Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HA28

Protein Details
Accession C1HA28    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-401IAENTRPKRTGKKRSYNDSSFVHydrophilic
422-446GEDGGRGSGKKKRKKDHISGVSPTLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-436RGSGKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.999, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pbl:PAAG_07757  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSFVPLASSYKAGPPLSPSSPSADRAKSHQLHQQHHPKDQTPHTPTSPPLMSASAQNYASSFSTTETSPAQTQSTSLSSPPSSVAMSTQVSQQPTVTSTTSFPTPASSVYGHFATNSTMDEPESNSKNATADSQKDGRPSTWEKRGLDFIDIDQPGHRRTDHDRQKASLHENFDENEMDLDYRVASTSQEERLALSALQQDIGTAFHICKSSYTASGPNLSLDLVSLYGLGPVAASVARTDPVTGEKINRLRKSYEGKIKGLCLAGRNKPVKAEPGATGGLRYLTLWPEEEWQNQKVYGKDIKVPEPESPFFKQQLKAMKLDAGILPNHEFWEDALGHEKPSKVLVVADPSTAKIAGTVPTSIRHPTQLNGATTSVSTPIAENTRPKRTGKKRSYNDSSFVGYGEGFPDDDADLEGERFSNGEDGGRGSGKKKRKKDHISGVSPTLTERSGSYGVGMFGVGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.34
4 0.36
5 0.34
6 0.35
7 0.38
8 0.41
9 0.42
10 0.4
11 0.39
12 0.42
13 0.51
14 0.48
15 0.49
16 0.52
17 0.54
18 0.55
19 0.63
20 0.68
21 0.64
22 0.68
23 0.7
24 0.69
25 0.69
26 0.71
27 0.71
28 0.67
29 0.67
30 0.63
31 0.6
32 0.55
33 0.55
34 0.48
35 0.39
36 0.34
37 0.3
38 0.26
39 0.27
40 0.29
41 0.26
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.18
48 0.15
49 0.12
50 0.14
51 0.14
52 0.16
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.18
63 0.17
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.19
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.22
80 0.19
81 0.19
82 0.21
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.15
95 0.15
96 0.17
97 0.18
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.14
109 0.19
110 0.21
111 0.2
112 0.19
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.21
117 0.19
118 0.2
119 0.24
120 0.28
121 0.29
122 0.32
123 0.33
124 0.29
125 0.31
126 0.35
127 0.37
128 0.42
129 0.47
130 0.45
131 0.46
132 0.51
133 0.45
134 0.4
135 0.34
136 0.26
137 0.27
138 0.25
139 0.23
140 0.2
141 0.21
142 0.2
143 0.21
144 0.2
145 0.16
146 0.23
147 0.33
148 0.41
149 0.49
150 0.5
151 0.51
152 0.54
153 0.55
154 0.54
155 0.48
156 0.41
157 0.33
158 0.32
159 0.3
160 0.29
161 0.24
162 0.18
163 0.14
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.07
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.1
209 0.07
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.07
230 0.09
231 0.09
232 0.11
233 0.16
234 0.22
235 0.3
236 0.32
237 0.33
238 0.33
239 0.37
240 0.43
241 0.46
242 0.49
243 0.46
244 0.46
245 0.45
246 0.44
247 0.41
248 0.35
249 0.28
250 0.23
251 0.24
252 0.26
253 0.33
254 0.34
255 0.32
256 0.33
257 0.33
258 0.33
259 0.3
260 0.28
261 0.2
262 0.22
263 0.22
264 0.2
265 0.19
266 0.15
267 0.13
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.12
276 0.15
277 0.18
278 0.21
279 0.22
280 0.22
281 0.23
282 0.25
283 0.22
284 0.25
285 0.26
286 0.24
287 0.28
288 0.3
289 0.34
290 0.35
291 0.36
292 0.35
293 0.36
294 0.36
295 0.35
296 0.35
297 0.34
298 0.34
299 0.37
300 0.34
301 0.33
302 0.41
303 0.39
304 0.37
305 0.35
306 0.34
307 0.29
308 0.29
309 0.26
310 0.19
311 0.16
312 0.16
313 0.17
314 0.14
315 0.15
316 0.13
317 0.11
318 0.09
319 0.13
320 0.12
321 0.1
322 0.15
323 0.14
324 0.16
325 0.18
326 0.18
327 0.14
328 0.16
329 0.16
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.18
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.14
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.17
349 0.19
350 0.19
351 0.21
352 0.21
353 0.21
354 0.28
355 0.32
356 0.32
357 0.31
358 0.3
359 0.27
360 0.25
361 0.25
362 0.18
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.12
367 0.15
368 0.18
369 0.26
370 0.31
371 0.4
372 0.44
373 0.47
374 0.55
375 0.62
376 0.7
377 0.73
378 0.77
379 0.77
380 0.84
381 0.9
382 0.85
383 0.78
384 0.71
385 0.63
386 0.52
387 0.43
388 0.34
389 0.24
390 0.19
391 0.15
392 0.12
393 0.09
394 0.08
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.12
412 0.14
413 0.17
414 0.18
415 0.2
416 0.28
417 0.37
418 0.46
419 0.54
420 0.62
421 0.71
422 0.8
423 0.87
424 0.9
425 0.91
426 0.89
427 0.85
428 0.79
429 0.7
430 0.59
431 0.5
432 0.41
433 0.3
434 0.23
435 0.18
436 0.18
437 0.18
438 0.18
439 0.18
440 0.18
441 0.17
442 0.17
443 0.16