FuNGI

C1H7A6

Protein Details

Accession

C1H7A6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
387-411	ALTSAPPKPKTKKKRVAIQDPRSKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
107-159	VARKGKAEREALERREAERMQEKVREVAAMRSAEARARGVDRDRGRGRGRGRG
311-316	AKAKAK
393-401	PKPKTKKKR

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	pbl:PAAG_06647 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKSTNTRGRPAAFSRRTAGPTDSSSATSTSGPSNTTTNPNNAPIGSNLSEPRSRNAPSASATPTTRGSVQRLQSLKKRAPTGSLVPLNPDGTVPKPTLRYQPRAVARKGKAEREALERREAERMQEKVREVAAMRSAEARARGVDRDRGRGRGRGRGGVISGGDGSGLLGSGISMRGRGGGGFGGGRLKFGNGGRSGAERVHGLVTAKSEEGGKGESRDVSSDEESDGGPRFSIEQINIISDEEEEAGWGDNVELEEGKRKMPAKGSVSGGSGRGLRPIRVERQEHQERSVGVNTDASSHKSAELRRQAKAKAKEKHGGDESLFVQESEDEDADSVIESEEEVEITSEKALGRAAQREVRIKQEPTEDGDVLMVDTIPQATDDSALTSAPPKPKTKKKRVAIQDPRSKLQTEEERQEWDLHAQDIEHIRQALGTITTHDKPAEGEEAAGREDEAKALEAPKDERSGRLFLIQFPPMTPNLIAQTRAVDATDQDVVETGAQTTTQNPAIPSIKRENTDSLAILKPTSVINNNTNGVSQFITAVNSSLPPGRVGKLNIHQSGRATIDWGGISFDLTKGSDVDFLQDAIVASEGNPKVSGEDGGTLEEPGETLVWAMSQVTGKFVVTPDWEVLLGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.63
3	0.58
4	0.57
5	0.56
6	0.52
7	0.47
8	0.41
9	0.39
10	0.4
11	0.37
12	0.32
13	0.31
14	0.28
15	0.26
16	0.22
17	0.2
18	0.19
19	0.19
20	0.18
21	0.18
22	0.21
23	0.23
24	0.29
25	0.31
26	0.33
27	0.36
28	0.38
29	0.38
30	0.35
31	0.34
32	0.28
33	0.31
34	0.27
35	0.27
36	0.26
37	0.29
38	0.33
39	0.33
40	0.35
41	0.35
42	0.35
43	0.36
44	0.37
45	0.36
46	0.34
47	0.38
48	0.37
49	0.36
50	0.35
51	0.33
52	0.32
53	0.31
54	0.32
55	0.31
56	0.33
57	0.36
58	0.39
59	0.44
60	0.47
61	0.51
62	0.54
63	0.6
64	0.6
65	0.59
66	0.62
67	0.55
68	0.55
69	0.55
70	0.53
71	0.53
72	0.52
73	0.46
74	0.44
75	0.44
76	0.4
77	0.34
78	0.28
79	0.21
80	0.18
81	0.21
82	0.19
83	0.2
84	0.24
85	0.27
86	0.37
87	0.42
88	0.47
89	0.49
90	0.56
91	0.62
92	0.65
93	0.68
94	0.68
95	0.64
96	0.67
97	0.68
98	0.66
99	0.62
100	0.59
101	0.57
102	0.56
103	0.6
104	0.53
105	0.54
106	0.49
107	0.46
108	0.48
109	0.44
110	0.41
111	0.4
112	0.41
113	0.39
114	0.42
115	0.41
116	0.37
117	0.37
118	0.34
119	0.27
120	0.27
121	0.27
122	0.23
123	0.22
124	0.21
125	0.21
126	0.21
127	0.21
128	0.18
129	0.15
130	0.16
131	0.2
132	0.21
133	0.29
134	0.3
135	0.38
136	0.4
137	0.46
138	0.47
139	0.5
140	0.5
141	0.51
142	0.52
143	0.48
144	0.47
145	0.41
146	0.39
147	0.34
148	0.3
149	0.22
150	0.18
151	0.12
152	0.1
153	0.07
154	0.06
155	0.04
156	0.04
157	0.03
158	0.02
159	0.02
160	0.03
161	0.04
162	0.04
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.06
170	0.07
171	0.06
172	0.07
173	0.11
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.14
179	0.15
180	0.2
181	0.16
182	0.18
183	0.18
184	0.2
185	0.21
186	0.18
187	0.18
188	0.12
189	0.13
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.13
206	0.13
207	0.14
208	0.14
209	0.15
210	0.15
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.13
216	0.12
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.08
221	0.09
222	0.1
223	0.09
224	0.11
225	0.12
226	0.12
227	0.13
228	0.12
229	0.11
230	0.09
231	0.09
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.14
249	0.16
250	0.18
251	0.22
252	0.29
253	0.28
254	0.31
255	0.34
256	0.32
257	0.32
258	0.3
259	0.26
260	0.2
261	0.18
262	0.14
263	0.17
264	0.16
265	0.15
266	0.18
267	0.22
268	0.27
269	0.32
270	0.36
271	0.33
272	0.42
273	0.5
274	0.48
275	0.46
276	0.42
277	0.36
278	0.35
279	0.34
280	0.26
281	0.17
282	0.17
283	0.15
284	0.15
285	0.15
286	0.15
287	0.14
288	0.13
289	0.14
290	0.16
291	0.17
292	0.23
293	0.31
294	0.32
295	0.33
296	0.37
297	0.4
298	0.46
299	0.54
300	0.55
301	0.53
302	0.56
303	0.59
304	0.56
305	0.57
306	0.51
307	0.43
308	0.34
309	0.3
310	0.25
311	0.2
312	0.19
313	0.13
314	0.11
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.07
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.08
341	0.09
342	0.12
343	0.15
344	0.18
345	0.21
346	0.26
347	0.27
348	0.31
349	0.34
350	0.32
351	0.32
352	0.32
353	0.31
354	0.29
355	0.32
356	0.25
357	0.21
358	0.2
359	0.17
360	0.13
361	0.11
362	0.07
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.08
377	0.12
378	0.17
379	0.21
380	0.27
381	0.35
382	0.46
383	0.56
384	0.66
385	0.72
386	0.75
387	0.81
388	0.84
389	0.87
390	0.88
391	0.87
392	0.85
393	0.79
394	0.73
395	0.66
396	0.56
397	0.46
398	0.42
399	0.41
400	0.37
401	0.38
402	0.37
403	0.38
404	0.39
405	0.39
406	0.32
407	0.25
408	0.21
409	0.16
410	0.15
411	0.11
412	0.13
413	0.15
414	0.15
415	0.15
416	0.13
417	0.13
418	0.13
419	0.13
420	0.11
421	0.09
422	0.08
423	0.09
424	0.13
425	0.14
426	0.15
427	0.15
428	0.14
429	0.14
430	0.16
431	0.16
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.12
436	0.13
437	0.12
438	0.1
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.08
445	0.09
446	0.11
447	0.12
448	0.15
449	0.17
450	0.21
451	0.21
452	0.23
453	0.25
454	0.26
455	0.25
456	0.29
457	0.27
458	0.26
459	0.3
460	0.29
461	0.26
462	0.24
463	0.26
464	0.2
465	0.22
466	0.18
467	0.15
468	0.17
469	0.19
470	0.19
471	0.17
472	0.18
473	0.17
474	0.17
475	0.15
476	0.11
477	0.1
478	0.11
479	0.13
480	0.11
481	0.1
482	0.09
483	0.1
484	0.1
485	0.09
486	0.07
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.08
491	0.1
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.18
496	0.22
497	0.24
498	0.28
499	0.34
500	0.37
501	0.37
502	0.4
503	0.4
504	0.38
505	0.39
506	0.34
507	0.3
508	0.28
509	0.26
510	0.23
511	0.19
512	0.17
513	0.15
514	0.18
515	0.18
516	0.2
517	0.23
518	0.28
519	0.29
520	0.29
521	0.29
522	0.25
523	0.23
524	0.19
525	0.15
526	0.12
527	0.11
528	0.12
529	0.11
530	0.12
531	0.1
532	0.1
533	0.11
534	0.13
535	0.13
536	0.14
537	0.16
538	0.18
539	0.22
540	0.24
541	0.3
542	0.35
543	0.43
544	0.47
545	0.47
546	0.47
547	0.44
548	0.46
549	0.41
550	0.33
551	0.26
552	0.21
553	0.21
554	0.19
555	0.18
556	0.15
557	0.12
558	0.13
559	0.12
560	0.11
561	0.1
562	0.11
563	0.11
564	0.1
565	0.11
566	0.14
567	0.13
568	0.16
569	0.15
570	0.15
571	0.14
572	0.14
573	0.13
574	0.1
575	0.1
576	0.07
577	0.07
578	0.15
579	0.16
580	0.16
581	0.16
582	0.16
583	0.16
584	0.18
585	0.19
586	0.12
587	0.15
588	0.14
589	0.17
590	0.17
591	0.16
592	0.15
593	0.13
594	0.12
595	0.09
596	0.09
597	0.06
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.08
604	0.11
605	0.11
606	0.13
607	0.14
608	0.14
609	0.16
610	0.16
611	0.18
612	0.18
613	0.21
614	0.2
615	0.21

C1H7A6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer