Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDG5

Protein Details
Accession C1HDG5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-505DIDSSSIRRGSRRRRSRPNGIYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
491-500RRGSRRRRSR
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 7.5, plas 5, nucl 4.5, pero 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001296  Glyco_trans_1  
IPR039507  PIG-A/GPI3  
IPR013234  PIGA_GPI_anchor_biosynthesis  
Gene Ontology GO:0000506  C:glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex  
GO:0017176  F:phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity  
GO:0006506  P:GPI anchor biosynthetic process  
KEGG pbl:PAAG_08806  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00534  Glycos_transf_1  
PF08288  PIGA  
CDD cd03796  GT4_PIG-A-like  
Amino Acid Sequences MPYNIAMISDFFFPQPGGVESHIYQLSSKLIDRGHKVIIVTHAYKGRTGVRYLTNGLKVYHVPFFVIYRESTMPTVFSFFPIFRNIIIREQIEIVHGHQSLSSFCHEAILHGRTMGLRTVFTDHSLFGFADAGSILTNKLLKFTLSDVDHVICVSHTCKENTVLRASLDPLMVSVIPNAVVAENFRPLSYAPGANDQMSRKDSEAVAAPRPLIGPDDVITIVVISRLFYNKGTDLLIAAIPRILSSHPNVRFVIAGSGPKAIDLEQMLERKVLQDKVEFLGAVRHEEVRDVMVRGHIYLHPSLTEAFGTVIVEAASCGLYVVSTRVGGIPEVLPQHMTTFAKPEEDDLVQATGRAIAALRSNRVRTDKFHDQVRMMYSWTDVARRTERVYNGICGAISEQEFYGYFPGQGWTATRGRIHSFALIDRLKRYYGCGIWAGKLFCLCVVIDFLLYVFLEIWFPRSNIDIARSWPRKPAVGSTYDPRDIDSSSIRRGSRRRRSRPNGIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.14
5 0.15
6 0.19
7 0.19
8 0.24
9 0.24
10 0.22
11 0.21
12 0.2
13 0.21
14 0.19
15 0.2
16 0.19
17 0.22
18 0.28
19 0.32
20 0.35
21 0.35
22 0.34
23 0.34
24 0.33
25 0.34
26 0.35
27 0.32
28 0.33
29 0.35
30 0.33
31 0.34
32 0.34
33 0.36
34 0.32
35 0.33
36 0.34
37 0.34
38 0.38
39 0.41
40 0.44
41 0.41
42 0.4
43 0.38
44 0.35
45 0.32
46 0.31
47 0.31
48 0.25
49 0.21
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.2
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.2
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.2
69 0.2
70 0.17
71 0.22
72 0.23
73 0.25
74 0.28
75 0.27
76 0.25
77 0.25
78 0.24
79 0.21
80 0.19
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.13
91 0.12
92 0.15
93 0.14
94 0.16
95 0.2
96 0.2
97 0.18
98 0.17
99 0.18
100 0.15
101 0.17
102 0.18
103 0.13
104 0.11
105 0.12
106 0.16
107 0.16
108 0.18
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.14
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.13
131 0.18
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.13
144 0.14
145 0.16
146 0.21
147 0.26
148 0.28
149 0.3
150 0.27
151 0.25
152 0.25
153 0.25
154 0.22
155 0.17
156 0.14
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.13
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.22
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.17
188 0.18
189 0.17
190 0.15
191 0.19
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.11
200 0.09
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.09
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.09
233 0.17
234 0.18
235 0.21
236 0.22
237 0.21
238 0.21
239 0.2
240 0.19
241 0.12
242 0.12
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.15
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.14
266 0.11
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.07
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.13
324 0.14
325 0.12
326 0.15
327 0.15
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.17
332 0.16
333 0.16
334 0.13
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.1
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.11
345 0.13
346 0.17
347 0.21
348 0.22
349 0.27
350 0.32
351 0.33
352 0.33
353 0.4
354 0.46
355 0.46
356 0.51
357 0.51
358 0.47
359 0.48
360 0.47
361 0.38
362 0.29
363 0.26
364 0.2
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.16
369 0.2
370 0.23
371 0.25
372 0.29
373 0.31
374 0.32
375 0.36
376 0.37
377 0.34
378 0.31
379 0.29
380 0.25
381 0.2
382 0.19
383 0.15
384 0.13
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.1
392 0.1
393 0.09
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.14
399 0.16
400 0.19
401 0.2
402 0.22
403 0.26
404 0.27
405 0.28
406 0.26
407 0.26
408 0.24
409 0.3
410 0.31
411 0.3
412 0.3
413 0.31
414 0.29
415 0.27
416 0.29
417 0.28
418 0.26
419 0.27
420 0.3
421 0.3
422 0.31
423 0.35
424 0.32
425 0.27
426 0.26
427 0.23
428 0.17
429 0.17
430 0.13
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.06
441 0.06
442 0.08
443 0.08
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.14
448 0.16
449 0.17
450 0.19
451 0.23
452 0.22
453 0.25
454 0.36
455 0.39
456 0.39
457 0.44
458 0.45
459 0.45
460 0.45
461 0.49
462 0.44
463 0.46
464 0.49
465 0.5
466 0.54
467 0.53
468 0.5
469 0.43
470 0.39
471 0.34
472 0.33
473 0.34
474 0.31
475 0.33
476 0.4
477 0.4
478 0.46
479 0.55
480 0.62
481 0.65
482 0.72
483 0.76
484 0.81
485 0.89