FuNGI

X0D8S6

Protein Details

Accession

X0D8S6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
401-456	SWSKNKPQPPAGNKSNKKKNEAKGNGSPKWKQDKQQSHNKGEKRRRSNSPNETESP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
406-447	KPQPPAGNKSNKKKNEAKGNGSPKWKQDKQQSHNKGEKRRRS

Subcellular Location(s)

mito 18, mito_nucl 13.166, cyto_mito 10.666, nucl 7, cyto_nucl 5.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR014780 tRNA_psdUridine_synth_TruB
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01509 TruB_N
CDD	cd02867 PseudoU_synth_TruB_4

Amino Acid Sequences

MRLPRKTLKMAADKVREGVFAINKPCGQSSAQVIRECQQAFNPSSFFKPLIDSEVAKRISESGKEFARRKLIKKASQVKIGHGGTLDPLATGVLILGIGSATKSLPQFLECTKTYETIVVFGAATDTYDRVGRILTKRPYEHITREKVEKELETFRGRQMQIPPLYSALKMNGKPLYEYAREGKPIPRQIEGREVEVKDIELVEWYEPGKHNHRWPTEEAEAAERNLAEQVWRVKKQQETNKKLSPEEKQQDDKAIAAHESFKRSFEERQDALIKDAPSKRSRKSKEPPMMSGALGQLPQPTYSNKGSNLVPESPDTSTPPPWSDQGPPAVKVRLTVTSGFYVRSFCHDLGAKLDSAALMAELARTRQSDFEVGNDNCLEYEDLAKGEEVWGPQVARMLESWSKNKPQPPAGNKSNKKKNEAKGNGSPKWKQDKQQSHNKGEKRRRSNSPNETESPPRKAIALESQEDSKPVKEPKSETPKSETANRSEDEKSWNGIED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.56
3	0.47
4	0.38
5	0.36
6	0.32
7	0.31
8	0.32
9	0.34
10	0.34
11	0.35
12	0.35
13	0.31
14	0.27
15	0.25
16	0.31
17	0.35
18	0.4
19	0.41
20	0.42
21	0.43
22	0.48
23	0.45
24	0.38
25	0.33
26	0.34
27	0.34
28	0.35
29	0.35
30	0.29
31	0.32
32	0.33
33	0.29
34	0.23
35	0.24
36	0.22
37	0.26
38	0.27
39	0.26
40	0.27
41	0.35
42	0.35
43	0.31
44	0.3
45	0.28
46	0.28
47	0.31
48	0.31
49	0.28
50	0.34
51	0.42
52	0.45
53	0.47
54	0.54
55	0.56
56	0.56
57	0.61
58	0.64
59	0.65
60	0.72
61	0.77
62	0.73
63	0.76
64	0.73
65	0.67
66	0.66
67	0.58
68	0.49
69	0.38
70	0.32
71	0.23
72	0.23
73	0.18
74	0.09
75	0.08
76	0.07
77	0.06
78	0.06
79	0.04
80	0.03
81	0.03
82	0.03
83	0.03
84	0.02
85	0.03
86	0.03
87	0.03
88	0.04
89	0.06
90	0.07
91	0.09
92	0.1
93	0.11
94	0.14
95	0.15
96	0.22
97	0.2
98	0.24
99	0.25
100	0.25
101	0.25
102	0.25
103	0.23
104	0.18
105	0.18
106	0.14
107	0.12
108	0.1
109	0.1
110	0.07
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.08
117	0.07
118	0.09
119	0.14
120	0.18
121	0.26
122	0.32
123	0.37
124	0.39
125	0.43
126	0.46
127	0.47
128	0.51
129	0.51
130	0.51
131	0.49
132	0.53
133	0.5
134	0.48
135	0.45
136	0.37
137	0.33
138	0.31
139	0.32
140	0.31
141	0.31
142	0.3
143	0.36
144	0.35
145	0.35
146	0.35
147	0.38
148	0.37
149	0.37
150	0.36
151	0.3
152	0.31
153	0.27
154	0.23
155	0.19
156	0.22
157	0.21
158	0.24
159	0.24
160	0.23
161	0.24
162	0.25
163	0.26
164	0.22
165	0.24
166	0.24
167	0.24
168	0.25
169	0.26
170	0.29
171	0.31
172	0.36
173	0.36
174	0.36
175	0.35
176	0.36
177	0.43
178	0.39
179	0.36
180	0.34
181	0.32
182	0.29
183	0.27
184	0.25
185	0.16
186	0.15
187	0.11
188	0.06
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.08
194	0.1
195	0.14
196	0.19
197	0.23
198	0.29
199	0.36
200	0.39
201	0.41
202	0.42
203	0.45
204	0.41
205	0.38
206	0.32
207	0.28
208	0.25
209	0.22
210	0.19
211	0.12
212	0.11
213	0.1
214	0.09
215	0.05
216	0.07
217	0.14
218	0.2
219	0.22
220	0.24
221	0.28
222	0.33
223	0.41
224	0.48
225	0.52
226	0.54
227	0.6
228	0.63
229	0.61
230	0.58
231	0.54
232	0.49
233	0.48
234	0.46
235	0.44
236	0.42
237	0.41
238	0.41
239	0.37
240	0.32
241	0.23
242	0.18
243	0.13
244	0.1
245	0.14
246	0.13
247	0.16
248	0.16
249	0.17
250	0.18
251	0.2
252	0.23
253	0.24
254	0.29
255	0.26
256	0.3
257	0.32
258	0.3
259	0.3
260	0.31
261	0.26
262	0.25
263	0.27
264	0.28
265	0.31
266	0.35
267	0.4
268	0.46
269	0.51
270	0.55
271	0.61
272	0.67
273	0.7
274	0.7
275	0.67
276	0.62
277	0.58
278	0.48
279	0.4
280	0.3
281	0.21
282	0.17
283	0.14
284	0.1
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.14
290	0.17
291	0.19
292	0.19
293	0.22
294	0.21
295	0.24
296	0.27
297	0.23
298	0.21
299	0.19
300	0.21
301	0.19
302	0.19
303	0.19
304	0.18
305	0.19
306	0.2
307	0.2
308	0.2
309	0.2
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.28
314	0.28
315	0.28
316	0.29
317	0.3
318	0.27
319	0.25
320	0.24
321	0.2
322	0.2
323	0.19
324	0.19
325	0.2
326	0.21
327	0.2
328	0.18
329	0.17
330	0.15
331	0.19
332	0.2
333	0.17
334	0.2
335	0.21
336	0.21
337	0.23
338	0.24
339	0.19
340	0.15
341	0.15
342	0.11
343	0.1
344	0.09
345	0.06
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.08
352	0.09
353	0.1
354	0.11
355	0.13
356	0.15
357	0.15
358	0.17
359	0.25
360	0.24
361	0.26
362	0.24
363	0.22
364	0.19
365	0.2
366	0.17
367	0.09
368	0.11
369	0.09
370	0.09
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.11
376	0.09
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.12
381	0.15
382	0.14
383	0.13
384	0.13
385	0.17
386	0.2
387	0.25
388	0.29
389	0.31
390	0.38
391	0.42
392	0.47
393	0.49
394	0.53
395	0.59
396	0.62
397	0.66
398	0.69
399	0.75
400	0.79
401	0.83
402	0.84
403	0.81
404	0.81
405	0.8
406	0.79
407	0.8
408	0.79
409	0.77
410	0.77
411	0.8
412	0.78
413	0.77
414	0.72
415	0.7
416	0.72
417	0.69
418	0.67
419	0.68
420	0.73
421	0.73
422	0.8
423	0.81
424	0.8
425	0.84
426	0.83
427	0.83
428	0.83
429	0.85
430	0.84
431	0.83
432	0.84
433	0.84
434	0.87
435	0.87
436	0.86
437	0.83
438	0.77
439	0.74
440	0.74
441	0.71
442	0.67
443	0.58
444	0.49
445	0.43
446	0.39
447	0.38
448	0.38
449	0.38
450	0.34
451	0.35
452	0.38
453	0.38
454	0.39
455	0.36
456	0.28
457	0.28
458	0.31
459	0.35
460	0.37
461	0.42
462	0.51
463	0.6
464	0.64
465	0.62
466	0.63
467	0.64
468	0.62
469	0.67
470	0.62
471	0.57
472	0.58
473	0.55
474	0.51
475	0.47
476	0.46
477	0.43
478	0.4
479	0.38

X0D8S6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer