Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0CY42

Protein Details
Accession X0CY42    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
454-477ERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGABasic
495-516PEAPKAMTKKEMKKNQQMKAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
462-469LRKRQKRK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQPQTQVQVPPRAFSPPQHSPSPAASQSSFALPPQKRARTDGPSSQPESPYATSPYAASPGATATPPAGAGSPAFAQSPALPQPYATPYTNGHTTPGLNLPDVRPNSTPPIQQTQQLQQPIPQYTNATMTPVPVPTPGQLMTPTPGPGVMGPPQRPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMNDLYATGFDEARTGFAHQPPGPKSSFYGAGPANQPAQSVPDQPQDQFAAQQAERAWSESSMRLALQRTQEISDPFLLVALLHRRADKIAREHHLALNLDLKNNSQTMGKMRLPEQFPAPKVTVKVTPGPDSTMVHTTGSYIPHDAFLVDQLALMSIATKQRLRELVEDAHVVATNRQKTSHGDIPEEWTPAAAPMNAEPLEPIEKPADAVNGVDGTHVESANGDSTNPLKRSSDAAGLTNGAPPVKLPKVSSYMTTTMRDLARQERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGATTSRAGSVAPGTPGAVAPEAPKAMTKKEMKKNQQMKAAEIDSHQSQNTTSSLFAGFGGKSGLFGKKKAGKTYDWMTRGSGTSTPTRNAPGAGKGPGGLGAAPAPANMAMTTEGRNRLGTWREDKEKGRNIQLRDWVSVLERDGREGKALQKAYLYLDASNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.44
4 0.4
5 0.43
6 0.43
7 0.48
8 0.5
9 0.52
10 0.49
11 0.52
12 0.53
13 0.47
14 0.42
15 0.37
16 0.35
17 0.34
18 0.34
19 0.3
20 0.24
21 0.31
22 0.27
23 0.36
24 0.44
25 0.5
26 0.49
27 0.55
28 0.62
29 0.6
30 0.66
31 0.66
32 0.65
33 0.65
34 0.66
35 0.64
36 0.58
37 0.51
38 0.49
39 0.41
40 0.36
41 0.33
42 0.29
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.22
47 0.2
48 0.17
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.16
69 0.18
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.22
74 0.26
75 0.29
76 0.26
77 0.25
78 0.25
79 0.3
80 0.33
81 0.3
82 0.27
83 0.24
84 0.24
85 0.24
86 0.27
87 0.24
88 0.21
89 0.23
90 0.23
91 0.29
92 0.3
93 0.31
94 0.27
95 0.29
96 0.35
97 0.37
98 0.38
99 0.35
100 0.42
101 0.4
102 0.42
103 0.44
104 0.44
105 0.47
106 0.48
107 0.43
108 0.39
109 0.43
110 0.42
111 0.38
112 0.33
113 0.29
114 0.25
115 0.29
116 0.25
117 0.23
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.16
125 0.13
126 0.16
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.13
139 0.17
140 0.22
141 0.22
142 0.27
143 0.3
144 0.32
145 0.33
146 0.35
147 0.39
148 0.38
149 0.4
150 0.42
151 0.46
152 0.46
153 0.46
154 0.43
155 0.39
156 0.35
157 0.32
158 0.26
159 0.19
160 0.18
161 0.16
162 0.14
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.15
192 0.2
193 0.21
194 0.28
195 0.29
196 0.32
197 0.3
198 0.28
199 0.27
200 0.25
201 0.26
202 0.19
203 0.23
204 0.19
205 0.21
206 0.22
207 0.22
208 0.21
209 0.18
210 0.18
211 0.13
212 0.16
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.21
217 0.23
218 0.23
219 0.25
220 0.23
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.18
225 0.17
226 0.19
227 0.17
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.16
232 0.12
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.14
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.21
246 0.2
247 0.2
248 0.17
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.15
261 0.18
262 0.2
263 0.23
264 0.28
265 0.31
266 0.34
267 0.36
268 0.36
269 0.36
270 0.32
271 0.27
272 0.27
273 0.24
274 0.21
275 0.19
276 0.18
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.09
281 0.09
282 0.12
283 0.18
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.26
288 0.27
289 0.28
290 0.29
291 0.27
292 0.26
293 0.28
294 0.27
295 0.23
296 0.22
297 0.23
298 0.21
299 0.19
300 0.23
301 0.21
302 0.23
303 0.22
304 0.22
305 0.21
306 0.2
307 0.19
308 0.16
309 0.15
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.13
337 0.16
338 0.18
339 0.19
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.22
344 0.19
345 0.17
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.15
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.19
354 0.21
355 0.28
356 0.31
357 0.28
358 0.27
359 0.27
360 0.31
361 0.32
362 0.29
363 0.22
364 0.16
365 0.14
366 0.12
367 0.12
368 0.08
369 0.06
370 0.06
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.1
376 0.12
377 0.12
378 0.13
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.09
398 0.09
399 0.07
400 0.07
401 0.1
402 0.15
403 0.16
404 0.17
405 0.16
406 0.18
407 0.21
408 0.23
409 0.25
410 0.21
411 0.22
412 0.21
413 0.21
414 0.21
415 0.19
416 0.17
417 0.11
418 0.1
419 0.09
420 0.13
421 0.14
422 0.16
423 0.15
424 0.19
425 0.24
426 0.25
427 0.27
428 0.26
429 0.28
430 0.3
431 0.3
432 0.27
433 0.27
434 0.26
435 0.25
436 0.23
437 0.26
438 0.29
439 0.29
440 0.32
441 0.3
442 0.34
443 0.34
444 0.35
445 0.35
446 0.36
447 0.4
448 0.46
449 0.53
450 0.58
451 0.67
452 0.73
453 0.77
454 0.82
455 0.86
456 0.87
457 0.87
458 0.84
459 0.78
460 0.69
461 0.61
462 0.53
463 0.44
464 0.34
465 0.26
466 0.19
467 0.16
468 0.14
469 0.11
470 0.09
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.11
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.14
486 0.14
487 0.17
488 0.25
489 0.32
490 0.4
491 0.5
492 0.6
493 0.66
494 0.75
495 0.82
496 0.81
497 0.81
498 0.73
499 0.66
500 0.62
501 0.55
502 0.46
503 0.37
504 0.34
505 0.28
506 0.29
507 0.26
508 0.19
509 0.17
510 0.18
511 0.18
512 0.15
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.1
521 0.12
522 0.1
523 0.11
524 0.13
525 0.2
526 0.19
527 0.21
528 0.29
529 0.36
530 0.41
531 0.48
532 0.5
533 0.45
534 0.5
535 0.58
536 0.58
537 0.52
538 0.49
539 0.43
540 0.41
541 0.39
542 0.35
543 0.29
544 0.23
545 0.28
546 0.3
547 0.3
548 0.3
549 0.32
550 0.3
551 0.31
552 0.3
553 0.29
554 0.3
555 0.3
556 0.28
557 0.25
558 0.24
559 0.22
560 0.2
561 0.14
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.08
567 0.08
568 0.07
569 0.08
570 0.07
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.14
575 0.18
576 0.22
577 0.23
578 0.24
579 0.24
580 0.29
581 0.34
582 0.38
583 0.41
584 0.46
585 0.51
586 0.58
587 0.63
588 0.66
589 0.69
590 0.68
591 0.71
592 0.69
593 0.67
594 0.68
595 0.71
596 0.64
597 0.58
598 0.52
599 0.43
600 0.39
601 0.36
602 0.31
603 0.3
604 0.26
605 0.28
606 0.31
607 0.3
608 0.31
609 0.31
610 0.34
611 0.35
612 0.37
613 0.33
614 0.32
615 0.33
616 0.34
617 0.36
618 0.32
619 0.25