Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GNM3

Protein Details
Accession C1GNM3    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-93REETESQAPKRKKKSRASEVISSAHydrophilic
216-236QSKQRTKALHKEKRRERDQQLBasic
318-339SATRMPKKYKFLDKVEKRPRDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-85APKRKKKSR
206-232KLKEAARKEAQSKQRTKALHKEKRRER
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbl:PAAG_00118  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
Amino Acid Sequences MLSHIVTAARGIFTRHDPGAEPAISPSPNPTDMVSATRHTALHSTTATTPVEALYSSPATNGKRKSASAREETESQAPKRKKKSRASEVISSATIEVVDDDVETSVKNLPYRTVDSNDTVGPDMHSEEEKRDHTADQVKEPYNGMTNSAARSTHVRFGSEEPSLETNGGHEPAVEEETSTGVRETEDSDDDDEAPETIDNAVQLRKLKEAARKEAQSKQRTKALHKEKRRERDQQLKAQAQAQAQAVARPAPPKSNHETSSLDPKHEEILSESSATLQGSTSKFIHPLPILLPDEILNAEPSSAHNIPTPPYESNSTSATRMPKKYKFLDKVEKRPRDIKIGGAVIRVLESSGGGFGGVSLPPKASKNSRRVKDNWMAGNRRLPSGGSLRRRSGVASFVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.25
4 0.25
5 0.29
6 0.33
7 0.3
8 0.27
9 0.24
10 0.28
11 0.26
12 0.25
13 0.25
14 0.23
15 0.24
16 0.24
17 0.22
18 0.21
19 0.23
20 0.26
21 0.24
22 0.22
23 0.23
24 0.24
25 0.23
26 0.21
27 0.23
28 0.21
29 0.22
30 0.21
31 0.22
32 0.21
33 0.25
34 0.24
35 0.21
36 0.2
37 0.15
38 0.15
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.18
46 0.21
47 0.28
48 0.32
49 0.35
50 0.37
51 0.4
52 0.47
53 0.52
54 0.55
55 0.56
56 0.57
57 0.54
58 0.53
59 0.54
60 0.52
61 0.5
62 0.45
63 0.47
64 0.5
65 0.54
66 0.62
67 0.68
68 0.71
69 0.75
70 0.83
71 0.84
72 0.87
73 0.85
74 0.83
75 0.78
76 0.7
77 0.6
78 0.5
79 0.39
80 0.28
81 0.21
82 0.12
83 0.08
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.09
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.15
97 0.19
98 0.24
99 0.27
100 0.27
101 0.28
102 0.29
103 0.3
104 0.28
105 0.25
106 0.22
107 0.18
108 0.15
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.13
115 0.17
116 0.18
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.23
121 0.3
122 0.3
123 0.3
124 0.36
125 0.34
126 0.34
127 0.34
128 0.3
129 0.26
130 0.24
131 0.2
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.13
138 0.17
139 0.18
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.21
144 0.24
145 0.27
146 0.24
147 0.21
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.12
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.14
194 0.18
195 0.24
196 0.29
197 0.34
198 0.38
199 0.4
200 0.43
201 0.49
202 0.53
203 0.56
204 0.56
205 0.53
206 0.53
207 0.53
208 0.54
209 0.56
210 0.59
211 0.59
212 0.63
213 0.7
214 0.73
215 0.8
216 0.82
217 0.81
218 0.78
219 0.79
220 0.78
221 0.76
222 0.76
223 0.69
224 0.63
225 0.57
226 0.52
227 0.41
228 0.37
229 0.28
230 0.23
231 0.2
232 0.2
233 0.17
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.17
239 0.2
240 0.24
241 0.31
242 0.36
243 0.36
244 0.38
245 0.41
246 0.37
247 0.46
248 0.41
249 0.36
250 0.3
251 0.29
252 0.27
253 0.24
254 0.22
255 0.14
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.1
264 0.07
265 0.11
266 0.11
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.17
271 0.17
272 0.22
273 0.18
274 0.18
275 0.16
276 0.21
277 0.22
278 0.2
279 0.2
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.18
294 0.19
295 0.22
296 0.25
297 0.2
298 0.23
299 0.26
300 0.25
301 0.27
302 0.29
303 0.27
304 0.25
305 0.28
306 0.33
307 0.36
308 0.42
309 0.48
310 0.52
311 0.58
312 0.65
313 0.71
314 0.71
315 0.74
316 0.77
317 0.78
318 0.82
319 0.85
320 0.85
321 0.8
322 0.79
323 0.73
324 0.71
325 0.62
326 0.56
327 0.52
328 0.51
329 0.46
330 0.4
331 0.36
332 0.27
333 0.26
334 0.21
335 0.14
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.12
350 0.15
351 0.21
352 0.3
353 0.39
354 0.48
355 0.58
356 0.64
357 0.7
358 0.72
359 0.76
360 0.75
361 0.75
362 0.74
363 0.73
364 0.71
365 0.68
366 0.71
367 0.64
368 0.56
369 0.49
370 0.4
371 0.36
372 0.4
373 0.44
374 0.46
375 0.51
376 0.54
377 0.55
378 0.55
379 0.52
380 0.45
381 0.44