Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H6Q9

Protein Details
Accession C1H6Q9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MADKERPLKRRKGSHGTSEVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
454-467KEHRPIREAGRRRA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG pbl:PAAG_06450  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MADKERPLKRRKGSHGTSEVVYDTPSGGSSVLVSLNRSITPPIRSPPKQSYSSNSKIARQESPVMPNGIPSPIQLTRVRDFPASSENNTDTVKLRDILGDPLIKECWQFNYIFDIDYLMSQFDQDVRDLVKVKIIHGSWKRESPNRIHIDEGCRRYPNVEPMVAYMPEAFGTHHSKMMIIIKHDDQAQIVIHTANMIAGDWANMCQAVWRSPMLPMLSNKQREHPSATPNDVGTGSRFKRDLLAYLETYGHNKTGALIEQLEKYDFSAIRAALIASVPSRQTIDELDSKRHTLWGWPALKDTIRQIPFSKGTKSTEKKPQIVIQISSVATLGQTDKWLKETLFNSLSPPSARSSELFKTESNSPANFSIIFPTPDEIRRSLNGYMSGGSIHMKLQSAAQQKQLQYLRPYLCRWAGDANDDGGVKSAGGPATSKRKRLEGNDVSESVQDCAALKKEHRPIREAGRRRAAPHIKTYVRFSDTDMTTIDWAMVTSANLSLQAWGAAANAKKEIRICSYEIGVLVWPDLFVDEEIDDSDEPLTKGKGKDNSRREISGNKNTKDVKTAVMVPCFKRDMPEAAENAARSSDTTLVGFRMPYDLPLHSYTAKDQPWCATATYSEPDWLGQTWEVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.82
3 0.76
4 0.67
5 0.59
6 0.5
7 0.39
8 0.32
9 0.22
10 0.16
11 0.12
12 0.11
13 0.1
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.15
22 0.17
23 0.17
24 0.18
25 0.21
26 0.22
27 0.26
28 0.3
29 0.36
30 0.44
31 0.47
32 0.54
33 0.6
34 0.63
35 0.63
36 0.63
37 0.63
38 0.63
39 0.66
40 0.67
41 0.6
42 0.6
43 0.6
44 0.61
45 0.57
46 0.52
47 0.53
48 0.49
49 0.51
50 0.49
51 0.45
52 0.4
53 0.38
54 0.35
55 0.29
56 0.24
57 0.19
58 0.21
59 0.19
60 0.25
61 0.27
62 0.31
63 0.31
64 0.35
65 0.37
66 0.32
67 0.31
68 0.29
69 0.34
70 0.32
71 0.32
72 0.33
73 0.32
74 0.33
75 0.33
76 0.32
77 0.26
78 0.25
79 0.25
80 0.21
81 0.2
82 0.2
83 0.21
84 0.22
85 0.23
86 0.23
87 0.21
88 0.22
89 0.23
90 0.2
91 0.2
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.2
101 0.18
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.14
115 0.17
116 0.16
117 0.2
118 0.19
119 0.2
120 0.24
121 0.23
122 0.3
123 0.34
124 0.42
125 0.41
126 0.47
127 0.51
128 0.52
129 0.57
130 0.55
131 0.59
132 0.57
133 0.55
134 0.51
135 0.5
136 0.52
137 0.55
138 0.53
139 0.47
140 0.42
141 0.41
142 0.4
143 0.4
144 0.4
145 0.36
146 0.32
147 0.28
148 0.29
149 0.32
150 0.3
151 0.25
152 0.17
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.09
157 0.1
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.2
164 0.25
165 0.24
166 0.2
167 0.23
168 0.22
169 0.24
170 0.25
171 0.23
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.13
199 0.17
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.24
204 0.31
205 0.37
206 0.37
207 0.4
208 0.43
209 0.42
210 0.47
211 0.44
212 0.43
213 0.41
214 0.44
215 0.39
216 0.35
217 0.33
218 0.27
219 0.23
220 0.18
221 0.21
222 0.18
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.22
227 0.22
228 0.24
229 0.21
230 0.24
231 0.22
232 0.23
233 0.24
234 0.2
235 0.21
236 0.18
237 0.14
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.11
271 0.17
272 0.18
273 0.22
274 0.22
275 0.23
276 0.23
277 0.23
278 0.2
279 0.16
280 0.19
281 0.23
282 0.25
283 0.24
284 0.25
285 0.25
286 0.26
287 0.24
288 0.22
289 0.22
290 0.2
291 0.21
292 0.22
293 0.24
294 0.29
295 0.3
296 0.3
297 0.25
298 0.27
299 0.35
300 0.37
301 0.4
302 0.45
303 0.49
304 0.49
305 0.49
306 0.5
307 0.47
308 0.47
309 0.41
310 0.32
311 0.29
312 0.25
313 0.23
314 0.18
315 0.11
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.05
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.12
325 0.11
326 0.16
327 0.16
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.21
332 0.2
333 0.21
334 0.17
335 0.17
336 0.14
337 0.13
338 0.14
339 0.13
340 0.17
341 0.19
342 0.22
343 0.22
344 0.21
345 0.22
346 0.24
347 0.27
348 0.25
349 0.23
350 0.21
351 0.2
352 0.2
353 0.18
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.13
358 0.12
359 0.12
360 0.13
361 0.16
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.21
367 0.21
368 0.21
369 0.19
370 0.17
371 0.16
372 0.14
373 0.13
374 0.1
375 0.1
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.15
383 0.21
384 0.23
385 0.28
386 0.32
387 0.32
388 0.39
389 0.4
390 0.38
391 0.34
392 0.4
393 0.37
394 0.37
395 0.38
396 0.35
397 0.35
398 0.31
399 0.3
400 0.27
401 0.24
402 0.23
403 0.22
404 0.19
405 0.17
406 0.17
407 0.15
408 0.12
409 0.11
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.12
417 0.23
418 0.27
419 0.32
420 0.32
421 0.38
422 0.43
423 0.47
424 0.54
425 0.51
426 0.54
427 0.53
428 0.52
429 0.47
430 0.43
431 0.38
432 0.28
433 0.2
434 0.13
435 0.1
436 0.1
437 0.13
438 0.14
439 0.15
440 0.23
441 0.32
442 0.37
443 0.39
444 0.41
445 0.43
446 0.51
447 0.6
448 0.6
449 0.6
450 0.64
451 0.64
452 0.63
453 0.69
454 0.66
455 0.6
456 0.59
457 0.59
458 0.55
459 0.54
460 0.57
461 0.52
462 0.47
463 0.43
464 0.39
465 0.38
466 0.34
467 0.32
468 0.28
469 0.24
470 0.21
471 0.2
472 0.17
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.07
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.09
490 0.11
491 0.11
492 0.15
493 0.15
494 0.17
495 0.2
496 0.23
497 0.25
498 0.27
499 0.28
500 0.27
501 0.28
502 0.27
503 0.25
504 0.22
505 0.17
506 0.14
507 0.12
508 0.09
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.06
516 0.07
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.12
525 0.13
526 0.16
527 0.19
528 0.26
529 0.34
530 0.42
531 0.52
532 0.59
533 0.66
534 0.67
535 0.67
536 0.64
537 0.64
538 0.64
539 0.65
540 0.66
541 0.58
542 0.6
543 0.61
544 0.59
545 0.55
546 0.48
547 0.4
548 0.35
549 0.41
550 0.38
551 0.42
552 0.46
553 0.43
554 0.46
555 0.47
556 0.42
557 0.38
558 0.37
559 0.35
560 0.35
561 0.4
562 0.36
563 0.35
564 0.38
565 0.35
566 0.32
567 0.27
568 0.21
569 0.15
570 0.16
571 0.15
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.16
576 0.17
577 0.16
578 0.14
579 0.15
580 0.14
581 0.16
582 0.18
583 0.18
584 0.21
585 0.23
586 0.26
587 0.25
588 0.26
589 0.28
590 0.33
591 0.35
592 0.34
593 0.34
594 0.34
595 0.35
596 0.35
597 0.32
598 0.25
599 0.23
600 0.26
601 0.27
602 0.24
603 0.24
604 0.22
605 0.22
606 0.22
607 0.2
608 0.19