Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H1L5

Protein Details
Accession C1H1L5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-254DPANTPGRKRYSKKPRAQPATSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
KEGG pbl:PAAG_04801  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MDLVQYSDSESDESPQTKAQPVTTPVRLLKRQRTDSGNNNNKEGDGRSGNSVLPPLPAEFLDLYATNSRVSVQDEPSLHDGRKRIIPHVVGNWPTHIYLEWYPAAPEVSTLEDVISRSGHELQNGLEIHSLLFSDLGAQMPLHISLSRPVALVTDDRQPFKDMLNDAIRDSDIRPFRVSTAGLDWVSNFERTRWFLILRVVKPAHNELNRLLVISNQSVAAFHQPPLYQSPDPANTPGRKRYSKKPRAQPATSDPVEDFSDYFHISIAWSLTEPSVEDKQRVASVELGKLKEVEILFHSVKVKIGNRVHNLELPTLILDENGFCGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.25
4 0.29
5 0.3
6 0.31
7 0.32
8 0.37
9 0.42
10 0.43
11 0.46
12 0.46
13 0.52
14 0.57
15 0.59
16 0.64
17 0.67
18 0.7
19 0.71
20 0.73
21 0.72
22 0.74
23 0.77
24 0.76
25 0.69
26 0.64
27 0.58
28 0.51
29 0.45
30 0.37
31 0.32
32 0.26
33 0.25
34 0.26
35 0.27
36 0.27
37 0.25
38 0.25
39 0.19
40 0.16
41 0.16
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.22
61 0.23
62 0.26
63 0.3
64 0.31
65 0.28
66 0.28
67 0.27
68 0.25
69 0.3
70 0.29
71 0.28
72 0.31
73 0.33
74 0.34
75 0.37
76 0.4
77 0.37
78 0.36
79 0.34
80 0.3
81 0.27
82 0.23
83 0.18
84 0.16
85 0.14
86 0.16
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.09
103 0.07
104 0.08
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.07
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.16
142 0.17
143 0.18
144 0.19
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.21
149 0.14
150 0.17
151 0.2
152 0.2
153 0.18
154 0.18
155 0.17
156 0.14
157 0.14
158 0.16
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.18
166 0.13
167 0.13
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.13
176 0.1
177 0.13
178 0.15
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.24
184 0.3
185 0.28
186 0.33
187 0.31
188 0.31
189 0.32
190 0.35
191 0.35
192 0.3
193 0.31
194 0.25
195 0.29
196 0.28
197 0.26
198 0.22
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.14
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.17
213 0.2
214 0.25
215 0.2
216 0.21
217 0.25
218 0.25
219 0.26
220 0.28
221 0.32
222 0.32
223 0.37
224 0.43
225 0.46
226 0.52
227 0.55
228 0.63
229 0.68
230 0.73
231 0.78
232 0.8
233 0.83
234 0.84
235 0.83
236 0.79
237 0.75
238 0.74
239 0.64
240 0.55
241 0.44
242 0.38
243 0.35
244 0.29
245 0.2
246 0.13
247 0.15
248 0.14
249 0.13
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.12
262 0.19
263 0.2
264 0.21
265 0.22
266 0.24
267 0.26
268 0.28
269 0.25
270 0.24
271 0.26
272 0.31
273 0.35
274 0.34
275 0.32
276 0.3
277 0.29
278 0.27
279 0.23
280 0.19
281 0.16
282 0.22
283 0.22
284 0.24
285 0.26
286 0.22
287 0.25
288 0.29
289 0.3
290 0.34
291 0.4
292 0.46
293 0.51
294 0.55
295 0.56
296 0.54
297 0.53
298 0.45
299 0.38
300 0.3
301 0.24
302 0.2
303 0.16
304 0.12
305 0.1
306 0.09