Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0BQM2

Protein Details
Accession X0BQM2    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-108ADGEAPKKPREGRRDKKRRDRDEDVDMDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-100KATKRKRADGEAPKKPREGRRDKKRRD
114-142GKKSRRSRRAAGDGERRQRSKPASPEPEK
163-175AIKKPSGLKRRKK
422-426KSKKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSERDSPIGEHANEPVNDGQEQEYEDAVAAADSDRDSDALSEVDEDQFEDYDPETANIEDRPVDIDEDVARTLKATKRKRADGEAPKKPREGRRDKKRRDRDEDVDMDDAEDGGKKSRRSRRAAGDGERRQRSKPASPEPEKEENLTPAERKQRELDRMIDAAIKKPSGLKRRKKDEIDLEDEIDDLLADLKVQMEQACQADNQAREAGQPALHKLKLLPEVTAILNRNNVQHAVLDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFNALAKMNIEKEALLSSGIGRVVVFYTRSKKPEPSIKRIATRLLGEWSRPILKRTDDYKKRQIETRDYDYESAKMAQRQKTSSQFSLSQRPAVNAKDAERERLLAPSRGNNSARMVNLPSSYTVAPQSTFMGSQNSSHRPLGAGGMEAFRKMAQKSKKRAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.26
4 0.25
5 0.25
6 0.23
7 0.18
8 0.2
9 0.18
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.12
14 0.1
15 0.08
16 0.06
17 0.05
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.13
44 0.12
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.16
60 0.2
61 0.28
62 0.36
63 0.45
64 0.53
65 0.62
66 0.67
67 0.71
68 0.76
69 0.77
70 0.79
71 0.8
72 0.79
73 0.74
74 0.74
75 0.72
76 0.71
77 0.7
78 0.71
79 0.71
80 0.75
81 0.82
82 0.88
83 0.92
84 0.94
85 0.94
86 0.92
87 0.9
88 0.85
89 0.83
90 0.76
91 0.68
92 0.59
93 0.48
94 0.39
95 0.3
96 0.23
97 0.14
98 0.11
99 0.08
100 0.12
101 0.16
102 0.19
103 0.28
104 0.38
105 0.46
106 0.52
107 0.6
108 0.65
109 0.71
110 0.75
111 0.75
112 0.76
113 0.76
114 0.78
115 0.77
116 0.69
117 0.6
118 0.59
119 0.56
120 0.53
121 0.54
122 0.55
123 0.58
124 0.62
125 0.66
126 0.67
127 0.68
128 0.61
129 0.55
130 0.47
131 0.39
132 0.36
133 0.32
134 0.26
135 0.24
136 0.33
137 0.31
138 0.31
139 0.35
140 0.39
141 0.43
142 0.46
143 0.44
144 0.38
145 0.37
146 0.35
147 0.33
148 0.26
149 0.24
150 0.22
151 0.18
152 0.15
153 0.2
154 0.26
155 0.33
156 0.42
157 0.49
158 0.57
159 0.66
160 0.75
161 0.74
162 0.75
163 0.75
164 0.71
165 0.68
166 0.59
167 0.51
168 0.42
169 0.38
170 0.3
171 0.19
172 0.12
173 0.05
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.17
204 0.21
205 0.21
206 0.18
207 0.15
208 0.17
209 0.17
210 0.2
211 0.17
212 0.12
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.14
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.18
281 0.22
282 0.26
283 0.29
284 0.33
285 0.39
286 0.48
287 0.52
288 0.55
289 0.61
290 0.63
291 0.65
292 0.63
293 0.61
294 0.53
295 0.47
296 0.4
297 0.36
298 0.31
299 0.26
300 0.26
301 0.25
302 0.28
303 0.27
304 0.27
305 0.25
306 0.27
307 0.33
308 0.39
309 0.47
310 0.5
311 0.58
312 0.66
313 0.69
314 0.69
315 0.7
316 0.69
317 0.68
318 0.67
319 0.66
320 0.62
321 0.57
322 0.56
323 0.5
324 0.44
325 0.36
326 0.31
327 0.26
328 0.27
329 0.31
330 0.36
331 0.39
332 0.42
333 0.47
334 0.53
335 0.57
336 0.54
337 0.51
338 0.52
339 0.52
340 0.58
341 0.53
342 0.5
343 0.44
344 0.44
345 0.44
346 0.39
347 0.4
348 0.33
349 0.34
350 0.37
351 0.37
352 0.39
353 0.36
354 0.37
355 0.31
356 0.35
357 0.36
358 0.31
359 0.33
360 0.36
361 0.38
362 0.44
363 0.44
364 0.4
365 0.41
366 0.41
367 0.39
368 0.34
369 0.33
370 0.29
371 0.29
372 0.27
373 0.24
374 0.23
375 0.22
376 0.21
377 0.21
378 0.19
379 0.19
380 0.18
381 0.19
382 0.18
383 0.18
384 0.18
385 0.2
386 0.19
387 0.23
388 0.3
389 0.33
390 0.35
391 0.35
392 0.34
393 0.31
394 0.31
395 0.31
396 0.24
397 0.21
398 0.18
399 0.21
400 0.21
401 0.2
402 0.19
403 0.17
404 0.2
405 0.19
406 0.27
407 0.34
408 0.43