Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H8P1

Protein Details
Accession C1H8P1    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-99SAPQRRDAEQEPRHRKRRRIAGENDTDRDBasic
265-303LRDLKKEGERKQKRYSSRHRKERRQRRRRGSDASRDSLEBasic
315-369ENGRERESSKKRDSHRERRDRSRDRSSRHSRSHNDRHSHRSSRNHDKERGKRSSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-89QEPRHRKRRR
244-294IHQLKAVEKERKKWEEERREELRDLKKEGERKQKRYSSRHRKERRQRRRRG
320-366RESSKKRDSHRERRDRSRDRSSRHSRSHNDRHSHRSSRNHDKERGKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pbl:PAAG_07132  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MVLHLLGKKSWNVYNTDNISRVRRDEAEAKAREQEEQRRLQKANAEKRIQILRGLRSPSNSPPLSLEAKPSAPQRRDAEQEPRHRKRRRIAGENDTDRDIRFAREDAQRAEATREEDVVLFRKEAKDAPLIDESGHINLFPPSAAANDPSGNSGKNLGIEMEAARKKREYEDQYTMRFSNAAGFQQSLDKNPWYSSSNVDIAAQTAEDMLPNKDVWGNEDPRRQERERERINSNDPLAAMKKGIHQLKAVEKERKKWEEERREELRDLKKEGERKQKRYSSRHRKERRQRRRRGSDASRDSLEGFSLDADIPLAENGRERESSKKRDSHRERRDRSRDRSSRHSRSHNDRHSHRSSRNHDKERGKRSSGDDQSSGWVPAPGKRYSAQFANV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.47
4 0.47
5 0.46
6 0.49
7 0.47
8 0.47
9 0.43
10 0.39
11 0.4
12 0.43
13 0.47
14 0.51
15 0.51
16 0.5
17 0.51
18 0.49
19 0.49
20 0.49
21 0.51
22 0.49
23 0.56
24 0.6
25 0.6
26 0.62
27 0.6
28 0.61
29 0.61
30 0.63
31 0.63
32 0.61
33 0.56
34 0.6
35 0.63
36 0.57
37 0.53
38 0.48
39 0.45
40 0.47
41 0.5
42 0.46
43 0.43
44 0.46
45 0.46
46 0.48
47 0.42
48 0.37
49 0.34
50 0.37
51 0.38
52 0.35
53 0.33
54 0.28
55 0.29
56 0.32
57 0.37
58 0.42
59 0.39
60 0.46
61 0.46
62 0.48
63 0.52
64 0.54
65 0.57
66 0.56
67 0.65
68 0.69
69 0.74
70 0.78
71 0.81
72 0.83
73 0.82
74 0.84
75 0.83
76 0.82
77 0.81
78 0.81
79 0.84
80 0.82
81 0.74
82 0.66
83 0.56
84 0.46
85 0.4
86 0.3
87 0.22
88 0.17
89 0.16
90 0.2
91 0.25
92 0.29
93 0.28
94 0.32
95 0.31
96 0.3
97 0.31
98 0.28
99 0.24
100 0.21
101 0.19
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.16
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.19
115 0.23
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.19
121 0.15
122 0.14
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.18
153 0.19
154 0.22
155 0.3
156 0.3
157 0.34
158 0.42
159 0.46
160 0.47
161 0.49
162 0.46
163 0.37
164 0.31
165 0.23
166 0.19
167 0.15
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.16
173 0.17
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.17
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.13
189 0.11
190 0.09
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.17
204 0.21
205 0.25
206 0.3
207 0.33
208 0.36
209 0.42
210 0.4
211 0.43
212 0.47
213 0.52
214 0.56
215 0.58
216 0.57
217 0.56
218 0.59
219 0.55
220 0.47
221 0.38
222 0.3
223 0.27
224 0.24
225 0.2
226 0.16
227 0.12
228 0.15
229 0.2
230 0.23
231 0.22
232 0.22
233 0.25
234 0.32
235 0.4
236 0.42
237 0.45
238 0.45
239 0.52
240 0.6
241 0.6
242 0.58
243 0.59
244 0.63
245 0.65
246 0.69
247 0.7
248 0.67
249 0.67
250 0.64
251 0.63
252 0.6
253 0.54
254 0.5
255 0.47
256 0.46
257 0.49
258 0.55
259 0.59
260 0.6
261 0.63
262 0.7
263 0.72
264 0.77
265 0.8
266 0.83
267 0.83
268 0.85
269 0.88
270 0.89
271 0.92
272 0.94
273 0.95
274 0.95
275 0.94
276 0.94
277 0.95
278 0.95
279 0.92
280 0.91
281 0.9
282 0.89
283 0.86
284 0.8
285 0.7
286 0.6
287 0.53
288 0.43
289 0.33
290 0.22
291 0.14
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.09
303 0.11
304 0.14
305 0.16
306 0.17
307 0.27
308 0.36
309 0.45
310 0.5
311 0.56
312 0.61
313 0.7
314 0.8
315 0.81
316 0.83
317 0.85
318 0.85
319 0.89
320 0.93
321 0.92
322 0.9
323 0.9
324 0.87
325 0.83
326 0.85
327 0.85
328 0.84
329 0.83
330 0.84
331 0.82
332 0.84
333 0.88
334 0.87
335 0.86
336 0.82
337 0.82
338 0.82
339 0.81
340 0.79
341 0.78
342 0.78
343 0.79
344 0.83
345 0.83
346 0.83
347 0.85
348 0.87
349 0.86
350 0.86
351 0.79
352 0.74
353 0.72
354 0.74
355 0.71
356 0.68
357 0.59
358 0.52
359 0.51
360 0.47
361 0.41
362 0.31
363 0.26
364 0.21
365 0.25
366 0.29
367 0.26
368 0.28
369 0.3
370 0.34
371 0.36