Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0D1S2

Protein Details
Accession X0D1S2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-409AESKPSKKKGKKGSEDDDRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-401KPSKKKGKK
Subcellular Location(s) mito 24, cyto_mito 13.333, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004154  Anticodon-bd  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR015807  His-tRNA-ligase  
IPR041715  HisRS-like_core  
IPR033656  HisRS_anticodon  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004821  F:histidine-tRNA ligase activity  
GO:0006427  P:histidyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03129  HGTP_anticodon  
PF13393  tRNA-synt_His  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
CDD cd00773  HisRS-like_core  
cd00859  HisRS_anticodon  
Amino Acid Sequences MRPKSAPIKSLSLSRITARPLSSTPACRCPPSCLALTRRYRHSKFLSLDPSITVFSLPRYASSSSSPSNPTTTLESPTSLEMAPKNKFELKTPKGTKDWEGKDMVIRDHIFNTITQVFKRHGGVTIDTPVFELREILAGKYGEDSKLIYDLADQGGEICSLRYDLTVPFARFLAMNKQIQNIKRYHIAKVYRRDQPAMTKGRMREFYQCDFDIAGTYDPMLPDAEVIRIITEVFEGLGWNGGYTIKLNHRKILDGIFQVCGVPEDKIRTISSAVDKLDKLPWADVRKEMTEEKGLDGEVADRIGEWVVLKGKQDLLQKLQSTESLAANESMKKGMEDLALLFEYLEAFGCLDRVSFDLSLARGLDYYTGLIYEVVTQGSAPEVTPGQENAESKPSKKKGKKGSEDDDRSDDPTVGVGSVAAGGRYDNLVGMFSGKSQIPCVGISFGVDRIFSITKAKMAAEKNAAVRNNDVDVYVMAFGQGYLKERMSVCAKLWESGIKAEFLYKVKPKLPAQFKAAEANGVPFAIFLGEDEVKSGKVKIKEMGLQEGHPEKEGILVSMSDMAKEIKVRLQRKRELDEMTRQAEGLRVVHGIKGDEVKDTEKKVEDAKPETTPAAVEATPGTEEPAPSNPTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.38
4 0.4
5 0.34
6 0.35
7 0.32
8 0.37
9 0.39
10 0.44
11 0.45
12 0.5
13 0.51
14 0.53
15 0.53
16 0.53
17 0.52
18 0.48
19 0.48
20 0.47
21 0.5
22 0.55
23 0.63
24 0.62
25 0.67
26 0.72
27 0.7
28 0.72
29 0.72
30 0.71
31 0.66
32 0.68
33 0.66
34 0.59
35 0.56
36 0.49
37 0.43
38 0.35
39 0.31
40 0.22
41 0.15
42 0.13
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.19
47 0.21
48 0.22
49 0.26
50 0.29
51 0.27
52 0.31
53 0.33
54 0.32
55 0.33
56 0.31
57 0.3
58 0.31
59 0.3
60 0.3
61 0.28
62 0.28
63 0.26
64 0.26
65 0.25
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.25
70 0.27
71 0.27
72 0.31
73 0.35
74 0.36
75 0.41
76 0.47
77 0.47
78 0.54
79 0.59
80 0.61
81 0.6
82 0.63
83 0.62
84 0.61
85 0.6
86 0.54
87 0.51
88 0.45
89 0.46
90 0.45
91 0.39
92 0.35
93 0.32
94 0.28
95 0.27
96 0.27
97 0.22
98 0.19
99 0.23
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.22
104 0.23
105 0.25
106 0.28
107 0.23
108 0.24
109 0.25
110 0.27
111 0.27
112 0.32
113 0.29
114 0.26
115 0.25
116 0.21
117 0.19
118 0.16
119 0.13
120 0.07
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.18
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.13
153 0.18
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.19
160 0.22
161 0.23
162 0.27
163 0.27
164 0.32
165 0.36
166 0.4
167 0.43
168 0.37
169 0.34
170 0.38
171 0.39
172 0.38
173 0.4
174 0.45
175 0.48
176 0.56
177 0.59
178 0.59
179 0.6
180 0.59
181 0.54
182 0.53
183 0.54
184 0.51
185 0.47
186 0.44
187 0.45
188 0.49
189 0.5
190 0.44
191 0.44
192 0.43
193 0.44
194 0.44
195 0.41
196 0.35
197 0.32
198 0.29
199 0.22
200 0.17
201 0.13
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.09
232 0.16
233 0.25
234 0.26
235 0.3
236 0.31
237 0.32
238 0.33
239 0.34
240 0.3
241 0.23
242 0.23
243 0.2
244 0.19
245 0.18
246 0.16
247 0.13
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.1
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.19
265 0.18
266 0.16
267 0.15
268 0.19
269 0.2
270 0.22
271 0.23
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.23
276 0.2
277 0.2
278 0.2
279 0.18
280 0.16
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.1
299 0.14
300 0.18
301 0.19
302 0.21
303 0.25
304 0.25
305 0.25
306 0.25
307 0.21
308 0.18
309 0.18
310 0.14
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.09
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.2
378 0.2
379 0.22
380 0.31
381 0.36
382 0.44
383 0.5
384 0.57
385 0.6
386 0.7
387 0.78
388 0.78
389 0.8
390 0.8
391 0.79
392 0.74
393 0.68
394 0.58
395 0.5
396 0.42
397 0.33
398 0.22
399 0.17
400 0.14
401 0.08
402 0.07
403 0.05
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.12
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.14
440 0.13
441 0.14
442 0.16
443 0.16
444 0.19
445 0.2
446 0.25
447 0.25
448 0.28
449 0.31
450 0.35
451 0.36
452 0.31
453 0.31
454 0.28
455 0.25
456 0.22
457 0.18
458 0.14
459 0.12
460 0.12
461 0.1
462 0.08
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.08
468 0.1
469 0.12
470 0.12
471 0.15
472 0.16
473 0.2
474 0.22
475 0.24
476 0.22
477 0.28
478 0.28
479 0.26
480 0.27
481 0.26
482 0.23
483 0.25
484 0.25
485 0.17
486 0.17
487 0.18
488 0.2
489 0.19
490 0.24
491 0.26
492 0.3
493 0.33
494 0.4
495 0.44
496 0.5
497 0.57
498 0.56
499 0.56
500 0.56
501 0.54
502 0.53
503 0.48
504 0.4
505 0.32
506 0.28
507 0.23
508 0.18
509 0.16
510 0.09
511 0.09
512 0.07
513 0.07
514 0.05
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.12
520 0.12
521 0.14
522 0.16
523 0.17
524 0.21
525 0.24
526 0.26
527 0.31
528 0.36
529 0.38
530 0.43
531 0.39
532 0.36
533 0.39
534 0.4
535 0.36
536 0.31
537 0.28
538 0.2
539 0.22
540 0.21
541 0.16
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.17
546 0.17
547 0.13
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.16
552 0.17
553 0.18
554 0.27
555 0.35
556 0.44
557 0.53
558 0.6
559 0.66
560 0.71
561 0.71
562 0.7
563 0.68
564 0.69
565 0.66
566 0.6
567 0.53
568 0.46
569 0.4
570 0.35
571 0.31
572 0.22
573 0.16
574 0.15
575 0.16
576 0.17
577 0.18
578 0.17
579 0.17
580 0.21
581 0.2
582 0.21
583 0.23
584 0.27
585 0.3
586 0.32
587 0.34
588 0.32
589 0.34
590 0.37
591 0.42
592 0.44
593 0.44
594 0.46
595 0.44
596 0.44
597 0.43
598 0.37
599 0.31
600 0.24
601 0.23
602 0.18
603 0.16
604 0.13
605 0.14
606 0.15
607 0.15
608 0.16
609 0.14
610 0.15
611 0.16
612 0.22