Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H9M8

Protein Details
Accession C1H9M8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
478-504GSEPMGRGERTKKKRRFRSLSPLGGRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
484-496RGERTKKKRRFRS
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 2.5, cyto_nucl 2.5, nucl 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pbl:PAAG_07469  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MAPVYGYMTSYSPRLRQYANALLIPNIPPTQSTPGVRTTKRGTIAVNYAEDGYDDDDFEDSEGPRRPTGLRSLRREESQPDRGPAGEKIGTEISHPVNVQPNFRDWVVRRVSKPSKKQHLGVQVQLPLTLVPIRIDLEVPAFQPAEPFPLPRNYQELGLNPASQAYRKPDPAPPYRIKDSFLWNLHEALTTPEEFALTMVRDLDLPNPQAMAMAISNQLRQQLEEYAGVALHPLFQSLHQQQQQAITGNPHASISRDASATPGTTSAATPATLVDTPTGKGSVVVSSSQQPSLSDNELNPDDAYRCIVNLNINLQNRLYTDKFEWSLLHPQGLAEDFARVTCADLGLGPEWVCAIAHGIYEAVLKLKKEVCESGGLISGLGGYGNEIDNQAANGQEAGWRYDPDGLGDEWEPKVETLSKEEIEKREGDRERQLRRLRRETARFSSTSGIAPELSRQLSSSGGGGGGGGGVGYFDIPDGSEPMGRGERTKKKRRFRSLSPLGGRSGTPGRGTPDTGAGAGYGGGGGTLSDWFRQTWRCSHCAVWGTAVWAVRDGPAGPRTLCHNCGLLYERDKRLPVWSKGLHLHDVPVGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.36
4 0.42
5 0.47
6 0.47
7 0.46
8 0.43
9 0.4
10 0.41
11 0.37
12 0.32
13 0.24
14 0.19
15 0.17
16 0.21
17 0.26
18 0.29
19 0.3
20 0.3
21 0.38
22 0.46
23 0.46
24 0.49
25 0.48
26 0.5
27 0.51
28 0.5
29 0.44
30 0.42
31 0.47
32 0.45
33 0.4
34 0.33
35 0.3
36 0.27
37 0.25
38 0.2
39 0.15
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.1
48 0.15
49 0.21
50 0.23
51 0.23
52 0.25
53 0.26
54 0.28
55 0.38
56 0.43
57 0.46
58 0.52
59 0.6
60 0.63
61 0.64
62 0.64
63 0.61
64 0.59
65 0.6
66 0.56
67 0.52
68 0.48
69 0.45
70 0.44
71 0.39
72 0.36
73 0.28
74 0.23
75 0.23
76 0.24
77 0.23
78 0.21
79 0.24
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.19
84 0.26
85 0.28
86 0.31
87 0.29
88 0.3
89 0.31
90 0.31
91 0.36
92 0.29
93 0.37
94 0.41
95 0.45
96 0.44
97 0.51
98 0.61
99 0.63
100 0.71
101 0.73
102 0.76
103 0.75
104 0.77
105 0.75
106 0.75
107 0.71
108 0.66
109 0.61
110 0.54
111 0.48
112 0.44
113 0.36
114 0.25
115 0.21
116 0.17
117 0.12
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.17
136 0.24
137 0.26
138 0.27
139 0.32
140 0.27
141 0.29
142 0.3
143 0.29
144 0.28
145 0.28
146 0.26
147 0.2
148 0.21
149 0.2
150 0.18
151 0.19
152 0.19
153 0.22
154 0.25
155 0.29
156 0.32
157 0.4
158 0.47
159 0.52
160 0.53
161 0.55
162 0.58
163 0.56
164 0.53
165 0.49
166 0.48
167 0.47
168 0.43
169 0.4
170 0.35
171 0.35
172 0.32
173 0.29
174 0.23
175 0.17
176 0.16
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.06
200 0.06
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.14
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.13
224 0.15
225 0.22
226 0.24
227 0.25
228 0.25
229 0.28
230 0.29
231 0.24
232 0.23
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.13
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.13
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.13
298 0.17
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.2
305 0.17
306 0.14
307 0.15
308 0.17
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.24
314 0.22
315 0.21
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.1
353 0.13
354 0.15
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.19
359 0.2
360 0.18
361 0.17
362 0.16
363 0.13
364 0.12
365 0.1
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.03
370 0.03
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.07
383 0.08
384 0.1
385 0.11
386 0.11
387 0.12
388 0.15
389 0.15
390 0.14
391 0.16
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.15
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.1
400 0.11
401 0.13
402 0.13
403 0.16
404 0.19
405 0.2
406 0.23
407 0.28
408 0.29
409 0.28
410 0.3
411 0.28
412 0.33
413 0.36
414 0.36
415 0.41
416 0.47
417 0.51
418 0.57
419 0.64
420 0.64
421 0.7
422 0.74
423 0.73
424 0.75
425 0.77
426 0.76
427 0.75
428 0.71
429 0.63
430 0.56
431 0.51
432 0.42
433 0.35
434 0.28
435 0.21
436 0.17
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.16
441 0.14
442 0.14
443 0.13
444 0.14
445 0.14
446 0.12
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.04
454 0.03
455 0.02
456 0.02
457 0.02
458 0.02
459 0.02
460 0.02
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.06
465 0.07
466 0.08
467 0.09
468 0.12
469 0.16
470 0.17
471 0.21
472 0.29
473 0.39
474 0.48
475 0.59
476 0.65
477 0.72
478 0.83
479 0.9
480 0.89
481 0.89
482 0.89
483 0.89
484 0.89
485 0.85
486 0.77
487 0.68
488 0.6
489 0.5
490 0.43
491 0.38
492 0.29
493 0.24
494 0.24
495 0.27
496 0.28
497 0.3
498 0.26
499 0.25
500 0.24
501 0.22
502 0.2
503 0.15
504 0.13
505 0.11
506 0.09
507 0.05
508 0.04
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.05
514 0.06
515 0.08
516 0.09
517 0.1
518 0.14
519 0.2
520 0.24
521 0.31
522 0.37
523 0.39
524 0.41
525 0.42
526 0.46
527 0.45
528 0.42
529 0.37
530 0.32
531 0.31
532 0.3
533 0.3
534 0.23
535 0.19
536 0.18
537 0.15
538 0.15
539 0.14
540 0.17
541 0.18
542 0.21
543 0.2
544 0.21
545 0.28
546 0.33
547 0.34
548 0.31
549 0.31
550 0.29
551 0.33
552 0.35
553 0.35
554 0.37
555 0.43
556 0.46
557 0.48
558 0.49
559 0.46
560 0.52
561 0.54
562 0.52
563 0.54
564 0.51
565 0.53
566 0.59
567 0.62
568 0.57
569 0.48
570 0.45