Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GPI2

Protein Details
Accession C1GPI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-50GVRTTKIYCRPRCPARLARRANVEFHydrophilic
55-77KQAEKAGYRPCKRCKPEDLCAPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 9.5, extr 5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035451  Ada-like_dom_sf  
IPR004026  Ada_DNA_repair_Zn-bd  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR018060  HTH_AraC  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0032259  P:methylation  
KEGG pbl:PAAG_00427  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02805  Ada_Zn_binding  
PF00165  HTH_AraC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01124  HTH_ARAC_FAMILY_2  
Amino Acid Sequences MPISTSSTRWRAIVNRDATANDFVYGVRTTKIYCRPRCPARLARRANVEFYDTPKQAEKAGYRPCKRCKPEDLCAPPDPHIKLALRACLTMTRAALGGNGMAQGAQARGQAQGQAQGQGQAQAQGQAQGQAQGRRRMQRPTLQDLANEAGLTPSHFHRVFKKVVGITPGRFAREVMDGKKMGGYLKRLEEGISASGGGYAGYGGGAGAKGAKGVRGGDDGDGNGKGEGVAVRETSSADVVAEGLVVDGLSPATDSQSLTAPLSDAGGIRIDWNEFDRMLVGGAGAGAGAGAGGDAGRNNNLSNSRHHLPGPLPHHNHNRGFSIANDTNTNLSPAQPQQQSNTYPPQSTTTTVTSTTTTPPDILTNRTLLDHYELPWDSPTCTLTFPSTPLHHTNNTTSGYSSGSLSPYDPYAPLLDTAAAANTDFYKFFDSNISNATNTATTTSTGKQQQQQQQLELELELELDLLPLTAAESETMTPVDTPPFIVDGLVVGVGGLGGGGGGALGGCFSGTSSSVPSTNASPLLFEEVDWYGSPSIFETYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.46
3 0.46
4 0.46
5 0.45
6 0.41
7 0.34
8 0.25
9 0.2
10 0.17
11 0.18
12 0.18
13 0.16
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.23
18 0.33
19 0.41
20 0.48
21 0.55
22 0.64
23 0.73
24 0.78
25 0.8
26 0.8
27 0.81
28 0.83
29 0.82
30 0.8
31 0.81
32 0.76
33 0.71
34 0.62
35 0.58
36 0.49
37 0.47
38 0.48
39 0.39
40 0.38
41 0.38
42 0.37
43 0.33
44 0.38
45 0.36
46 0.36
47 0.46
48 0.54
49 0.58
50 0.67
51 0.73
52 0.77
53 0.8
54 0.8
55 0.8
56 0.78
57 0.79
58 0.81
59 0.79
60 0.75
61 0.74
62 0.68
63 0.61
64 0.6
65 0.52
66 0.42
67 0.4
68 0.34
69 0.36
70 0.37
71 0.39
72 0.34
73 0.32
74 0.32
75 0.29
76 0.3
77 0.26
78 0.23
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.11
84 0.1
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.18
100 0.17
101 0.19
102 0.19
103 0.21
104 0.2
105 0.21
106 0.2
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.19
116 0.22
117 0.26
118 0.31
119 0.36
120 0.41
121 0.46
122 0.5
123 0.52
124 0.55
125 0.57
126 0.58
127 0.58
128 0.59
129 0.52
130 0.49
131 0.44
132 0.4
133 0.32
134 0.25
135 0.17
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.15
142 0.16
143 0.18
144 0.23
145 0.29
146 0.31
147 0.32
148 0.37
149 0.32
150 0.34
151 0.38
152 0.36
153 0.31
154 0.35
155 0.34
156 0.29
157 0.27
158 0.25
159 0.21
160 0.24
161 0.27
162 0.22
163 0.26
164 0.25
165 0.25
166 0.26
167 0.24
168 0.2
169 0.2
170 0.21
171 0.2
172 0.22
173 0.23
174 0.22
175 0.22
176 0.2
177 0.18
178 0.15
179 0.11
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.01
275 0.01
276 0.01
277 0.01
278 0.01
279 0.01
280 0.02
281 0.02
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.07
287 0.11
288 0.13
289 0.16
290 0.22
291 0.24
292 0.25
293 0.25
294 0.26
295 0.23
296 0.3
297 0.33
298 0.35
299 0.37
300 0.41
301 0.5
302 0.53
303 0.55
304 0.5
305 0.45
306 0.38
307 0.35
308 0.29
309 0.3
310 0.26
311 0.23
312 0.22
313 0.21
314 0.2
315 0.2
316 0.21
317 0.12
318 0.11
319 0.12
320 0.14
321 0.2
322 0.22
323 0.23
324 0.24
325 0.29
326 0.32
327 0.33
328 0.38
329 0.33
330 0.3
331 0.3
332 0.31
333 0.28
334 0.27
335 0.27
336 0.21
337 0.21
338 0.21
339 0.21
340 0.19
341 0.18
342 0.19
343 0.17
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.18
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.15
356 0.17
357 0.15
358 0.14
359 0.18
360 0.18
361 0.18
362 0.2
363 0.19
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.15
373 0.19
374 0.2
375 0.23
376 0.27
377 0.3
378 0.31
379 0.33
380 0.34
381 0.34
382 0.35
383 0.31
384 0.27
385 0.23
386 0.21
387 0.19
388 0.17
389 0.14
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.13
414 0.13
415 0.14
416 0.2
417 0.21
418 0.21
419 0.24
420 0.25
421 0.2
422 0.21
423 0.21
424 0.15
425 0.14
426 0.15
427 0.12
428 0.11
429 0.14
430 0.15
431 0.2
432 0.26
433 0.31
434 0.36
435 0.44
436 0.52
437 0.59
438 0.61
439 0.58
440 0.54
441 0.5
442 0.44
443 0.35
444 0.27
445 0.17
446 0.13
447 0.1
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.05
459 0.06
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.1
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.1
474 0.08
475 0.09
476 0.07
477 0.06
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.02
484 0.02
485 0.02
486 0.02
487 0.01
488 0.02
489 0.02
490 0.02
491 0.02
492 0.02
493 0.02
494 0.02
495 0.03
496 0.05
497 0.06
498 0.07
499 0.1
500 0.13
501 0.14
502 0.15
503 0.17
504 0.18
505 0.2
506 0.22
507 0.19
508 0.18
509 0.19
510 0.24
511 0.22
512 0.19
513 0.19
514 0.18
515 0.2
516 0.19
517 0.2
518 0.15
519 0.15
520 0.15
521 0.13