Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H0T5

Protein Details
Accession C1H0T5    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-43PTPADPPSKKSKKSVSKPAKTHENENHydrophilic
115-137INKDLGKPSKKKSKKGAEAHTASHydrophilic
227-250AIPDAKQLKRRLRKMKKTGTETQEHydrophilic
444-474EEVKPAPIKAKKDKKEKKAEKKDTPVKDVKEBasic
479-507KDVEQKKDGKASPKDKKVKVDTPEKPGKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-53KKDKKRKAAVTSAPTPADPPSKKSKKSVSKPAKTHENENVPKPILKKSK
113-130KPINKDLGKPSKKKSKKG
224-243KIPAIPDAKQLKRRLRKMKK
343-372RRFKKTPWNAIERRRLDAGKTKEQWARKIK
448-527PAPIKAKKDKKEKKAEKKDTPVKDVKEGKKTKDVEQKKDGKASPKDKKVKVDTPEKPGKEKKIKASLAAAAARRSEKKSN
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbl:PAAG_04379  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAVEKKDKKRKAAVTSAPTPADPPSKKSKKSVSKPAKTHENENVPKPILKKSKSAEATNGDSPKAVPVKVTSAPARQIRPRKRAADFLSEEEEEGDREESKKKPVMSSPIATKPINKDLGKPSKKKSKKGAEAHTASASSTKQAATNVDTEKEILSTSKVSKKSKIDIKPSKEIHTQIADDENEGSAAEEDNDDDDQTAALIQGFESSGDEDVSGDEGFAPGKKIPAIPDAKQLKRRLRKMKKTGTETQEPGTIYVGRVPHGFYEHEMRAYFSQFGPITRLRLSRNRTTGRSKHFAFIEFASSSVAQIVADTMDNYLMFGHILKCKFVPQENVHPQLWKGANRRFKKTPWNAIERRRLDAGKTKEQWARKIKQEETRRVARVEKMKELGYEFEMPVLKGVEEVVVVRDVEGKGQGEVEGAEEPAAIEASQKEAEKAELVSGVVEEVKPAPIKAKKDKKEKKAEKKDTPVKDVKEGKKTKDVEQKKDGKASPKDKKVKVDTPEKPGKEKKIKASLAAAAARRSEKKSNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.76
4 0.67
5 0.58
6 0.5
7 0.44
8 0.44
9 0.38
10 0.37
11 0.42
12 0.5
13 0.55
14 0.62
15 0.68
16 0.7
17 0.77
18 0.83
19 0.83
20 0.84
21 0.87
22 0.87
23 0.87
24 0.8
25 0.78
26 0.76
27 0.76
28 0.72
29 0.69
30 0.67
31 0.59
32 0.59
33 0.53
34 0.53
35 0.52
36 0.5
37 0.52
38 0.5
39 0.58
40 0.6
41 0.61
42 0.59
43 0.55
44 0.58
45 0.56
46 0.54
47 0.44
48 0.38
49 0.35
50 0.34
51 0.31
52 0.25
53 0.19
54 0.2
55 0.25
56 0.27
57 0.32
58 0.3
59 0.31
60 0.39
61 0.43
62 0.47
63 0.5
64 0.58
65 0.63
66 0.68
67 0.72
68 0.73
69 0.71
70 0.74
71 0.71
72 0.7
73 0.64
74 0.59
75 0.55
76 0.48
77 0.43
78 0.35
79 0.3
80 0.2
81 0.18
82 0.15
83 0.11
84 0.12
85 0.17
86 0.19
87 0.25
88 0.3
89 0.3
90 0.34
91 0.39
92 0.46
93 0.48
94 0.51
95 0.51
96 0.53
97 0.56
98 0.51
99 0.49
100 0.46
101 0.47
102 0.5
103 0.44
104 0.42
105 0.48
106 0.58
107 0.63
108 0.64
109 0.65
110 0.68
111 0.75
112 0.78
113 0.79
114 0.79
115 0.8
116 0.83
117 0.84
118 0.83
119 0.79
120 0.73
121 0.64
122 0.53
123 0.43
124 0.36
125 0.26
126 0.17
127 0.15
128 0.13
129 0.12
130 0.13
131 0.16
132 0.15
133 0.2
134 0.21
135 0.2
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.16
140 0.14
141 0.1
142 0.09
143 0.11
144 0.16
145 0.22
146 0.28
147 0.31
148 0.38
149 0.42
150 0.49
151 0.56
152 0.59
153 0.63
154 0.66
155 0.7
156 0.72
157 0.7
158 0.67
159 0.63
160 0.57
161 0.5
162 0.43
163 0.37
164 0.29
165 0.3
166 0.25
167 0.2
168 0.19
169 0.14
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.1
213 0.17
214 0.21
215 0.21
216 0.3
217 0.37
218 0.4
219 0.47
220 0.52
221 0.55
222 0.6
223 0.68
224 0.7
225 0.73
226 0.8
227 0.83
228 0.86
229 0.85
230 0.83
231 0.82
232 0.77
233 0.72
234 0.63
235 0.53
236 0.47
237 0.38
238 0.31
239 0.24
240 0.18
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.11
250 0.09
251 0.14
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.1
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.18
267 0.21
268 0.2
269 0.27
270 0.33
271 0.36
272 0.43
273 0.45
274 0.48
275 0.54
276 0.57
277 0.57
278 0.58
279 0.53
280 0.49
281 0.45
282 0.42
283 0.36
284 0.29
285 0.26
286 0.19
287 0.18
288 0.15
289 0.13
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.07
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.16
313 0.18
314 0.21
315 0.26
316 0.27
317 0.37
318 0.44
319 0.48
320 0.46
321 0.44
322 0.41
323 0.4
324 0.39
325 0.35
326 0.35
327 0.37
328 0.46
329 0.5
330 0.58
331 0.56
332 0.57
333 0.62
334 0.64
335 0.67
336 0.65
337 0.7
338 0.7
339 0.74
340 0.79
341 0.71
342 0.65
343 0.58
344 0.52
345 0.45
346 0.47
347 0.45
348 0.45
349 0.45
350 0.48
351 0.49
352 0.52
353 0.58
354 0.58
355 0.57
356 0.56
357 0.62
358 0.62
359 0.66
360 0.72
361 0.72
362 0.7
363 0.72
364 0.66
365 0.6
366 0.58
367 0.55
368 0.54
369 0.49
370 0.48
371 0.43
372 0.41
373 0.4
374 0.38
375 0.33
376 0.27
377 0.25
378 0.2
379 0.2
380 0.19
381 0.18
382 0.17
383 0.16
384 0.12
385 0.09
386 0.09
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.11
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.12
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.09
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.15
423 0.13
424 0.11
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.19
437 0.23
438 0.32
439 0.42
440 0.52
441 0.58
442 0.69
443 0.79
444 0.82
445 0.88
446 0.91
447 0.92
448 0.93
449 0.94
450 0.93
451 0.94
452 0.93
453 0.89
454 0.87
455 0.84
456 0.77
457 0.75
458 0.75
459 0.72
460 0.73
461 0.72
462 0.68
463 0.69
464 0.69
465 0.69
466 0.7
467 0.71
468 0.69
469 0.73
470 0.77
471 0.74
472 0.79
473 0.75
474 0.74
475 0.74
476 0.76
477 0.76
478 0.77
479 0.81
480 0.78
481 0.83
482 0.83
483 0.81
484 0.79
485 0.79
486 0.76
487 0.76
488 0.8
489 0.74
490 0.74
491 0.74
492 0.76
493 0.76
494 0.76
495 0.77
496 0.77
497 0.77
498 0.72
499 0.7
500 0.64
501 0.6
502 0.57
503 0.5
504 0.42
505 0.43
506 0.44
507 0.43
508 0.44