Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDC6

Protein Details
Accession C1HDC6    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-95HLDPQTPRAKRVKKAKEDIASEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-57RGGSRGSSRSRTRGKGHVFRGR
370-409GRSRGRGGFRGRVRGRGGWTRGRGRGGRGRGSGRGGRGGR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
KEGG pbl:PAAG_08767  -  
Amino Acid Sequences MTGLKRKLDQQHELASASGADSSQTSPFSPSTGRSRGGSRGSSRSRTRGKGHVFRGRSKSLNGSNLDSLSVQTHLDPQTPRAKRVKKAKEDIASESSVAELHIPRPTRQSARILSKFHHMDCVSEQADEPGIQQTNFNGPHEIHIGSYETEVNDKEASLKFPCVNTKQPTSDSQLSSFKSTWADPSRRRRSSGYKTEVDTCPDTVSKLNKSVGVNAESGDNTPEIALAATSGLVSKRLSPVATRKRNSAGIGATIEETQNPNPSTKKLKVEKLDPSSGTDSPPLGGNGNRGNSNHGDSDSDGRPIHSEAEPTRQDPNLSILDADFPSQTMVVESFQAAHETTPTEASASRAPTPSETPELPATNLPSGAGRSRGRGGFRGRVRGRGGWTRGRGRGGRGRGSGRGGRGGRLQAIDRDMSLSPSPVIKQLRERQKELDRVFRRVASAQRTALTVIANRSEAKLLKDAKAHMAVPEYDQVMNDLKAMLQKRLEVIENEYNWRTKTADALFEANKERVNASFHDKSRHIREEHLLAAQGSYMAFVEQCRQAEDDDHTEADESGPEPEMPPRRLFVRGFNSSFVRDPKGAALYERAAYGWDDFIQRAKIETDISPQIKEIDQESRAPVPASDKILQLTEALTELCQQEERRGDEGKPVATIPNEPPTALSALADIAVGDIGQKLVEQPTMHGPPQGLQLAPFRSLPSITQQLPALPHHPPHLPHPYEQQLPIEQPRGFHRTILPQPVLGQMIPPTDPRSFLPPPSHHQPPPPSPQRGPPSIPRRLLPASSRYPSIPHLHELPDPFSSAPPHLPAPHAMVYHPGSYPLHPPLPSPFHPPTHAPPPHPPQYMHGPVGHMTLPPVYHPATYGHLPPPLPPLPLPPPPGSQYQHQHQHQHQNQLHQPQPPPLPQHRHSYYQQQHQHAPTPPPPYRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.4
3 0.32
4 0.24
5 0.18
6 0.1
7 0.08
8 0.08
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.16
14 0.17
15 0.19
16 0.2
17 0.23
18 0.3
19 0.34
20 0.36
21 0.35
22 0.39
23 0.44
24 0.48
25 0.5
26 0.48
27 0.52
28 0.57
29 0.63
30 0.66
31 0.68
32 0.7
33 0.71
34 0.71
35 0.71
36 0.73
37 0.74
38 0.77
39 0.77
40 0.74
41 0.76
42 0.78
43 0.75
44 0.68
45 0.62
46 0.62
47 0.59
48 0.61
49 0.55
50 0.52
51 0.48
52 0.45
53 0.42
54 0.33
55 0.27
56 0.21
57 0.18
58 0.14
59 0.12
60 0.17
61 0.18
62 0.23
63 0.23
64 0.27
65 0.37
66 0.4
67 0.46
68 0.51
69 0.57
70 0.61
71 0.7
72 0.75
73 0.76
74 0.82
75 0.84
76 0.82
77 0.79
78 0.76
79 0.7
80 0.6
81 0.5
82 0.4
83 0.31
84 0.23
85 0.18
86 0.15
87 0.11
88 0.12
89 0.17
90 0.2
91 0.21
92 0.27
93 0.34
94 0.37
95 0.41
96 0.47
97 0.5
98 0.58
99 0.64
100 0.61
101 0.56
102 0.6
103 0.59
104 0.51
105 0.51
106 0.41
107 0.37
108 0.36
109 0.41
110 0.32
111 0.28
112 0.28
113 0.2
114 0.22
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.23
123 0.25
124 0.25
125 0.22
126 0.21
127 0.24
128 0.26
129 0.25
130 0.17
131 0.16
132 0.17
133 0.15
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.15
143 0.15
144 0.18
145 0.18
146 0.22
147 0.22
148 0.25
149 0.33
150 0.34
151 0.41
152 0.44
153 0.48
154 0.48
155 0.49
156 0.5
157 0.51
158 0.53
159 0.47
160 0.45
161 0.45
162 0.42
163 0.43
164 0.39
165 0.33
166 0.28
167 0.27
168 0.31
169 0.33
170 0.4
171 0.45
172 0.56
173 0.65
174 0.66
175 0.7
176 0.68
177 0.7
178 0.72
179 0.74
180 0.7
181 0.65
182 0.64
183 0.66
184 0.61
185 0.56
186 0.47
187 0.37
188 0.32
189 0.27
190 0.25
191 0.23
192 0.26
193 0.25
194 0.28
195 0.29
196 0.31
197 0.32
198 0.35
199 0.35
200 0.33
201 0.29
202 0.25
203 0.25
204 0.2
205 0.2
206 0.16
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.09
223 0.11
224 0.13
225 0.14
226 0.17
227 0.28
228 0.38
229 0.47
230 0.47
231 0.49
232 0.52
233 0.55
234 0.52
235 0.46
236 0.37
237 0.3
238 0.28
239 0.25
240 0.21
241 0.17
242 0.16
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.16
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.24
251 0.3
252 0.34
253 0.42
254 0.44
255 0.51
256 0.54
257 0.6
258 0.65
259 0.64
260 0.63
261 0.54
262 0.52
263 0.48
264 0.42
265 0.37
266 0.29
267 0.22
268 0.18
269 0.18
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.17
275 0.19
276 0.2
277 0.2
278 0.22
279 0.23
280 0.25
281 0.22
282 0.19
283 0.18
284 0.17
285 0.22
286 0.19
287 0.2
288 0.18
289 0.17
290 0.17
291 0.17
292 0.19
293 0.14
294 0.17
295 0.15
296 0.23
297 0.25
298 0.25
299 0.27
300 0.25
301 0.25
302 0.22
303 0.25
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.12
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.17
340 0.19
341 0.2
342 0.21
343 0.19
344 0.19
345 0.21
346 0.21
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.15
351 0.15
352 0.12
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.15
357 0.14
358 0.16
359 0.19
360 0.21
361 0.23
362 0.27
363 0.3
364 0.33
365 0.36
366 0.44
367 0.42
368 0.45
369 0.46
370 0.44
371 0.43
372 0.42
373 0.44
374 0.4
375 0.45
376 0.45
377 0.45
378 0.46
379 0.43
380 0.41
381 0.43
382 0.41
383 0.41
384 0.39
385 0.39
386 0.36
387 0.39
388 0.36
389 0.3
390 0.32
391 0.28
392 0.26
393 0.26
394 0.24
395 0.22
396 0.2
397 0.2
398 0.15
399 0.16
400 0.15
401 0.12
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.1
410 0.13
411 0.15
412 0.15
413 0.22
414 0.3
415 0.4
416 0.43
417 0.45
418 0.47
419 0.52
420 0.59
421 0.54
422 0.56
423 0.49
424 0.49
425 0.48
426 0.43
427 0.37
428 0.32
429 0.34
430 0.29
431 0.29
432 0.25
433 0.24
434 0.24
435 0.23
436 0.2
437 0.16
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.16
448 0.17
449 0.19
450 0.21
451 0.21
452 0.22
453 0.23
454 0.21
455 0.17
456 0.16
457 0.14
458 0.13
459 0.14
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.07
468 0.06
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.14
476 0.15
477 0.12
478 0.16
479 0.19
480 0.19
481 0.22
482 0.22
483 0.21
484 0.2
485 0.21
486 0.16
487 0.12
488 0.16
489 0.15
490 0.17
491 0.17
492 0.2
493 0.19
494 0.21
495 0.23
496 0.18
497 0.17
498 0.15
499 0.14
500 0.12
501 0.14
502 0.14
503 0.19
504 0.25
505 0.25
506 0.3
507 0.32
508 0.35
509 0.4
510 0.45
511 0.39
512 0.35
513 0.36
514 0.35
515 0.34
516 0.3
517 0.23
518 0.17
519 0.16
520 0.12
521 0.1
522 0.06
523 0.05
524 0.04
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.07
529 0.09
530 0.09
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.16
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.12
543 0.09
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.12
550 0.17
551 0.19
552 0.2
553 0.21
554 0.22
555 0.26
556 0.27
557 0.3
558 0.32
559 0.36
560 0.36
561 0.38
562 0.37
563 0.35
564 0.36
565 0.31
566 0.26
567 0.2
568 0.2
569 0.19
570 0.2
571 0.18
572 0.17
573 0.17
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.13
578 0.11
579 0.11
580 0.11
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.11
590 0.11
591 0.12
592 0.13
593 0.15
594 0.21
595 0.22
596 0.21
597 0.21
598 0.21
599 0.2
600 0.2
601 0.18
602 0.16
603 0.17
604 0.18
605 0.2
606 0.2
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.17
611 0.18
612 0.22
613 0.21
614 0.2
615 0.2
616 0.21
617 0.2
618 0.17
619 0.14
620 0.09
621 0.08
622 0.07
623 0.06
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.1
628 0.1
629 0.15
630 0.19
631 0.23
632 0.23
633 0.26
634 0.26
635 0.29
636 0.32
637 0.28
638 0.24
639 0.21
640 0.2
641 0.19
642 0.21
643 0.18
644 0.22
645 0.21
646 0.2
647 0.2
648 0.2
649 0.2
650 0.17
651 0.14
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.07
656 0.05
657 0.04
658 0.04
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.03
665 0.04
666 0.06
667 0.09
668 0.08
669 0.1
670 0.17
671 0.21
672 0.22
673 0.22
674 0.21
675 0.2
676 0.25
677 0.25
678 0.18
679 0.16
680 0.2
681 0.21
682 0.22
683 0.21
684 0.17
685 0.17
686 0.18
687 0.17
688 0.18
689 0.22
690 0.22
691 0.23
692 0.23
693 0.24
694 0.26
695 0.27
696 0.23
697 0.2
698 0.21
699 0.22
700 0.25
701 0.24
702 0.29
703 0.37
704 0.37
705 0.37
706 0.42
707 0.45
708 0.45
709 0.45
710 0.41
711 0.34
712 0.35
713 0.37
714 0.35
715 0.3
716 0.29
717 0.33
718 0.35
719 0.33
720 0.31
721 0.31
722 0.34
723 0.4
724 0.46
725 0.41
726 0.36
727 0.36
728 0.37
729 0.34
730 0.25
731 0.2
732 0.14
733 0.15
734 0.15
735 0.16
736 0.17
737 0.16
738 0.18
739 0.19
740 0.25
741 0.26
742 0.3
743 0.37
744 0.38
745 0.44
746 0.5
747 0.56
748 0.51
749 0.56
750 0.59
751 0.58
752 0.64
753 0.66
754 0.66
755 0.61
756 0.68
757 0.67
758 0.65
759 0.63
760 0.62
761 0.62
762 0.64
763 0.65
764 0.56
765 0.56
766 0.53
767 0.52
768 0.47
769 0.46
770 0.45
771 0.44
772 0.46
773 0.4
774 0.39
775 0.39
776 0.4
777 0.35
778 0.31
779 0.32
780 0.33
781 0.36
782 0.36
783 0.34
784 0.29
785 0.28
786 0.24
787 0.23
788 0.22
789 0.21
790 0.21
791 0.21
792 0.23
793 0.23
794 0.24
795 0.25
796 0.27
797 0.29
798 0.27
799 0.24
800 0.27
801 0.28
802 0.28
803 0.25
804 0.23
805 0.21
806 0.22
807 0.27
808 0.27
809 0.29
810 0.27
811 0.28
812 0.33
813 0.39
814 0.4
815 0.43
816 0.43
817 0.42
818 0.46
819 0.49
820 0.48
821 0.51
822 0.54
823 0.51
824 0.56
825 0.6
826 0.65
827 0.65
828 0.59
829 0.53
830 0.58
831 0.59
832 0.53
833 0.46
834 0.39
835 0.36
836 0.37
837 0.33
838 0.23
839 0.18
840 0.17
841 0.15
842 0.14
843 0.17
844 0.16
845 0.15
846 0.16
847 0.18
848 0.2
849 0.22
850 0.25
851 0.25
852 0.28
853 0.28
854 0.29
855 0.34
856 0.32
857 0.32
858 0.28
859 0.32
860 0.35
861 0.41
862 0.45
863 0.41
864 0.43
865 0.43
866 0.5
867 0.47
868 0.48
869 0.5
870 0.54
871 0.6
872 0.62
873 0.68
874 0.68
875 0.76
876 0.74
877 0.77
878 0.72
879 0.71
880 0.72
881 0.73
882 0.69
883 0.65
884 0.62
885 0.59
886 0.62
887 0.59
888 0.6
889 0.6
890 0.65
891 0.62
892 0.68
893 0.66
894 0.66
895 0.64
896 0.67
897 0.66
898 0.67
899 0.72
900 0.69
901 0.71
902 0.69
903 0.72
904 0.68
905 0.67
906 0.63
907 0.64