Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X3T1

Protein Details
Accession W3X3T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-407SEIRAREKARRERQKEEERKLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-248EPPKFKHKKIPRGPPSPPPPIMRSPPR
386-406AREKARRERQKEEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pfy:PFICI_08317  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASIAASLAQALPKPKYTGEDEEIPAHAQQRGPRVVGPGQIDESQIVLRRTGPPAYGQRSGWRPRGQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLGMGQKGSSTSNALAIQVNADGKVKYDAIAQQGHREGRIVHSSFKDLIPLRQRADAGEIDLAKPSEEEIKATTERTQNALAALISGAVAAQKPKNVNIGGKRDATFVKYTPANQMGDNSKKQDRIMKIVERQRDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPIMRSPPRKLTAQDQEDWKIPPPISNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFSEALFMADRHAREEVRQRAVMQQRLAEKEKAQKEDNLRMLAQKARDDRAGAGRRRDSSGSRDSRSRSRSYSYSDSGSDSEDSEIRAREKARRERQKEEERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQQAETMYDSRLFNQTSGFDSGINEDNPYDKPLFAAQDAISSIYRPRQNAEDYEDEAAGDREMAKIQKSSRFGEVLGKGTFKGSGDAEAREGPVQFEKDGGDPFSVDKFLEQVDQSSTSKRGYGLQEDESRQSKRAKMDDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.29
4 0.34
5 0.39
6 0.4
7 0.44
8 0.43
9 0.43
10 0.43
11 0.4
12 0.35
13 0.29
14 0.27
15 0.23
16 0.24
17 0.31
18 0.33
19 0.34
20 0.34
21 0.37
22 0.37
23 0.4
24 0.39
25 0.34
26 0.33
27 0.32
28 0.31
29 0.26
30 0.24
31 0.21
32 0.22
33 0.19
34 0.17
35 0.19
36 0.22
37 0.25
38 0.26
39 0.25
40 0.28
41 0.36
42 0.42
43 0.44
44 0.41
45 0.45
46 0.52
47 0.58
48 0.59
49 0.56
50 0.53
51 0.54
52 0.61
53 0.56
54 0.5
55 0.47
56 0.42
57 0.35
58 0.33
59 0.27
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.17
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.19
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.14
99 0.16
100 0.19
101 0.26
102 0.25
103 0.28
104 0.33
105 0.34
106 0.31
107 0.29
108 0.25
109 0.24
110 0.32
111 0.28
112 0.27
113 0.28
114 0.31
115 0.32
116 0.31
117 0.32
118 0.25
119 0.31
120 0.35
121 0.38
122 0.37
123 0.38
124 0.38
125 0.33
126 0.35
127 0.29
128 0.22
129 0.21
130 0.19
131 0.16
132 0.18
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.18
142 0.19
143 0.2
144 0.24
145 0.23
146 0.24
147 0.26
148 0.26
149 0.22
150 0.21
151 0.21
152 0.16
153 0.12
154 0.1
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.19
167 0.21
168 0.26
169 0.31
170 0.37
171 0.38
172 0.41
173 0.4
174 0.37
175 0.36
176 0.33
177 0.28
178 0.22
179 0.22
180 0.21
181 0.21
182 0.24
183 0.27
184 0.25
185 0.23
186 0.26
187 0.28
188 0.32
189 0.34
190 0.33
191 0.33
192 0.34
193 0.35
194 0.39
195 0.35
196 0.36
197 0.4
198 0.42
199 0.47
200 0.51
201 0.56
202 0.51
203 0.51
204 0.47
205 0.43
206 0.4
207 0.42
208 0.45
209 0.43
210 0.43
211 0.51
212 0.56
213 0.54
214 0.61
215 0.61
216 0.63
217 0.68
218 0.77
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.76
224 0.72
225 0.66
226 0.58
227 0.53
228 0.49
229 0.51
230 0.51
231 0.53
232 0.52
233 0.55
234 0.54
235 0.52
236 0.49
237 0.51
238 0.51
239 0.46
240 0.44
241 0.41
242 0.4
243 0.39
244 0.38
245 0.31
246 0.25
247 0.21
248 0.2
249 0.19
250 0.27
251 0.29
252 0.36
253 0.41
254 0.45
255 0.5
256 0.48
257 0.48
258 0.42
259 0.4
260 0.35
261 0.38
262 0.34
263 0.35
264 0.37
265 0.34
266 0.3
267 0.3
268 0.28
269 0.19
270 0.18
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.22
301 0.26
302 0.28
303 0.29
304 0.28
305 0.35
306 0.4
307 0.41
308 0.34
309 0.31
310 0.31
311 0.35
312 0.37
313 0.31
314 0.29
315 0.33
316 0.37
317 0.38
318 0.36
319 0.36
320 0.38
321 0.45
322 0.45
323 0.39
324 0.34
325 0.32
326 0.32
327 0.31
328 0.27
329 0.24
330 0.23
331 0.23
332 0.24
333 0.23
334 0.23
335 0.29
336 0.35
337 0.34
338 0.37
339 0.39
340 0.4
341 0.42
342 0.42
343 0.35
344 0.33
345 0.4
346 0.4
347 0.39
348 0.41
349 0.42
350 0.48
351 0.5
352 0.48
353 0.42
354 0.4
355 0.41
356 0.43
357 0.46
358 0.41
359 0.38
360 0.35
361 0.33
362 0.29
363 0.27
364 0.21
365 0.16
366 0.14
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.16
373 0.17
374 0.23
375 0.32
376 0.41
377 0.5
378 0.6
379 0.65
380 0.71
381 0.79
382 0.84
383 0.84
384 0.84
385 0.83
386 0.79
387 0.83
388 0.82
389 0.77
390 0.7
391 0.65
392 0.63
393 0.63
394 0.64
395 0.58
396 0.55
397 0.54
398 0.51
399 0.49
400 0.41
401 0.32
402 0.33
403 0.37
404 0.37
405 0.37
406 0.35
407 0.39
408 0.4
409 0.41
410 0.34
411 0.27
412 0.24
413 0.19
414 0.19
415 0.16
416 0.14
417 0.12
418 0.14
419 0.13
420 0.14
421 0.15
422 0.16
423 0.14
424 0.16
425 0.17
426 0.17
427 0.22
428 0.21
429 0.22
430 0.25
431 0.24
432 0.25
433 0.28
434 0.26
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.19
439 0.21
440 0.2
441 0.16
442 0.16
443 0.18
444 0.2
445 0.19
446 0.16
447 0.13
448 0.15
449 0.16
450 0.19
451 0.17
452 0.13
453 0.14
454 0.16
455 0.18
456 0.17
457 0.19
458 0.15
459 0.17
460 0.17
461 0.18
462 0.15
463 0.14
464 0.16
465 0.2
466 0.23
467 0.22
468 0.25
469 0.28
470 0.32
471 0.35
472 0.39
473 0.37
474 0.36
475 0.37
476 0.34
477 0.28
478 0.25
479 0.21
480 0.15
481 0.11
482 0.08
483 0.07
484 0.1
485 0.12
486 0.13
487 0.17
488 0.22
489 0.29
490 0.33
491 0.35
492 0.37
493 0.37
494 0.36
495 0.4
496 0.39
497 0.37
498 0.34
499 0.32
500 0.27
501 0.27
502 0.27
503 0.19
504 0.18
505 0.14
506 0.18
507 0.2
508 0.21
509 0.22
510 0.22
511 0.23
512 0.22
513 0.22
514 0.18
515 0.21
516 0.21
517 0.19
518 0.19
519 0.19
520 0.2
521 0.22
522 0.21
523 0.17
524 0.16
525 0.17
526 0.18
527 0.18
528 0.15
529 0.13
530 0.13
531 0.13
532 0.16
533 0.15
534 0.15
535 0.18
536 0.22
537 0.23
538 0.26
539 0.27
540 0.25
541 0.26
542 0.25
543 0.28
544 0.3
545 0.36
546 0.37
547 0.42
548 0.48
549 0.5
550 0.55
551 0.54
552 0.51
553 0.48
554 0.49
555 0.47
556 0.48
557 0.53
558 0.53