Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0BE56

Protein Details
Accession X0BE56    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-404APAAPQRPTPRQRKSPATRKDMDHydrophilic
488-508DVTKVKCPMCRQKLDMKPRQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-397ASKRRRRSTTAAPAAPQRPTPRQRKSP
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 9, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR000477  RT_dom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00078  RVT_1  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50878  RT_POL  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd01650  RT_nLTR_like  
Amino Acid Sequences MIAKPGRRDLTKPGAWRPISLLSCLGKGLERLIARRLAWADVHNSVLLPKRAATDLVTALIHDMEEAFARKKVATLATMDIQGAFDTVMRNRLVLRLREQGWPYHLARWAESFMEDRSARARYQDTITHFAPLQCGLPQGSPVSPILFLLHTGLIYQLGNPQGRFGYADDTAILSIGDTVDETTAMASSSIDEMVRWGAAKGVSFDPKKTEVMHVSRKNSLLASEIEDDFLADLADGDFSSPSSYPPFTNPDPRPSQSHSVSLQSTVQASTPHRAFRNTTAPTNATTNTTARELSSTNCILHPFGPERTTTQLSSASNSTGESQASLPVFDSLEENDFFFDSPASSFSEAMPPATRRSTTAAAARTGSAHASKRRRRSTTAAPAAPQRPTPRQRKSPATRKDMDVEELFGTSHTCSPIDVEPSAEFDTIDLTETNEVFEEGRKPEKDDRVKLAAFQCVICMDDCSNLTVTHCGHLYCASCLHQSLHVDVTKVKCPMCRQKLDMKPRQSYDSTTKGYWSLELKLMTATQKGKRKANTLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.61
3 0.59
4 0.54
5 0.53
6 0.48
7 0.43
8 0.4
9 0.33
10 0.32
11 0.31
12 0.27
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.2
18 0.22
19 0.26
20 0.29
21 0.28
22 0.33
23 0.32
24 0.29
25 0.29
26 0.29
27 0.29
28 0.26
29 0.27
30 0.22
31 0.21
32 0.21
33 0.26
34 0.25
35 0.22
36 0.21
37 0.22
38 0.23
39 0.25
40 0.24
41 0.21
42 0.2
43 0.21
44 0.2
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.13
49 0.08
50 0.07
51 0.05
52 0.07
53 0.1
54 0.11
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.21
63 0.23
64 0.24
65 0.24
66 0.23
67 0.2
68 0.17
69 0.15
70 0.12
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.14
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.2
80 0.26
81 0.28
82 0.32
83 0.35
84 0.38
85 0.44
86 0.45
87 0.43
88 0.4
89 0.42
90 0.39
91 0.36
92 0.38
93 0.33
94 0.32
95 0.31
96 0.29
97 0.24
98 0.23
99 0.2
100 0.16
101 0.21
102 0.2
103 0.18
104 0.2
105 0.22
106 0.21
107 0.23
108 0.24
109 0.21
110 0.25
111 0.29
112 0.31
113 0.35
114 0.35
115 0.33
116 0.32
117 0.29
118 0.27
119 0.22
120 0.18
121 0.13
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.13
146 0.15
147 0.14
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.08
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.12
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.22
194 0.24
195 0.25
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.3
200 0.4
201 0.42
202 0.43
203 0.45
204 0.44
205 0.41
206 0.35
207 0.29
208 0.21
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.06
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.12
234 0.17
235 0.18
236 0.28
237 0.29
238 0.34
239 0.38
240 0.39
241 0.41
242 0.4
243 0.44
244 0.37
245 0.39
246 0.33
247 0.31
248 0.3
249 0.26
250 0.22
251 0.17
252 0.15
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.15
259 0.18
260 0.18
261 0.2
262 0.21
263 0.24
264 0.31
265 0.3
266 0.3
267 0.29
268 0.29
269 0.29
270 0.29
271 0.24
272 0.18
273 0.17
274 0.16
275 0.14
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.16
290 0.14
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.2
296 0.22
297 0.19
298 0.18
299 0.2
300 0.2
301 0.21
302 0.2
303 0.16
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.18
341 0.2
342 0.2
343 0.17
344 0.22
345 0.23
346 0.23
347 0.27
348 0.27
349 0.26
350 0.26
351 0.25
352 0.21
353 0.19
354 0.17
355 0.15
356 0.18
357 0.25
358 0.34
359 0.42
360 0.51
361 0.6
362 0.63
363 0.66
364 0.68
365 0.71
366 0.71
367 0.73
368 0.66
369 0.59
370 0.61
371 0.58
372 0.52
373 0.46
374 0.41
375 0.41
376 0.47
377 0.55
378 0.58
379 0.65
380 0.71
381 0.77
382 0.82
383 0.83
384 0.83
385 0.82
386 0.76
387 0.7
388 0.68
389 0.59
390 0.53
391 0.43
392 0.36
393 0.28
394 0.24
395 0.2
396 0.15
397 0.13
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.12
404 0.15
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.16
409 0.19
410 0.21
411 0.18
412 0.15
413 0.12
414 0.13
415 0.11
416 0.12
417 0.09
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.14
427 0.15
428 0.23
429 0.23
430 0.28
431 0.36
432 0.46
433 0.53
434 0.55
435 0.59
436 0.6
437 0.59
438 0.59
439 0.55
440 0.49
441 0.41
442 0.35
443 0.29
444 0.22
445 0.22
446 0.17
447 0.16
448 0.12
449 0.13
450 0.14
451 0.15
452 0.15
453 0.15
454 0.16
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.18
459 0.16
460 0.16
461 0.19
462 0.2
463 0.18
464 0.2
465 0.2
466 0.2
467 0.22
468 0.23
469 0.24
470 0.24
471 0.24
472 0.27
473 0.26
474 0.26
475 0.29
476 0.31
477 0.32
478 0.34
479 0.33
480 0.33
481 0.41
482 0.5
483 0.56
484 0.6
485 0.6
486 0.67
487 0.75
488 0.81
489 0.81
490 0.8
491 0.79
492 0.75
493 0.76
494 0.68
495 0.65
496 0.62
497 0.61
498 0.56
499 0.48
500 0.46
501 0.42
502 0.4
503 0.37
504 0.32
505 0.27
506 0.28
507 0.27
508 0.26
509 0.25
510 0.27
511 0.26
512 0.29
513 0.31
514 0.35
515 0.43
516 0.5
517 0.56
518 0.6