Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GNJ3

Protein Details
Accession C1GNJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-34SLAFLPRKRSARHRGKVKSFPKDDPKKPVHBasic
103-132SDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYAKNHSENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-31RKRSARHRGKVKSFPKDDPKK
229-237KKLPRKTHK
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 13.833, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045077  L3_arc_euk  
IPR000597  Ribosomal_L3  
IPR019926  Ribosomal_L3_CS  
IPR044892  Ribosomal_L3_dom_3_arc_sf  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG pbl:PAAG_00088  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00297  Ribosomal_L3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00474  RIBOSOMAL_L3  
Amino Acid Sequences MFIGSLAFLPRKRSARHRGKVKSFPKDDPKKPVHLTAAMGYKAGMTTVVRDLERPGAKMHKKEIVEAVTIVETPPMIAVGVVGYIETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYAKNHSENTGASVSRELERIKKYCTVVRLLAHTQIRKTPLKQKKAHLMEVQVNGGSIADKVDFAHGLFEKPIQIDSVFEQDEMIDVIAVTKGHGFNGVTSRWGTKKLPRKTHKGLRKVACIGAWHPSHVQWTVARAGQDGYHHRTSCNHKIYRIGKGSDEGNASTEFDVSKKQITPMGGFVRYGEVKNDYVMLKGSVPGVKKRVLTLRKTLYPQVSRKALEKVELKWIDTSSKFGHGAFQTPAEKRAFMGTLKKDLVTAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.66
3 0.75
4 0.8
5 0.83
6 0.86
7 0.9
8 0.9
9 0.9
10 0.85
11 0.84
12 0.85
13 0.84
14 0.82
15 0.82
16 0.78
17 0.77
18 0.74
19 0.72
20 0.66
21 0.59
22 0.54
23 0.49
24 0.49
25 0.4
26 0.36
27 0.29
28 0.23
29 0.2
30 0.17
31 0.13
32 0.07
33 0.09
34 0.13
35 0.16
36 0.16
37 0.17
38 0.19
39 0.26
40 0.28
41 0.27
42 0.27
43 0.34
44 0.4
45 0.45
46 0.48
47 0.47
48 0.46
49 0.48
50 0.5
51 0.43
52 0.38
53 0.33
54 0.29
55 0.22
56 0.22
57 0.18
58 0.12
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.1
80 0.12
81 0.15
82 0.18
83 0.17
84 0.18
85 0.2
86 0.2
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.14
91 0.2
92 0.22
93 0.26
94 0.29
95 0.31
96 0.34
97 0.43
98 0.52
99 0.55
100 0.63
101 0.68
102 0.75
103 0.81
104 0.87
105 0.87
106 0.86
107 0.86
108 0.85
109 0.85
110 0.86
111 0.87
112 0.87
113 0.86
114 0.79
115 0.72
116 0.66
117 0.61
118 0.5
119 0.44
120 0.36
121 0.27
122 0.24
123 0.22
124 0.2
125 0.15
126 0.17
127 0.15
128 0.18
129 0.23
130 0.25
131 0.27
132 0.3
133 0.32
134 0.33
135 0.35
136 0.33
137 0.31
138 0.31
139 0.32
140 0.28
141 0.32
142 0.33
143 0.31
144 0.28
145 0.28
146 0.32
147 0.3
148 0.33
149 0.38
150 0.43
151 0.51
152 0.56
153 0.58
154 0.63
155 0.65
156 0.67
157 0.59
158 0.54
159 0.5
160 0.46
161 0.41
162 0.3
163 0.24
164 0.19
165 0.16
166 0.11
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.14
212 0.14
213 0.18
214 0.19
215 0.24
216 0.34
217 0.42
218 0.52
219 0.56
220 0.65
221 0.71
222 0.78
223 0.79
224 0.79
225 0.79
226 0.74
227 0.74
228 0.68
229 0.6
230 0.51
231 0.44
232 0.35
233 0.33
234 0.27
235 0.22
236 0.2
237 0.19
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.13
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.18
250 0.21
251 0.24
252 0.28
253 0.28
254 0.29
255 0.34
256 0.41
257 0.47
258 0.51
259 0.48
260 0.44
261 0.53
262 0.56
263 0.59
264 0.57
265 0.49
266 0.41
267 0.4
268 0.4
269 0.34
270 0.32
271 0.23
272 0.18
273 0.17
274 0.17
275 0.14
276 0.14
277 0.11
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.15
283 0.17
284 0.2
285 0.22
286 0.23
287 0.27
288 0.31
289 0.28
290 0.27
291 0.26
292 0.27
293 0.27
294 0.25
295 0.21
296 0.19
297 0.19
298 0.19
299 0.22
300 0.17
301 0.16
302 0.17
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.15
307 0.16
308 0.19
309 0.23
310 0.26
311 0.29
312 0.3
313 0.34
314 0.41
315 0.46
316 0.49
317 0.53
318 0.57
319 0.6
320 0.63
321 0.65
322 0.64
323 0.65
324 0.65
325 0.64
326 0.62
327 0.57
328 0.57
329 0.57
330 0.5
331 0.48
332 0.47
333 0.41
334 0.45
335 0.45
336 0.43
337 0.39
338 0.38
339 0.37
340 0.33
341 0.36
342 0.28
343 0.31
344 0.31
345 0.28
346 0.33
347 0.28
348 0.32
349 0.29
350 0.32
351 0.33
352 0.34
353 0.39
354 0.34
355 0.33
356 0.3
357 0.33
358 0.29
359 0.27
360 0.35
361 0.35
362 0.41
363 0.42
364 0.41