FuNGI

C1GS49

Protein Details

Accession

C1GS49

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-61	GANQFGKGPRPQRRNCEVQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
KEGG	pbl:PAAG_01344 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MSEDPDLLDAVRKVYEATNKLDDGDGLDSWITGADYERSPDGANQFGKGPRPQRRNCEVQSDGKLKAELEREFLHPSPRLSSLWLSKLQQRWEIPVDYHDLFELAPPQTRTIIRFTREGLEGRVTGYREVTVPSSSATAKNSTSLLRRPAGRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEAIAELESEVQADERRAATGGKSSGLDRIINFGVEGGLLEVPPGFSRGLKFGKAKSKDEEWDVQEVEDTLEQNEKGIDEITGEGSPTDTDKNFEMSVQLEEDLSSDEKDEDIDSLLPVEYPALEPRGQLLAPSSKRGGKEWAHVVDVNKEITNFYDLVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALASKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFEDVGILTGDVQIHPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLEHYLWADKSMLKIVDSSKNFIEKGWKKADDILSGRDKARAQKAAESQPNHNRGGYGDRGRGGGQPQRGNQRGGTQRGGAQQQRGGAQQRGRGQPASRGTGNIARTGRGGGRTTVAQDRNIWVHLVQHLRKENLLPACVFVFSKKRCEENADSLSNQDFCTAAEKSSIHMIIEKSLARLKPEDRILPQIRRVRELLSRGVGVHHGGLLPIIKEIVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGRSFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVSSGKDEAPPAGTLRRMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHQKQVQVSEATLEKIKREPCAICDIDMEACHEAAVEFSRLTTQLHVNLLSSPVGRRLFSAKRVVVFKRNGIRTVGLLVREGVAPGPNIGLQVFEFGPMKSSRHPSDILPYLPEFRHLFSPLSTEPFEMVLKTYKISLEDLECVTSTVLKIGGPTWYLNIKKEALKVAQKDLVQICCSWKTGSWNELEWDRVKELQVVEILNKRKEQVAIIEACECLRCPQFLKHFEMQHDEWQVKENISQLKQLMSNQNLQLLPDYEQRLLVLKDLGFVDEACRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENLLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTESVPLLTPRLEKGKEAIIKISEKVNDFQIKHQVILSSGDSNDFASKPRFSLVEVVYEWARGMPFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKSAAKLVGDPTLYSKMQRAQEMIKRDVIFAASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.28
3	0.27
4	0.32
5	0.36
6	0.36
7	0.37
8	0.36
9	0.31
10	0.25
11	0.24
12	0.18
13	0.14
14	0.14
15	0.12
16	0.12
17	0.12
18	0.09
19	0.06
20	0.08
21	0.1
22	0.11
23	0.14
24	0.15
25	0.16
26	0.17
27	0.21
28	0.22
29	0.26
30	0.26
31	0.25
32	0.29
33	0.32
34	0.37
35	0.41
36	0.47
37	0.5
38	0.6
39	0.67
40	0.72
41	0.76
42	0.8
43	0.77
44	0.76
45	0.72
46	0.69
47	0.7
48	0.65
49	0.59
50	0.52
51	0.49
52	0.4
53	0.4
54	0.38
55	0.31
56	0.31
57	0.31
58	0.32
59	0.36
60	0.37
61	0.38
62	0.34
63	0.35
64	0.34
65	0.34
66	0.32
67	0.3
68	0.35
69	0.35
70	0.37
71	0.41
72	0.4
73	0.44
74	0.49
75	0.51
76	0.52
77	0.48
78	0.48
79	0.48
80	0.48
81	0.43
82	0.39
83	0.4
84	0.33
85	0.31
86	0.25
87	0.2
88	0.17
89	0.17
90	0.19
91	0.14
92	0.19
93	0.2
94	0.21
95	0.25
96	0.27
97	0.28
98	0.32
99	0.37
100	0.35
101	0.37
102	0.38
103	0.39
104	0.4
105	0.4
106	0.35
107	0.32
108	0.29
109	0.28
110	0.29
111	0.26
112	0.23
113	0.22
114	0.2
115	0.16
116	0.18
117	0.18
118	0.15
119	0.15
120	0.15
121	0.16
122	0.17
123	0.19
124	0.19
125	0.21
126	0.2
127	0.22
128	0.23
129	0.24
130	0.28
131	0.31
132	0.35
133	0.37
134	0.39
135	0.4
136	0.47
137	0.47
138	0.47
139	0.44
140	0.45
141	0.43
142	0.41
143	0.4
144	0.31
145	0.28
146	0.23
147	0.21
148	0.15
149	0.11
150	0.12
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.05
162	0.05
163	0.04
164	0.03
165	0.03
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.05
171	0.07
172	0.08
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.12
177	0.13
178	0.13
179	0.18
180	0.18
181	0.18
182	0.18
183	0.18
184	0.21
185	0.23
186	0.23
187	0.17
188	0.21
189	0.19
190	0.18
191	0.18
192	0.14
193	0.12
194	0.1
195	0.1
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.06
202	0.06
203	0.08
204	0.07
205	0.08
206	0.1
207	0.16
208	0.2
209	0.25
210	0.29
211	0.34
212	0.44
213	0.49
214	0.52
215	0.51
216	0.54
217	0.52
218	0.54
219	0.54
220	0.47
221	0.46
222	0.42
223	0.36
224	0.31
225	0.27
226	0.22
227	0.17
228	0.14
229	0.1
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.07
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.11
248	0.1
249	0.12
250	0.13
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.16
255	0.14
256	0.15
257	0.14
258	0.13
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.08
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.07
281	0.09
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.13
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.16
290	0.22
291	0.23
292	0.27
293	0.28
294	0.29
295	0.3
296	0.32
297	0.36
298	0.31
299	0.36
300	0.39
301	0.39
302	0.38
303	0.39
304	0.39
305	0.35
306	0.34
307	0.29
308	0.22
309	0.2
310	0.17
311	0.16
312	0.17
313	0.13
314	0.12
315	0.14
316	0.13
317	0.14
318	0.14
319	0.14
320	0.12
321	0.16
322	0.16
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.14
327	0.14
328	0.15
329	0.14
330	0.17
331	0.18
332	0.17
333	0.17
334	0.16
335	0.17
336	0.19
337	0.18
338	0.16
339	0.15
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.09
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.09
373	0.12
374	0.14
375	0.21
376	0.22
377	0.24
378	0.25
379	0.28
380	0.28
381	0.3
382	0.37
383	0.38
384	0.46
385	0.47
386	0.51
387	0.53
388	0.54
389	0.61
390	0.52
391	0.47
392	0.45
393	0.46
394	0.39
395	0.34
396	0.33
397	0.22
398	0.21
399	0.17
400	0.1
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.11
425	0.1
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.07
440	0.06
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.07
447	0.09
448	0.09
449	0.07
450	0.07
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.03
461	0.03
462	0.04
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.04
472	0.04
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.1
483	0.1
484	0.16
485	0.21
486	0.26
487	0.29
488	0.33
489	0.37
490	0.39
491	0.44
492	0.41
493	0.41
494	0.45
495	0.52
496	0.51
497	0.5
498	0.48
499	0.45
500	0.46
501	0.4
502	0.33
503	0.31
504	0.34
505	0.32
506	0.34
507	0.35
508	0.33
509	0.32
510	0.31
511	0.24
512	0.17
513	0.15
514	0.15
515	0.11
516	0.11
517	0.12
518	0.14
519	0.21
520	0.22
521	0.23
522	0.22
523	0.24
524	0.24
525	0.23
526	0.3
527	0.27
528	0.32
529	0.37
530	0.37
531	0.35
532	0.4
533	0.42
534	0.37
535	0.35
536	0.33
537	0.3
538	0.31
539	0.31
540	0.29
541	0.28
542	0.28
543	0.32
544	0.32
545	0.29
546	0.33
547	0.39
548	0.43
549	0.48
550	0.45
551	0.46
552	0.48
553	0.51
554	0.46
555	0.41
556	0.33
557	0.28
558	0.3
559	0.29
560	0.24
561	0.22
562	0.22
563	0.22
564	0.23
565	0.23
566	0.22
567	0.21
568	0.22
569	0.25
570	0.27
571	0.35
572	0.37
573	0.36
574	0.34
575	0.37
576	0.38
577	0.38
578	0.36
579	0.29
580	0.29
581	0.32
582	0.36
583	0.3
584	0.25
585	0.23
586	0.23
587	0.23
588	0.23
589	0.22
590	0.21
591	0.22
592	0.25
593	0.3
594	0.31
595	0.31
596	0.31
597	0.29
598	0.31
599	0.32
600	0.32
601	0.25
602	0.23
603	0.23
604	0.26
605	0.26
606	0.25
607	0.21
608	0.18
609	0.18
610	0.18
611	0.18
612	0.16
613	0.16
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.14
618	0.19
619	0.19
620	0.17
621	0.17
622	0.18
623	0.18
624	0.18
625	0.16
626	0.1
627	0.1
628	0.13
629	0.19
630	0.18
631	0.22
632	0.25
633	0.25
634	0.25
635	0.25
636	0.25
637	0.21
638	0.21
639	0.16
640	0.14
641	0.14
642	0.14
643	0.13
644	0.1
645	0.16
646	0.16
647	0.22
648	0.23
649	0.26
650	0.26
651	0.33
652	0.35
653	0.36
654	0.4
655	0.35
656	0.33
657	0.32
658	0.32
659	0.26
660	0.21
661	0.14
662	0.08
663	0.07
664	0.1
665	0.09
666	0.09
667	0.1
668	0.1
669	0.11
670	0.13
671	0.13
672	0.09
673	0.12
674	0.12
675	0.11
676	0.13
677	0.12
678	0.11
679	0.14
680	0.15
681	0.14
682	0.16
683	0.16
684	0.19
685	0.22
686	0.24
687	0.22
688	0.31
689	0.34
690	0.35
691	0.41
692	0.41
693	0.39
694	0.39
695	0.38
696	0.32
697	0.32
698	0.32
699	0.27
700	0.23
701	0.22
702	0.2
703	0.19
704	0.17
705	0.13
706	0.1
707	0.07
708	0.06
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.07
728	0.07
729	0.06
730	0.06
731	0.08
732	0.08
733	0.09
734	0.08
735	0.08
736	0.08
737	0.08
738	0.07
739	0.06
740	0.07
741	0.07
742	0.07
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.07
747	0.07
748	0.08
749	0.1
750	0.12
751	0.18
752	0.2
753	0.24
754	0.25
755	0.26
756	0.29
757	0.33
758	0.35
759	0.37
760	0.39
761	0.35
762	0.4
763	0.39
764	0.35
765	0.33
766	0.28
767	0.22
768	0.18
769	0.18
770	0.12
771	0.12
772	0.11
773	0.08
774	0.09
775	0.11
776	0.11
777	0.12
778	0.12
779	0.12
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.09
784	0.09
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.06
789	0.05
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.08
799	0.09
800	0.1
801	0.11
802	0.11
803	0.12
804	0.13
805	0.11
806	0.11
807	0.17
808	0.18
809	0.21
810	0.23
811	0.25
812	0.26
813	0.28
814	0.3
815	0.26
816	0.29
817	0.32
818	0.33
819	0.37
820	0.36
821	0.38
822	0.38
823	0.37
824	0.32
825	0.25
826	0.22
827	0.15
828	0.13
829	0.09
830	0.07
831	0.06
832	0.06
833	0.06
834	0.06
835	0.07
836	0.09
837	0.11
838	0.13
839	0.14
840	0.15
841	0.15
842	0.16
843	0.18
844	0.17
845	0.2
846	0.2
847	0.21
848	0.21
849	0.2
850	0.19
851	0.18
852	0.19
853	0.17
854	0.18
855	0.19
856	0.19
857	0.21
858	0.2
859	0.21
860	0.22
861	0.2
862	0.16
863	0.16
864	0.15
865	0.15
866	0.18
867	0.16
868	0.14
869	0.18
870	0.2
871	0.2
872	0.23
873	0.23
874	0.23
875	0.3
876	0.29
877	0.25
878	0.24
879	0.23
880	0.2
881	0.19
882	0.19
883	0.11
884	0.1
885	0.09
886	0.08
887	0.07
888	0.07
889	0.08
890	0.07
891	0.06
892	0.06
893	0.07
894	0.08
895	0.09
896	0.1
897	0.11
898	0.13
899	0.15
900	0.15
901	0.15
902	0.15
903	0.15
904	0.14
905	0.13
906	0.11
907	0.15
908	0.16
909	0.15
910	0.16
911	0.22
912	0.25
913	0.3
914	0.37
915	0.33
916	0.36
917	0.42
918	0.44
919	0.46
920	0.45
921	0.46
922	0.47
923	0.48
924	0.45
925	0.42
926	0.39
927	0.32
928	0.33
929	0.28
930	0.2
931	0.18
932	0.16
933	0.15
934	0.13
935	0.13
936	0.09
937	0.08
938	0.08
939	0.07
940	0.08
941	0.07
942	0.07
943	0.07
944	0.07
945	0.06
946	0.08
947	0.08
948	0.09
949	0.09
950	0.09
951	0.12
952	0.13
953	0.15
954	0.17
955	0.24
956	0.25
957	0.28
958	0.3
959	0.28
960	0.34
961	0.37
962	0.34
963	0.3
964	0.28
965	0.29
966	0.27
967	0.3
968	0.24
969	0.21
970	0.23
971	0.23
972	0.22
973	0.19
974	0.24
975	0.21
976	0.24
977	0.23
978	0.2
979	0.18
980	0.19
981	0.19
982	0.14
983	0.14
984	0.14
985	0.14
986	0.14
987	0.14
988	0.14
989	0.15
990	0.16
991	0.16
992	0.15
993	0.17
994	0.17
995	0.17
996	0.16
997	0.15
998	0.13
999	0.12
1000	0.1
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.08
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.11
1009	0.12
1010	0.18
1011	0.2
1012	0.22
1013	0.25
1014	0.26
1015	0.28
1016	0.3
1017	0.33
1018	0.33
1019	0.38
1020	0.39
1021	0.41
1022	0.42
1023	0.39
1024	0.42
1025	0.4
1026	0.37
1027	0.31
1028	0.29
1029	0.28
1030	0.25
1031	0.27
1032	0.22
1033	0.21
1034	0.24
1035	0.27
1036	0.31
1037	0.29
1038	0.29
1039	0.3
1040	0.31
1041	0.32
1042	0.28
1043	0.26
1044	0.24
1045	0.23
1046	0.22
1047	0.23
1048	0.22
1049	0.21
1050	0.21
1051	0.19
1052	0.2
1053	0.25
1054	0.3
1055	0.29
1056	0.3
1057	0.29
1058	0.29
1059	0.3
1060	0.28
1061	0.26
1062	0.28
1063	0.27
1064	0.27
1065	0.28
1066	0.25
1067	0.24
1068	0.22
1069	0.18
1070	0.15
1071	0.14
1072	0.15
1073	0.17
1074	0.25
1075	0.34
1076	0.39
1077	0.46
1078	0.49
1079	0.52
1080	0.53
1081	0.56
1082	0.51
1083	0.48
1084	0.48
1085	0.4
1086	0.34
1087	0.34
1088	0.33
1089	0.27
1090	0.26
1091	0.24
1092	0.27
1093	0.28
1094	0.31
1095	0.27
1096	0.29
1097	0.3
1098	0.34
1099	0.37
1100	0.33
1101	0.38
1102	0.35
1103	0.4
1104	0.37
1105	0.35
1106	0.32
1107	0.26
1108	0.26
1109	0.25
1110	0.27
1111	0.22
1112	0.22
1113	0.22
1114	0.23
1115	0.22
1116	0.2
1117	0.18
1118	0.14
1119	0.17
1120	0.17
1121	0.17
1122	0.14
1123	0.14
1124	0.14
1125	0.14
1126	0.15
1127	0.13
1128	0.14
1129	0.14
1130	0.16
1131	0.21
1132	0.25
1133	0.27
1134	0.29
1135	0.35
1136	0.34
1137	0.35
1138	0.36
1139	0.34
1140	0.3
1141	0.26
1142	0.24
1143	0.17
1144	0.17
1145	0.16
1146	0.13
1147	0.11
1148	0.09
1149	0.07
1150	0.07
1151	0.07
1152	0.06
1153	0.05
1154	0.04
1155	0.04
1156	0.05
1157	0.04
1158	0.04
1159	0.05
1160	0.06
1161	0.06
1162	0.06
1163	0.06
1164	0.06
1165	0.06
1166	0.06
1167	0.06
1168	0.04
1169	0.04
1170	0.05
1171	0.05
1172	0.05
1173	0.06
1174	0.05
1175	0.08
1176	0.08
1177	0.11
1178	0.13
1179	0.14
1180	0.14
1181	0.18
1182	0.21
1183	0.23
1184	0.24
1185	0.24
1186	0.26
1187	0.33
1188	0.34
1189	0.31
1190	0.31
1191	0.36
1192	0.39
1193	0.39
1194	0.39
1195	0.36
1196	0.38
1197	0.38
1198	0.41
1199	0.36
1200	0.33
1201	0.33
1202	0.36
1203	0.39
1204	0.38
1205	0.42
1206	0.47
1207	0.44
1208	0.42
1209	0.42
1210	0.35
1211	0.29
1212	0.31
1213	0.28
1214	0.21
1215	0.2
1216	0.2
1217	0.19
1218	0.19
1219	0.21
1220	0.17
1221	0.18
1222	0.19
1223	0.21
1224	0.21
1225	0.23
1226	0.22
1227	0.21
1228	0.29
1229	0.27
1230	0.29
1231	0.28
1232	0.3
1233	0.27
1234	0.27
1235	0.25
1236	0.18
1237	0.17
1238	0.12
1239	0.14
1240	0.19
1241	0.24
1242	0.26
1243	0.29
1244	0.29
1245	0.32
1246	0.33
1247	0.34
1248	0.27
1249	0.23
1250	0.2
1251	0.17
1252	0.17
1253	0.15
1254	0.12
1255	0.12
1256	0.1
1257	0.09
1258	0.1
1259	0.1
1260	0.11
1261	0.16
1262	0.17
1263	0.19
1264	0.24
1265	0.29
1266	0.34
1267	0.35
1268	0.35
1269	0.31
1270	0.34
1271	0.37
1272	0.4
1273	0.38
1274	0.35
1275	0.35
1276	0.34
1277	0.39
1278	0.35
1279	0.28
1280	0.25
1281	0.28
1282	0.26
1283	0.26
1284	0.3
1285	0.32
1286	0.36
1287	0.39
1288	0.39
1289	0.42
1290	0.48
1291	0.54
1292	0.53
1293	0.53
1294	0.49
1295	0.46
1296	0.43
1297	0.35
1298	0.29

C1GS49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer