Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0CDP9

Protein Details
Accession X0CDP9    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-172QNIEAVPKTKRQPKKKKANIHTPQARQVHydrophilic
547-570EVEGRESRKKKGWQRVQHDLNNNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-162KTKRQPKKKKA
553-557SRKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MQWKIRQYGGTKGQKSASSSYLLQRRQHSVFNNFRSSLSAKRSQLLSHIEDPEIFEEPLLSREQRAMSIAQLSQLLPLPDEELKQVLDYASTLSTTEAAEHFGNLLGDSPQAIEFISSFNARRQTSAPGSSSYSNAAAPPEPESQNIEAVPKTKRQPKKKKANIHTPQARQVNDYAAPAGTTYSKKDLSLDYIPQRSSAPSSNNASRSNTPKPDPKPVAKPPPKQHASAGYLIGEGPSKPKPKSTPVSRSSTPKPATSTKISIAGGMPMAGASTAISDLDAAIRALEISTNPTLENSKSRKCNCVATRHPLQGAAPNCLSCGKVICMKEGLGPCTFCGSPLLTPDDVQAMVRELKDERGRERMAANRDANRRADVAKTPAPFTQPRGNDGASLSDAEAKARAHRDKLLNFQAHNARRTTVRDEAADFDVGGALTGTGSMWATPEERARELKRQQKVLREMEWNARPEYEKRKQVVSIDVVGGKVVRKMAAVERPVTPESDEDPVDNGALGETSANKNSGRGGGAFSGNPLLGALIKPVFDAKGKGAEVEGRESRKKKGWQRVQHDLNNNEEVILDGGVQGHDRSDEPACG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.51
4 0.43
5 0.37
6 0.38
7 0.42
8 0.46
9 0.49
10 0.5
11 0.52
12 0.56
13 0.55
14 0.59
15 0.58
16 0.59
17 0.63
18 0.64
19 0.65
20 0.59
21 0.56
22 0.54
23 0.5
24 0.47
25 0.45
26 0.46
27 0.41
28 0.45
29 0.46
30 0.42
31 0.46
32 0.45
33 0.43
34 0.41
35 0.41
36 0.37
37 0.36
38 0.37
39 0.32
40 0.29
41 0.22
42 0.16
43 0.14
44 0.14
45 0.15
46 0.17
47 0.15
48 0.13
49 0.17
50 0.19
51 0.19
52 0.2
53 0.19
54 0.18
55 0.21
56 0.21
57 0.18
58 0.19
59 0.18
60 0.17
61 0.19
62 0.17
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.15
107 0.22
108 0.23
109 0.25
110 0.25
111 0.31
112 0.34
113 0.38
114 0.36
115 0.31
116 0.35
117 0.33
118 0.33
119 0.27
120 0.23
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.13
126 0.16
127 0.19
128 0.19
129 0.2
130 0.23
131 0.23
132 0.24
133 0.23
134 0.21
135 0.17
136 0.2
137 0.22
138 0.24
139 0.3
140 0.37
141 0.46
142 0.56
143 0.66
144 0.74
145 0.82
146 0.86
147 0.9
148 0.91
149 0.92
150 0.9
151 0.89
152 0.88
153 0.81
154 0.79
155 0.74
156 0.65
157 0.55
158 0.48
159 0.41
160 0.33
161 0.29
162 0.21
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.15
171 0.16
172 0.17
173 0.18
174 0.19
175 0.22
176 0.24
177 0.28
178 0.3
179 0.33
180 0.33
181 0.32
182 0.31
183 0.27
184 0.26
185 0.24
186 0.22
187 0.23
188 0.28
189 0.32
190 0.36
191 0.37
192 0.38
193 0.38
194 0.41
195 0.43
196 0.43
197 0.42
198 0.46
199 0.48
200 0.54
201 0.56
202 0.56
203 0.57
204 0.62
205 0.69
206 0.7
207 0.75
208 0.72
209 0.77
210 0.74
211 0.66
212 0.61
213 0.57
214 0.51
215 0.44
216 0.37
217 0.27
218 0.24
219 0.22
220 0.19
221 0.12
222 0.08
223 0.09
224 0.13
225 0.17
226 0.17
227 0.22
228 0.26
229 0.33
230 0.43
231 0.49
232 0.54
233 0.55
234 0.62
235 0.6
236 0.63
237 0.59
238 0.59
239 0.52
240 0.44
241 0.43
242 0.4
243 0.42
244 0.4
245 0.38
246 0.3
247 0.32
248 0.3
249 0.26
250 0.22
251 0.18
252 0.14
253 0.11
254 0.09
255 0.05
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.02
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.17
283 0.19
284 0.24
285 0.31
286 0.33
287 0.38
288 0.38
289 0.47
290 0.44
291 0.49
292 0.49
293 0.48
294 0.52
295 0.49
296 0.48
297 0.39
298 0.35
299 0.31
300 0.27
301 0.23
302 0.18
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.19
316 0.19
317 0.2
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.17
322 0.16
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.12
328 0.15
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.12
334 0.11
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.15
342 0.19
343 0.21
344 0.22
345 0.27
346 0.28
347 0.28
348 0.31
349 0.32
350 0.33
351 0.38
352 0.39
353 0.4
354 0.44
355 0.46
356 0.44
357 0.39
358 0.36
359 0.29
360 0.28
361 0.24
362 0.25
363 0.26
364 0.26
365 0.27
366 0.26
367 0.29
368 0.28
369 0.3
370 0.32
371 0.29
372 0.3
373 0.32
374 0.31
375 0.28
376 0.27
377 0.24
378 0.17
379 0.16
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.13
385 0.11
386 0.14
387 0.2
388 0.23
389 0.22
390 0.29
391 0.35
392 0.37
393 0.45
394 0.5
395 0.47
396 0.45
397 0.48
398 0.51
399 0.49
400 0.48
401 0.41
402 0.34
403 0.33
404 0.37
405 0.36
406 0.33
407 0.31
408 0.29
409 0.3
410 0.32
411 0.31
412 0.27
413 0.21
414 0.15
415 0.13
416 0.11
417 0.09
418 0.06
419 0.04
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.05
428 0.06
429 0.08
430 0.13
431 0.15
432 0.18
433 0.24
434 0.28
435 0.36
436 0.44
437 0.51
438 0.54
439 0.61
440 0.63
441 0.67
442 0.71
443 0.68
444 0.65
445 0.62
446 0.59
447 0.58
448 0.58
449 0.52
450 0.44
451 0.39
452 0.37
453 0.37
454 0.44
455 0.44
456 0.46
457 0.46
458 0.49
459 0.51
460 0.51
461 0.52
462 0.46
463 0.4
464 0.34
465 0.33
466 0.29
467 0.26
468 0.23
469 0.17
470 0.14
471 0.12
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.18
476 0.25
477 0.27
478 0.28
479 0.29
480 0.34
481 0.34
482 0.33
483 0.28
484 0.22
485 0.22
486 0.23
487 0.21
488 0.17
489 0.18
490 0.18
491 0.16
492 0.14
493 0.11
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.05
498 0.08
499 0.11
500 0.12
501 0.14
502 0.14
503 0.15
504 0.17
505 0.19
506 0.18
507 0.16
508 0.18
509 0.19
510 0.21
511 0.2
512 0.19
513 0.19
514 0.16
515 0.15
516 0.12
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.1
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.12
525 0.13
526 0.14
527 0.16
528 0.16
529 0.22
530 0.22
531 0.23
532 0.23
533 0.26
534 0.26
535 0.31
536 0.34
537 0.34
538 0.42
539 0.44
540 0.49
541 0.53
542 0.61
543 0.64
544 0.69
545 0.74
546 0.76
547 0.82
548 0.87
549 0.88
550 0.87
551 0.86
552 0.79
553 0.74
554 0.66
555 0.57
556 0.46
557 0.36
558 0.28
559 0.2
560 0.16
561 0.1
562 0.07
563 0.08
564 0.09
565 0.1
566 0.09
567 0.08
568 0.1
569 0.1
570 0.13