
361 0.5
362 0.47
363 0.44
364 0.36
365 0.31
366 0.24
367 0.19
368 0.14
369 0.12
370 0.11
371 0.1
372 0.11
373 0.12
374 0.16
375 0.16
376 0.19
377 0.23
378 0.26
379 0.33
380 0.38
381 0.39
382 0.43
383 0.45
384 0.44
385 0.41
386 0.41
387 0.38
388 0.32
389 0.29
390 0.21
391 0.2
392 0.18
393 0.19
394 0.17
395 0.13
396 0.12
397 0.1
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.09
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.11
410 0.13
411 0.21
412 0.28
413 0.31
414 0.33
415 0.34
416 0.36
417 0.4
418 0.44
419 0.44
420 0.47
421 0.44
422 0.42
423 0.4
424 0.36
425 0.31
426 0.28
427 0.22
428 0.13
429 0.14
430 0.17
431 0.24
432 0.27
433 0.29
434 0.3
435 0.32
436 0.36
437 0.38
438 0.39
439 0.35
440 0.37
441 0.36
442 0.38
443 0.34
444 0.28
445 0.25
446 0.21
447 0.17
448 0.12
449 0.11
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.07
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.1
487 0.12
488 0.13
489 0.12
490 0.16
491 0.18
492 0.2
493 0.22
494 0.28
495 0.32
496 0.35
497 0.4
498 0.39
499 0.41
500 0.41
501 0.4
502 0.4
503 0.41
504 0.46
505 0.46
506 0.46
507 0.42
508 0.41
509 0.42
510 0.37
511 0.32
512 0.3
513 0.26
514 0.26
515 0.25
516 0.25
517 0.32
518 0.33
519 0.36
520 0.34
521 0.33
522 0.33
523 0.4
524 0.45
525 0.42
526 0.42
527 0.42
528 0.42
529 0.43
530 0.44
531 0.37
532 0.32
533 0.32
534 0.32
535 0.28
536 0.25
537 0.24
538 0.26
539 0.25
540 0.21
541 0.19
542 0.16
543 0.16
544 0.2
545 0.2
546 0.15
547 0.19
548 0.18
549 0.17
550 0.22
551 0.23
552 0.2
553 0.21
554 0.23
555 0.21
556 0.24
557 0.28
558 0.24
559 0.24
560 0.25
561 0.28
562 0.28
563 0.29
564 0.37
565 0.33
566 0.35
567 0.38
568 0.37
569 0.32
570 0.29
571 0.29
572 0.25
573 0.24
574 0.2
575 0.17
576 0.17
577 0.18
578 0.18
579 0.16
580 0.1
581 0.1
582 0.16
583 0.17
584 0.19
585 0.24
586 0.3
587 0.32
588 0.41
589 0.45
590 0.48
591 0.52
592 0.58
593 0.59
594 0.53
595 0.52
596 0.44
597 0.47