Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H7P8

Protein Details
Accession C1H7P8    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
473-492VSDVTKSKRKPKQAESPIDSHydrophilic
505-525ESISPPSKRKRLGHKEPTGSPHydrophilic
659-681LEERANRKRQELRKQLEARNKAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
442-461PKAKGLVGMIGGKKTPKKPR
581-590KPKRPGGKLG
664-693NRKRQELRKQLEARNKAGGAGGPAKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG pbl:PAAG_06789  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSKWSILPLPNGNNTPHLLYKYVTSKSGCEIYLTDLAYIWSQSLSRREILNIASKYNTSIDPSEDEEQYFVLLEKIADALRGSGGSSISLTRGPGNEDLKLITSTNLPPPLDPLEWTFSLLQLPPVTLTKHILLPILKGEANHEARVLSLIDHIKQKDWTLSKLFDKIESSGMDLSTVFPGMGSVRLSRKESIYSQASKHIKGAAPFDEDSWKLEYQAKDADYNLGVHIAKELSGPLVELPADDFILENWWDKLGEGAINKPKIATKGKSQEDLTPRKSPSLAELKDKEEEATQSDDTDEFQTMETPQRLKSPSRKQSRESSKSNLQRLSSPTGNRANESDHDLTEGSSSPEFPKSKSKTKRMGTTGVHTKHEKESSAPSSVETATSEDGDPRPHQQHGPKAKGLGTIGGKQPTKRKQSPVESSEFTKSEDSESVAKVVSKPKAKGLVGMIGGKKTPKKPRQETPIESTASDVSDVTKSKRKPKQAESPIDSEGVPTASEHETEESISPPSKRKRLGHKEPTGSPPTLKQQLRSGNVGGIGQIGGNQKKKQPEMIDVAKRSDKNDDTEEETSPEPRQTSSKPKRPGGKLGIIGGRSRPAPTSPPASDDVNRAPGGELSESPVPSTSGKPTMATWASKQPPVIPEEKEKEAEQEKIEETLEERANRKRQELRKQLEARNKAGGAGGPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.37
4 0.33
5 0.29
6 0.26
7 0.3
8 0.34
9 0.35
10 0.35
11 0.33
12 0.33
13 0.36
14 0.39
15 0.33
16 0.28
17 0.26
18 0.27
19 0.29
20 0.28
21 0.23
22 0.19
23 0.2
24 0.19
25 0.18
26 0.13
27 0.09
28 0.09
29 0.14
30 0.19
31 0.22
32 0.24
33 0.25
34 0.26
35 0.29
36 0.32
37 0.37
38 0.33
39 0.33
40 0.32
41 0.3
42 0.31
43 0.3
44 0.27
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.23
49 0.28
50 0.29
51 0.27
52 0.27
53 0.23
54 0.21
55 0.19
56 0.16
57 0.11
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.16
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.24
85 0.24
86 0.23
87 0.24
88 0.21
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.23
93 0.27
94 0.25
95 0.24
96 0.27
97 0.31
98 0.28
99 0.26
100 0.24
101 0.24
102 0.24
103 0.26
104 0.23
105 0.19
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.18
116 0.17
117 0.19
118 0.19
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.17
126 0.19
127 0.24
128 0.27
129 0.25
130 0.24
131 0.2
132 0.2
133 0.21
134 0.19
135 0.1
136 0.12
137 0.14
138 0.16
139 0.22
140 0.23
141 0.24
142 0.25
143 0.26
144 0.29
145 0.29
146 0.31
147 0.31
148 0.34
149 0.36
150 0.4
151 0.39
152 0.34
153 0.33
154 0.3
155 0.28
156 0.24
157 0.23
158 0.19
159 0.18
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.1
164 0.1
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.08
171 0.11
172 0.14
173 0.18
174 0.21
175 0.23
176 0.24
177 0.26
178 0.27
179 0.3
180 0.33
181 0.33
182 0.32
183 0.39
184 0.41
185 0.38
186 0.37
187 0.35
188 0.31
189 0.3
190 0.32
191 0.26
192 0.27
193 0.27
194 0.26
195 0.25
196 0.23
197 0.23
198 0.22
199 0.19
200 0.17
201 0.22
202 0.21
203 0.2
204 0.25
205 0.24
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.17
210 0.18
211 0.15
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.09
243 0.09
244 0.14
245 0.2
246 0.2
247 0.2
248 0.2
249 0.22
250 0.25
251 0.3
252 0.27
253 0.3
254 0.39
255 0.42
256 0.45
257 0.45
258 0.46
259 0.49
260 0.54
261 0.5
262 0.47
263 0.44
264 0.42
265 0.41
266 0.34
267 0.32
268 0.34
269 0.31
270 0.32
271 0.34
272 0.35
273 0.36
274 0.36
275 0.3
276 0.21
277 0.2
278 0.15
279 0.16
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.18
296 0.2
297 0.24
298 0.33
299 0.4
300 0.48
301 0.57
302 0.61
303 0.6
304 0.68
305 0.74
306 0.72
307 0.66
308 0.63
309 0.62
310 0.65
311 0.66
312 0.59
313 0.49
314 0.45
315 0.44
316 0.43
317 0.38
318 0.32
319 0.32
320 0.35
321 0.35
322 0.32
323 0.29
324 0.26
325 0.23
326 0.28
327 0.23
328 0.16
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.13
333 0.13
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.13
339 0.14
340 0.15
341 0.24
342 0.28
343 0.38
344 0.46
345 0.54
346 0.58
347 0.63
348 0.69
349 0.64
350 0.66
351 0.58
352 0.56
353 0.57
354 0.5
355 0.48
356 0.41
357 0.39
358 0.36
359 0.35
360 0.29
361 0.22
362 0.25
363 0.25
364 0.26
365 0.24
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.18
370 0.13
371 0.11
372 0.09
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.12
378 0.12
379 0.16
380 0.18
381 0.18
382 0.22
383 0.26
384 0.35
385 0.41
386 0.46
387 0.42
388 0.42
389 0.41
390 0.39
391 0.34
392 0.29
393 0.22
394 0.21
395 0.22
396 0.26
397 0.25
398 0.26
399 0.34
400 0.38
401 0.45
402 0.47
403 0.52
404 0.55
405 0.64
406 0.7
407 0.66
408 0.64
409 0.56
410 0.54
411 0.5
412 0.42
413 0.34
414 0.26
415 0.22
416 0.18
417 0.17
418 0.16
419 0.15
420 0.14
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.14
425 0.19
426 0.22
427 0.26
428 0.26
429 0.3
430 0.36
431 0.36
432 0.37
433 0.33
434 0.32
435 0.28
436 0.31
437 0.28
438 0.21
439 0.22
440 0.22
441 0.24
442 0.27
443 0.37
444 0.4
445 0.5
446 0.58
447 0.66
448 0.73
449 0.78
450 0.76
451 0.73
452 0.71
453 0.62
454 0.54
455 0.46
456 0.37
457 0.27
458 0.22
459 0.14
460 0.09
461 0.11
462 0.12
463 0.15
464 0.21
465 0.25
466 0.35
467 0.43
468 0.51
469 0.58
470 0.66
471 0.73
472 0.76
473 0.82
474 0.77
475 0.74
476 0.65
477 0.57
478 0.48
479 0.37
480 0.27
481 0.17
482 0.12
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.13
492 0.11
493 0.12
494 0.14
495 0.15
496 0.22
497 0.3
498 0.36
499 0.43
500 0.49
501 0.59
502 0.67
503 0.76
504 0.79
505 0.81
506 0.81
507 0.78
508 0.78
509 0.71
510 0.62
511 0.52
512 0.45
513 0.43
514 0.46
515 0.42
516 0.38
517 0.41
518 0.48
519 0.5
520 0.49
521 0.43
522 0.35
523 0.34
524 0.31
525 0.24
526 0.16
527 0.12
528 0.08
529 0.11
530 0.14
531 0.18
532 0.23
533 0.25
534 0.29
535 0.36
536 0.39
537 0.42
538 0.41
539 0.43
540 0.46
541 0.53
542 0.57
543 0.53
544 0.55
545 0.54
546 0.52
547 0.47
548 0.47
549 0.4
550 0.37
551 0.39
552 0.37
553 0.37
554 0.38
555 0.38
556 0.32
557 0.3
558 0.28
559 0.25
560 0.24
561 0.19
562 0.18
563 0.22
564 0.26
565 0.36
566 0.45
567 0.53
568 0.6
569 0.66
570 0.74
571 0.76
572 0.8
573 0.76
574 0.74
575 0.67
576 0.64
577 0.61
578 0.53
579 0.48
580 0.4
581 0.35
582 0.27
583 0.25
584 0.21
585 0.19
586 0.23
587 0.26
588 0.32
589 0.3
590 0.33
591 0.35
592 0.37
593 0.36
594 0.37
595 0.37
596 0.34
597 0.33
598 0.3
599 0.28
600 0.25
601 0.25
602 0.22
603 0.18
604 0.17
605 0.21
606 0.2
607 0.2
608 0.19
609 0.18
610 0.18
611 0.21
612 0.21
613 0.23
614 0.24
615 0.24
616 0.25
617 0.31
618 0.33
619 0.34
620 0.32
621 0.37
622 0.4
623 0.42
624 0.42
625 0.39
626 0.39
627 0.41
628 0.42
629 0.37
630 0.42
631 0.45
632 0.49
633 0.47
634 0.43
635 0.45
636 0.45
637 0.45
638 0.37
639 0.36
640 0.33
641 0.32
642 0.32
643 0.25
644 0.23
645 0.25
646 0.28
647 0.28
648 0.31
649 0.38
650 0.46
651 0.49
652 0.56
653 0.58
654 0.63
655 0.7
656 0.77
657 0.75
658 0.77
659 0.83
660 0.84
661 0.84
662 0.81
663 0.74
664 0.71
665 0.64
666 0.54
667 0.46
668 0.39
669 0.34
670 0.36
671 0.38
672 0.4
673 0.48