Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0D073

Protein Details
Accession X0D073    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28LCFKGSKGYKVVPKKKKVKAATSTSTSHydrophilic
72-94PPYSNSRPSPSRRHNPEQGPPIQHydrophilic
396-470VQDQRERERERERQKSQRERERERERQKYQERQRELEREKQERQRVRVRERQKNQERQRELERERQQRQRALREKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-18PKKKK
381-488RRFVAKEKAKIKRQEVQDQRERERERERQKSQRERERERERQKYQERQRELEREKQERQRVRVRERQKNQERQRELERERQQRQRALREKASAQKAADERRQIAARRK
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8, cyto_nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MLCFKGSKGYKVVPKKKKVKAATSTSTSTNQTSAPRTRNGTGTGTGTAAVTQPTNRVAAKSTRPSPDRSRNPPYSNSRPSPSRRHNPEQGPPIQPPRQQSKVARTNNMASQNGIFYGRVDSAITSGFGDDESATAVQNPTSKSQGSSSSNTAQSQAHDRIPSHERPIINTAAAAAASSSSSSSASPYVDLPESLDSDATTTRAIYRRECIVCSDIKATDSFPDFVTSKCTHTPSICLDCMERSIQVGMKSKRWTDIRCDECQENLEYNDIQRFADEQTIAKYERQALRAAVEEDENFFWCTSDCGSGQIHDSGSAQPIVVCIKCSHRSCFRHGVNWHEDLSCEEYDRLQEDPDFRGHLELENERWSKAQAAQEEADRGLARRFVAKEKAKIKRQEVQDQRERERERERQKSQRERERERERQKYQERQRELEREKQERQRVRVRERQKNQERQRELERERQQRQRALREKASAQKAADERRQIAARRKIEEAKSIATLRATTKPCGGCGWAIEKNSGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.83
3 0.86
4 0.88
5 0.88
6 0.87
7 0.86
8 0.85
9 0.83
10 0.78
11 0.73
12 0.66
13 0.61
14 0.54
15 0.45
16 0.37
17 0.32
18 0.31
19 0.35
20 0.4
21 0.41
22 0.44
23 0.48
24 0.49
25 0.5
26 0.49
27 0.46
28 0.41
29 0.38
30 0.33
31 0.28
32 0.25
33 0.21
34 0.17
35 0.14
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.13
40 0.14
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.21
45 0.27
46 0.35
47 0.41
48 0.47
49 0.52
50 0.55
51 0.6
52 0.66
53 0.7
54 0.71
55 0.71
56 0.74
57 0.75
58 0.77
59 0.79
60 0.78
61 0.77
62 0.77
63 0.73
64 0.7
65 0.69
66 0.71
67 0.73
68 0.74
69 0.74
70 0.74
71 0.78
72 0.81
73 0.8
74 0.82
75 0.8
76 0.76
77 0.7
78 0.66
79 0.66
80 0.63
81 0.58
82 0.56
83 0.56
84 0.55
85 0.57
86 0.59
87 0.61
88 0.64
89 0.68
90 0.67
91 0.62
92 0.61
93 0.6
94 0.6
95 0.5
96 0.41
97 0.35
98 0.3
99 0.27
100 0.23
101 0.17
102 0.11
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.17
128 0.17
129 0.18
130 0.2
131 0.26
132 0.28
133 0.29
134 0.32
135 0.34
136 0.36
137 0.35
138 0.35
139 0.28
140 0.25
141 0.28
142 0.27
143 0.25
144 0.25
145 0.25
146 0.28
147 0.33
148 0.35
149 0.33
150 0.34
151 0.31
152 0.32
153 0.35
154 0.32
155 0.26
156 0.22
157 0.18
158 0.14
159 0.13
160 0.1
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.1
189 0.15
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.26
194 0.28
195 0.28
196 0.27
197 0.25
198 0.24
199 0.24
200 0.24
201 0.17
202 0.16
203 0.16
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.19
213 0.17
214 0.18
215 0.2
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.24
220 0.23
221 0.27
222 0.25
223 0.22
224 0.21
225 0.2
226 0.21
227 0.18
228 0.13
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.13
233 0.21
234 0.21
235 0.25
236 0.28
237 0.28
238 0.33
239 0.35
240 0.33
241 0.33
242 0.4
243 0.41
244 0.41
245 0.43
246 0.38
247 0.35
248 0.34
249 0.28
250 0.2
251 0.16
252 0.15
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.17
270 0.2
271 0.21
272 0.21
273 0.19
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.15
278 0.13
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.15
310 0.22
311 0.25
312 0.29
313 0.37
314 0.41
315 0.46
316 0.55
317 0.52
318 0.53
319 0.52
320 0.55
321 0.5
322 0.49
323 0.44
324 0.34
325 0.32
326 0.26
327 0.27
328 0.19
329 0.16
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.15
334 0.13
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.16
343 0.15
344 0.15
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.24
349 0.24
350 0.23
351 0.23
352 0.22
353 0.21
354 0.24
355 0.26
356 0.21
357 0.24
358 0.25
359 0.27
360 0.27
361 0.25
362 0.22
363 0.18
364 0.16
365 0.13
366 0.14
367 0.13
368 0.16
369 0.18
370 0.22
371 0.31
372 0.37
373 0.44
374 0.51
375 0.6
376 0.64
377 0.7
378 0.7
379 0.69
380 0.7
381 0.72
382 0.72
383 0.73
384 0.73
385 0.72
386 0.71
387 0.73
388 0.68
389 0.64
390 0.64
391 0.64
392 0.66
393 0.69
394 0.72
395 0.73
396 0.81
397 0.86
398 0.87
399 0.88
400 0.88
401 0.86
402 0.88
403 0.89
404 0.89
405 0.88
406 0.89
407 0.85
408 0.85
409 0.86
410 0.86
411 0.86
412 0.85
413 0.82
414 0.77
415 0.79
416 0.79
417 0.75
418 0.74
419 0.72
420 0.7
421 0.72
422 0.75
423 0.76
424 0.74
425 0.76
426 0.76
427 0.77
428 0.78
429 0.79
430 0.8
431 0.81
432 0.82
433 0.86
434 0.87
435 0.88
436 0.89
437 0.91
438 0.86
439 0.81
440 0.82
441 0.81
442 0.76
443 0.75
444 0.75
445 0.74
446 0.77
447 0.8
448 0.78
449 0.76
450 0.8
451 0.8
452 0.8
453 0.78
454 0.77
455 0.74
456 0.73
457 0.74
458 0.73
459 0.67
460 0.58
461 0.56
462 0.55
463 0.57
464 0.57
465 0.53
466 0.49
467 0.51
468 0.56
469 0.55
470 0.59
471 0.6
472 0.6
473 0.58
474 0.62
475 0.63
476 0.61
477 0.63
478 0.57
479 0.5
480 0.49
481 0.47
482 0.42
483 0.35
484 0.34
485 0.3
486 0.34
487 0.34
488 0.31
489 0.37
490 0.37
491 0.37
492 0.38
493 0.36
494 0.3
495 0.31
496 0.35
497 0.33
498 0.33