Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HBV1

Protein Details
Accession C1HBV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-271QGEPIDPKNKKRRGNLPKSVTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-261KKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR008422  Homeobox_KN_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pbl:PAAG_08242  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05920  Homeobox_KN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MSRKVKTEEESKNMPVSYLSEFRSGGQTQTLPPFRDLLPQHLHEEIDSTPFYSPTSYHLPGTSYVSSAFHPRSTRGANLSRSLSTTKIDSYDGYLLRTDRFSKDQSQGGVAPLKRQASDTEILSATNPTSHFNSGGALPPIRNLQPLPANVGPFSRVNVDTKPPALSPEYHSNSNQHTHSFGSKPPGTYLPASRPFLVIPTNTLSHSEPARISQPYESSRYGPYQQSFRPELDYSPVSAGSLHDRSYGAQGEPIDPKNKKRRGNLPKSVTDVLRAWFHEHLDHPYPSEEDKQMFISRTGLTISQISNWFINARRRQLPALRNQVRASEPDRNGHRQSPLSDNEQTSSQSSVSSHH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.37
3 0.31
4 0.29
5 0.28
6 0.27
7 0.25
8 0.26
9 0.27
10 0.32
11 0.29
12 0.25
13 0.25
14 0.24
15 0.25
16 0.34
17 0.38
18 0.34
19 0.35
20 0.36
21 0.32
22 0.39
23 0.37
24 0.36
25 0.37
26 0.38
27 0.39
28 0.38
29 0.38
30 0.29
31 0.29
32 0.22
33 0.19
34 0.16
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.14
42 0.21
43 0.22
44 0.22
45 0.23
46 0.24
47 0.25
48 0.3
49 0.26
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.22
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.24
59 0.29
60 0.31
61 0.33
62 0.35
63 0.4
64 0.39
65 0.42
66 0.43
67 0.38
68 0.37
69 0.35
70 0.29
71 0.24
72 0.22
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.15
77 0.17
78 0.21
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.21
85 0.2
86 0.18
87 0.22
88 0.24
89 0.28
90 0.31
91 0.34
92 0.32
93 0.32
94 0.3
95 0.28
96 0.31
97 0.26
98 0.24
99 0.24
100 0.25
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.2
105 0.22
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.17
111 0.16
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.15
123 0.14
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.11
131 0.13
132 0.17
133 0.17
134 0.22
135 0.21
136 0.21
137 0.21
138 0.21
139 0.19
140 0.15
141 0.16
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.18
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.17
155 0.25
156 0.27
157 0.28
158 0.29
159 0.29
160 0.3
161 0.33
162 0.28
163 0.2
164 0.18
165 0.17
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.21
170 0.21
171 0.21
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.22
176 0.23
177 0.23
178 0.27
179 0.28
180 0.27
181 0.26
182 0.24
183 0.23
184 0.23
185 0.15
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.15
195 0.13
196 0.14
197 0.17
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.19
202 0.2
203 0.25
204 0.24
205 0.23
206 0.25
207 0.26
208 0.28
209 0.28
210 0.28
211 0.29
212 0.29
213 0.34
214 0.34
215 0.32
216 0.32
217 0.28
218 0.27
219 0.26
220 0.25
221 0.2
222 0.19
223 0.18
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.19
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.17
239 0.21
240 0.23
241 0.27
242 0.28
243 0.37
244 0.45
245 0.52
246 0.57
247 0.61
248 0.69
249 0.73
250 0.82
251 0.83
252 0.8
253 0.77
254 0.76
255 0.71
256 0.6
257 0.53
258 0.43
259 0.35
260 0.31
261 0.27
262 0.24
263 0.22
264 0.23
265 0.22
266 0.22
267 0.27
268 0.28
269 0.28
270 0.26
271 0.26
272 0.27
273 0.27
274 0.29
275 0.26
276 0.22
277 0.23
278 0.25
279 0.27
280 0.26
281 0.25
282 0.23
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.17
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.17
291 0.19
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.23
297 0.33
298 0.36
299 0.41
300 0.45
301 0.48
302 0.54
303 0.6
304 0.63
305 0.63
306 0.67
307 0.66
308 0.66
309 0.64
310 0.62
311 0.55
312 0.52
313 0.49
314 0.47
315 0.44
316 0.47
317 0.52
318 0.55
319 0.58
320 0.58
321 0.58
322 0.53
323 0.54
324 0.53
325 0.51
326 0.5
327 0.51
328 0.48
329 0.43
330 0.4
331 0.38
332 0.32
333 0.3
334 0.24
335 0.19