Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0CSU9

Protein Details
Accession X0CSU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
684-706LDDMRHRRPSTPPRDNYRRNSSEHydrophilic
711-730EDTRRPDEPRREEPRRPESAAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
714-726RRPDEPRREEPRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006597  Sel1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR013105  TPR_2  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0009740  P:gibberellic acid mediated signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF00515  TPR_1  
PF14559  TPR_19  
PF07719  TPR_2  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MANHHASPTMMQMQQHQGQVPPPPPPPPQFAPSHQIAAMNEAVWLQIGSYAEVLRNPDEAMHAYERALQANPNSTQAMNAIGLLYKTREAFEKALEFFRAIVQLEPNNGEAWGNLGHCYLMTENLQKAYDAYQQALVNLRDPKDPMLWYGIGILYDRYGSYDYAEEAFSQVMNIQPDFEKANEIYFRLGIIYKQQNKWVQSLECFKYIVNSPPGPLTQEDIWFQIGHVHEQQKDFDSAKAAYQRVLDHSPNHAKVLQQLGWLHHQQSNTYESQDRAIQYLEKSVGADNQDAQSWYLLGRCYMSQQKYPKAYEAYQQAVYRDGKNPTFWCSIGVLYYQINQYRDALDAYSRAIRLNPYISEVWYDLGTLYESCNNQITDALDAYQRAAELDPNNPHIKARLQLLRSGGTNGGPPPAPQPADVHPQAYQAAGPVGPQWGGSTQQPPAAGPPPPPQGPGENWAGRLSNINPPPQPPNPYEARGEPFRGGPAPPLRQPSPQQEQLRQPYNDPNRGGPRRGQTPPPPGHQYSQPPHAPPQSQPSAPASERRVANPNWGGATPSASAPPPSNINGPNGPNGMAPFRPTNSPRPDGRPVHDNRMPSPKSAYPQHQAPPLYPQHPEMAAQGTENGPSGPSGPPGPPPPPAVAEAAMQRMDDRPPSVGPKRMREWEEESAAKKQASEENRVRLDDMRHRRPSTPPRDNYRRNSSEIRRAEDTRRPDEPRREEPRRPESAPRHATESYHPSEAAHHPPSHASGPSHLPPMQQPPTPMSGVVHEKPPVSATPKEDRPPSLEHAPPPPRAAPPAEPERAARKMDVDEDYDDSGEDEKKATIVTNGSGPGSAAGDAKTSTPANAGVNGVSGTVTKVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.38
4 0.34
5 0.35
6 0.41
7 0.39
8 0.38
9 0.36
10 0.39
11 0.45
12 0.47
13 0.51
14 0.49
15 0.51
16 0.51
17 0.53
18 0.53
19 0.5
20 0.49
21 0.42
22 0.4
23 0.35
24 0.33
25 0.29
26 0.22
27 0.19
28 0.15
29 0.14
30 0.11
31 0.1
32 0.06
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.14
45 0.16
46 0.17
47 0.21
48 0.21
49 0.2
50 0.2
51 0.24
52 0.25
53 0.25
54 0.23
55 0.21
56 0.21
57 0.27
58 0.28
59 0.27
60 0.27
61 0.25
62 0.24
63 0.22
64 0.22
65 0.15
66 0.14
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.16
76 0.2
77 0.22
78 0.25
79 0.29
80 0.29
81 0.32
82 0.32
83 0.29
84 0.25
85 0.25
86 0.22
87 0.18
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.21
92 0.22
93 0.21
94 0.19
95 0.18
96 0.16
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.17
110 0.18
111 0.21
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.21
116 0.24
117 0.22
118 0.21
119 0.23
120 0.23
121 0.25
122 0.3
123 0.27
124 0.25
125 0.29
126 0.29
127 0.27
128 0.28
129 0.3
130 0.28
131 0.28
132 0.25
133 0.25
134 0.23
135 0.21
136 0.21
137 0.19
138 0.15
139 0.15
140 0.13
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.17
173 0.17
174 0.14
175 0.15
176 0.11
177 0.17
178 0.26
179 0.32
180 0.35
181 0.42
182 0.46
183 0.48
184 0.51
185 0.48
186 0.41
187 0.4
188 0.46
189 0.42
190 0.38
191 0.36
192 0.32
193 0.3
194 0.3
195 0.31
196 0.28
197 0.26
198 0.25
199 0.27
200 0.28
201 0.26
202 0.24
203 0.22
204 0.17
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.19
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.15
213 0.16
214 0.2
215 0.23
216 0.25
217 0.26
218 0.28
219 0.26
220 0.28
221 0.26
222 0.22
223 0.21
224 0.19
225 0.21
226 0.25
227 0.23
228 0.22
229 0.22
230 0.23
231 0.24
232 0.28
233 0.27
234 0.23
235 0.31
236 0.37
237 0.36
238 0.37
239 0.33
240 0.29
241 0.31
242 0.35
243 0.29
244 0.25
245 0.25
246 0.25
247 0.29
248 0.31
249 0.29
250 0.25
251 0.24
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.21
256 0.22
257 0.21
258 0.19
259 0.21
260 0.23
261 0.21
262 0.17
263 0.17
264 0.17
265 0.15
266 0.18
267 0.17
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.12
288 0.19
289 0.22
290 0.27
291 0.32
292 0.39
293 0.44
294 0.45
295 0.45
296 0.42
297 0.41
298 0.4
299 0.39
300 0.36
301 0.34
302 0.33
303 0.29
304 0.3
305 0.3
306 0.27
307 0.26
308 0.26
309 0.24
310 0.27
311 0.27
312 0.28
313 0.29
314 0.26
315 0.24
316 0.21
317 0.2
318 0.17
319 0.16
320 0.12
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.12
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.12
341 0.14
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.15
347 0.15
348 0.13
349 0.11
350 0.11
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.08
375 0.09
376 0.13
377 0.14
378 0.18
379 0.19
380 0.19
381 0.19
382 0.18
383 0.18
384 0.16
385 0.2
386 0.22
387 0.21
388 0.24
389 0.26
390 0.25
391 0.24
392 0.23
393 0.18
394 0.13
395 0.14
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.1
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.13
405 0.15
406 0.21
407 0.21
408 0.2
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.16
413 0.13
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.13
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.19
436 0.21
437 0.21
438 0.23
439 0.21
440 0.21
441 0.22
442 0.22
443 0.23
444 0.2
445 0.21
446 0.2
447 0.2
448 0.17
449 0.18
450 0.16
451 0.18
452 0.2
453 0.22
454 0.22
455 0.24
456 0.29
457 0.3
458 0.32
459 0.26
460 0.28
461 0.28
462 0.3
463 0.3
464 0.27
465 0.28
466 0.26
467 0.27
468 0.23
469 0.2
470 0.19
471 0.18
472 0.15
473 0.17
474 0.2
475 0.22
476 0.24
477 0.28
478 0.29
479 0.32
480 0.36
481 0.39
482 0.4
483 0.45
484 0.46
485 0.46
486 0.52
487 0.55
488 0.58
489 0.51
490 0.47
491 0.48
492 0.51
493 0.52
494 0.45
495 0.43
496 0.46
497 0.48
498 0.48
499 0.44
500 0.42
501 0.43
502 0.45
503 0.46
504 0.44
505 0.51
506 0.53
507 0.53
508 0.54
509 0.49
510 0.48
511 0.47
512 0.47
513 0.42
514 0.45
515 0.42
516 0.38
517 0.4
518 0.43
519 0.39
520 0.33
521 0.37
522 0.34
523 0.31
524 0.31
525 0.3
526 0.3
527 0.29
528 0.33
529 0.28
530 0.29
531 0.3
532 0.31
533 0.34
534 0.29
535 0.36
536 0.32
537 0.3
538 0.26
539 0.25
540 0.24
541 0.18
542 0.2
543 0.13
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.11
548 0.11
549 0.13
550 0.13
551 0.14
552 0.17
553 0.18
554 0.21
555 0.24
556 0.24
557 0.25
558 0.23
559 0.22
560 0.19
561 0.19
562 0.17
563 0.14
564 0.15
565 0.14
566 0.15
567 0.2
568 0.22
569 0.3
570 0.35
571 0.4
572 0.41
573 0.46
574 0.53
575 0.52
576 0.52
577 0.53
578 0.51
579 0.54
580 0.53
581 0.48
582 0.43
583 0.49
584 0.47
585 0.39
586 0.4
587 0.34
588 0.37
589 0.41
590 0.43
591 0.38
592 0.43
593 0.45
594 0.46
595 0.43
596 0.39
597 0.41
598 0.4
599 0.37
600 0.32
601 0.3
602 0.27
603 0.27
604 0.27
605 0.21
606 0.19
607 0.16
608 0.15
609 0.15
610 0.13
611 0.12
612 0.12
613 0.1
614 0.07
615 0.07
616 0.09
617 0.08
618 0.09
619 0.11
620 0.11
621 0.15
622 0.19
623 0.21
624 0.22
625 0.24
626 0.24
627 0.25
628 0.26
629 0.24
630 0.21
631 0.2
632 0.19
633 0.19
634 0.17
635 0.15
636 0.14
637 0.14
638 0.15
639 0.15
640 0.14
641 0.14
642 0.16
643 0.24
644 0.28
645 0.35
646 0.39
647 0.44
648 0.49
649 0.54
650 0.55
651 0.53
652 0.55
653 0.53
654 0.53
655 0.49
656 0.46
657 0.42
658 0.43
659 0.37
660 0.3
661 0.27
662 0.29
663 0.29
664 0.36
665 0.38
666 0.43
667 0.46
668 0.46
669 0.45
670 0.41
671 0.44
672 0.45
673 0.49
674 0.51
675 0.56
676 0.58
677 0.6
678 0.66
679 0.7
680 0.71
681 0.72
682 0.7
683 0.72
684 0.8
685 0.86
686 0.85
687 0.85
688 0.78
689 0.73
690 0.74
691 0.71
692 0.71
693 0.67
694 0.65
695 0.59
696 0.59
697 0.6
698 0.58
699 0.58
700 0.54
701 0.56
702 0.57
703 0.6
704 0.67
705 0.68
706 0.71
707 0.74
708 0.76
709 0.77
710 0.8
711 0.8
712 0.77
713 0.73
714 0.73
715 0.72
716 0.74
717 0.73
718 0.66
719 0.63
720 0.56
721 0.54
722 0.5
723 0.49
724 0.43
725 0.37
726 0.35
727 0.29
728 0.33
729 0.36
730 0.37
731 0.34
732 0.31
733 0.3
734 0.32
735 0.35
736 0.33
737 0.32
738 0.25
739 0.24
740 0.29
741 0.31
742 0.34
743 0.32
744 0.3
745 0.31
746 0.39
747 0.4
748 0.36
749 0.36
750 0.35
751 0.38
752 0.37
753 0.33
754 0.25
755 0.26
756 0.31
757 0.31
758 0.31
759 0.29
760 0.29
761 0.29
762 0.3
763 0.29
764 0.27
765 0.29
766 0.31
767 0.38
768 0.45
769 0.5
770 0.52
771 0.51
772 0.5
773 0.51
774 0.51
775 0.5
776 0.47
777 0.46
778 0.51
779 0.54
780 0.53
781 0.52
782 0.49
783 0.44
784 0.44
785 0.45
786 0.4
787 0.42
788 0.47
789 0.46
790 0.45
791 0.46
792 0.49
793 0.48
794 0.45
795 0.38
796 0.33
797 0.33
798 0.36
799 0.36
800 0.32
801 0.3
802 0.3
803 0.3
804 0.27
805 0.24
806 0.19
807 0.19
808 0.17
809 0.15
810 0.13
811 0.12
812 0.12
813 0.13
814 0.13
815 0.14
816 0.15
817 0.16
818 0.19
819 0.2
820 0.2
821 0.19
822 0.18
823 0.16
824 0.15
825 0.14
826 0.11
827 0.1
828 0.11
829 0.12
830 0.12
831 0.15
832 0.15
833 0.14
834 0.15
835 0.17
836 0.18
837 0.19
838 0.2
839 0.16
840 0.16
841 0.16
842 0.14
843 0.12
844 0.1