FuNGI

X0BEM0

Protein Details

Accession

X0BEM0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
152-175	DDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSAS	Hydrophilic
355-380	SDSDAKETKKDKKIKKEKEVKDSSDS	Basic
449-476	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
160-166	SSKKKSS
256-261	KAKKQK
363-372	KKDKKIKKEK
455-468	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MFELQQLSSGRYGTSGASSLPLASVYTSRRVSGESGSGFTLLHWRMSGSKQSPPSWLFSNNPLNPIKPSTDTMGKKSTKAAAPKNDATSAPPPGQLMDLVENFLSDHSFKGAADAFKKQREKKGWKATATTDEEGNPSLVSVYQTWEATKGDDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSASSDSSSDSSDAKEEDVDMKDAESSSDSDSSSDSDSDDEAAKPKASNTLKRKAPVDESSSDSSSDSDSDSSSSDSESDSDKPKAKKQKRAASSSSSSDSSSSSSESSDSSDSSDSSDSDSSSDSDDESAKSDSGSSSSDSSSDSSSDSDSSDSDDEAAAKVPLPDSDSSSSDSDSASSDSDSDSDAKETKKDKKIKKEKEVKDSSDSSVTLDKTSPDFQSNSAYPPLPPDPVVNGNGRKKQNEPFSRIPKNIKVDAKFASNEYVSIAYSQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHDKKGIYFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.13
3	0.12
4	0.13
5	0.13
6	0.13
7	0.12
8	0.11
9	0.09
10	0.09
11	0.13
12	0.15
13	0.22
14	0.23
15	0.23
16	0.24
17	0.26
18	0.27
19	0.26
20	0.3
21	0.24
22	0.25
23	0.25
24	0.24
25	0.22
26	0.2
27	0.24
28	0.18
29	0.18
30	0.16
31	0.17
32	0.2
33	0.24
34	0.33
35	0.28
36	0.35
37	0.4
38	0.42
39	0.48
40	0.47
41	0.47
42	0.42
43	0.43
44	0.39
45	0.41
46	0.49
47	0.44
48	0.48
49	0.46
50	0.43
51	0.42
52	0.43
53	0.38
54	0.31
55	0.31
56	0.3
57	0.38
58	0.39
59	0.41
60	0.47
61	0.46
62	0.44
63	0.45
64	0.47
65	0.43
66	0.49
67	0.52
68	0.52
69	0.58
70	0.62
71	0.61
72	0.57
73	0.52
74	0.48
75	0.43
76	0.39
77	0.32
78	0.28
79	0.25
80	0.23
81	0.23
82	0.18
83	0.16
84	0.15
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.13
89	0.12
90	0.12
91	0.11
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.09
96	0.09
97	0.11
98	0.15
99	0.17
100	0.19
101	0.27
102	0.3
103	0.38
104	0.47
105	0.5
106	0.55
107	0.63
108	0.69
109	0.72
110	0.78
111	0.78
112	0.74
113	0.72
114	0.67
115	0.66
116	0.62
117	0.53
118	0.43
119	0.36
120	0.33
121	0.29
122	0.25
123	0.16
124	0.1
125	0.09
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.11
131	0.11
132	0.11
133	0.13
134	0.13
135	0.13
136	0.14
137	0.13
138	0.14
139	0.16
140	0.2
141	0.23
142	0.25
143	0.28
144	0.32
145	0.37
146	0.44
147	0.52
148	0.59
149	0.65
150	0.72
151	0.78
152	0.85
153	0.88
154	0.87
155	0.84
156	0.8
157	0.76
158	0.7
159	0.61
160	0.53
161	0.43
162	0.36
163	0.29
164	0.23
165	0.18
166	0.15
167	0.13
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.09
173	0.08
174	0.08
175	0.1
176	0.11
177	0.12
178	0.11
179	0.1
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.1
193	0.08
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.18
205	0.2
206	0.29
207	0.34
208	0.42
209	0.45
210	0.48
211	0.5
212	0.44
213	0.46
214	0.41
215	0.39
216	0.32
217	0.33
218	0.33
219	0.31
220	0.28
221	0.23
222	0.19
223	0.15
224	0.13
225	0.09
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.08
237	0.1
238	0.13
239	0.16
240	0.22
241	0.24
242	0.31
243	0.41
244	0.47
245	0.55
246	0.62
247	0.68
248	0.69
249	0.74
250	0.72
251	0.67
252	0.63
253	0.56
254	0.48
255	0.4
256	0.33
257	0.26
258	0.22
259	0.17
260	0.14
261	0.12
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.11
267	0.1
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.09
275	0.1
276	0.11
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.09
281	0.1
282	0.1
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.1
288	0.11
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.11
302	0.11
303	0.1
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.11
311	0.1
312	0.1
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.1
324	0.1
325	0.13
326	0.16
327	0.17
328	0.2
329	0.2
330	0.2
331	0.18
332	0.17
333	0.14
334	0.12
335	0.12
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.1
345	0.13
346	0.14
347	0.19
348	0.25
349	0.34
350	0.42
351	0.51
352	0.58
353	0.67
354	0.77
355	0.82
356	0.87
357	0.88
358	0.88
359	0.89
360	0.89
361	0.82
362	0.78
363	0.7
364	0.62
365	0.54
366	0.46
367	0.37
368	0.33
369	0.28
370	0.23
371	0.21
372	0.19
373	0.19
374	0.22
375	0.22
376	0.21
377	0.22
378	0.21
379	0.27
380	0.27
381	0.27
382	0.27
383	0.26
384	0.22
385	0.27
386	0.28
387	0.23
388	0.23
389	0.22
390	0.23
391	0.27
392	0.3
393	0.31
394	0.36
395	0.42
396	0.5
397	0.53
398	0.51
399	0.52
400	0.57
401	0.62
402	0.62
403	0.63
404	0.65
405	0.7
406	0.75
407	0.77
408	0.76
409	0.73
410	0.71
411	0.71
412	0.69
413	0.62
414	0.59
415	0.55
416	0.53
417	0.46
418	0.4
419	0.37
420	0.29
421	0.26
422	0.23
423	0.21
424	0.16
425	0.17
426	0.17
427	0.13
428	0.15
429	0.15
430	0.16
431	0.16
432	0.16
433	0.16
434	0.17
435	0.18
436	0.23
437	0.28
438	0.26
439	0.27
440	0.31
441	0.32
442	0.37
443	0.4
444	0.43
445	0.49
446	0.59
447	0.68
448	0.75
449	0.82
450	0.84
451	0.9
452	0.91
453	0.9
454	0.9
455	0.88
456	0.86
457	0.84
458	0.78
459	0.68
460	0.6
461	0.6
462	0.53
463	0.48
464	0.4
465	0.32
466	0.28

X0BEM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer