Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X0E1

Protein Details
Accession W3X0E1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
501-524SVEEARLRKRQKRAEQAADREKNPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
508-512RKRQK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, cyto 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG pfy:PFICI_09418  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSQPPQPLVQSAPQPQQQALNQNRAYSPHVQQQQTPQQQPPQHAPSPNANQQIRQPQQNQTQPPRPSPDPRSPTFPAGNFSSSGHSTPGVRTPTSTMASPSVSHFAQAQPQPSVQQPHQTPSYATSYNQSQMAPQQNGRLTPGTTVNQRFAPPQQQHHATPQPNANHMVAHSPSAMNHPPQSPHVQQPNGTAHGYANTTFSPTGQVQPVSTPGAMGPPPHLNAPKPAVPVKSYQYEMDDSLAGTGINLDEEEQYMNDYETRLGFGSHVPGGRGSFYGAGPANQPAETGQSKSQEEMAADAADRAWNEAAHRYGVSRAQDFLQQGFLLPALLHARMSKAAAANGLELNLDPKPPNPNMPLGRFPNPNQWEKPYVQVTTKTSEDNAIVTTAGSFLPKEAYLIDQIALLSLATKTRLGELLTDANLVACNRQQTAHGKPPPEWAEAAEPPVMSDSAVSPRTNSRKIYEGPADELSNGLPTPVSEASIKNPFADTIVSLGKTSRSVEEARLRKRQKRAEQAADREKNPDGTSASRAGSVAPGTPGSVAPESGEAKPLSKKESKKAARLADTSSLSVNSTLSQFMGSKKKKYSWMTGAAGGSGANTPRGPGAAAPASGGPNKAAKGPLTQDASQQIGSLREDSVKGKHIQMRDWIEVLEEHGYLTDQVALQQAYIKLERSDWGDKVKVPALPIPAPAPSTATTPVVSTPVVSTPVVTTPVATTPVATTPVATSIPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.49
4 0.47
5 0.5
6 0.5
7 0.52
8 0.49
9 0.5
10 0.5
11 0.47
12 0.47
13 0.43
14 0.42
15 0.41
16 0.48
17 0.47
18 0.5
19 0.56
20 0.62
21 0.66
22 0.66
23 0.62
24 0.63
25 0.65
26 0.67
27 0.66
28 0.63
29 0.59
30 0.58
31 0.56
32 0.57
33 0.61
34 0.63
35 0.64
36 0.57
37 0.54
38 0.57
39 0.64
40 0.6
41 0.6
42 0.58
43 0.57
44 0.65
45 0.71
46 0.73
47 0.72
48 0.76
49 0.73
50 0.75
51 0.74
52 0.7
53 0.71
54 0.7
55 0.71
56 0.68
57 0.66
58 0.67
59 0.63
60 0.64
61 0.6
62 0.54
63 0.48
64 0.44
65 0.42
66 0.36
67 0.33
68 0.3
69 0.26
70 0.25
71 0.22
72 0.2
73 0.19
74 0.2
75 0.26
76 0.26
77 0.24
78 0.24
79 0.27
80 0.31
81 0.32
82 0.3
83 0.26
84 0.25
85 0.26
86 0.25
87 0.24
88 0.23
89 0.2
90 0.2
91 0.19
92 0.18
93 0.24
94 0.27
95 0.27
96 0.26
97 0.27
98 0.28
99 0.31
100 0.36
101 0.3
102 0.36
103 0.35
104 0.38
105 0.4
106 0.39
107 0.35
108 0.33
109 0.37
110 0.3
111 0.28
112 0.27
113 0.27
114 0.28
115 0.29
116 0.25
117 0.21
118 0.27
119 0.34
120 0.34
121 0.32
122 0.36
123 0.37
124 0.38
125 0.39
126 0.34
127 0.26
128 0.25
129 0.28
130 0.26
131 0.3
132 0.32
133 0.32
134 0.32
135 0.33
136 0.33
137 0.33
138 0.39
139 0.37
140 0.41
141 0.46
142 0.48
143 0.5
144 0.55
145 0.59
146 0.52
147 0.52
148 0.52
149 0.47
150 0.45
151 0.46
152 0.38
153 0.3
154 0.28
155 0.27
156 0.21
157 0.19
158 0.17
159 0.14
160 0.15
161 0.19
162 0.22
163 0.2
164 0.22
165 0.23
166 0.24
167 0.28
168 0.34
169 0.32
170 0.38
171 0.43
172 0.42
173 0.41
174 0.46
175 0.47
176 0.43
177 0.4
178 0.32
179 0.24
180 0.24
181 0.24
182 0.18
183 0.15
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.16
194 0.17
195 0.19
196 0.17
197 0.16
198 0.13
199 0.1
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.18
207 0.2
208 0.18
209 0.22
210 0.26
211 0.27
212 0.28
213 0.3
214 0.29
215 0.29
216 0.32
217 0.31
218 0.3
219 0.28
220 0.26
221 0.25
222 0.25
223 0.24
224 0.21
225 0.17
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.08
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.08
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.15
276 0.18
277 0.19
278 0.19
279 0.2
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.13
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.14
301 0.16
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.06
337 0.08
338 0.12
339 0.13
340 0.17
341 0.17
342 0.24
343 0.27
344 0.3
345 0.34
346 0.33
347 0.37
348 0.36
349 0.36
350 0.39
351 0.39
352 0.4
353 0.36
354 0.36
355 0.35
356 0.33
357 0.37
358 0.29
359 0.27
360 0.25
361 0.27
362 0.26
363 0.25
364 0.25
365 0.21
366 0.18
367 0.18
368 0.16
369 0.13
370 0.11
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.1
404 0.12
405 0.11
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.12
417 0.16
418 0.23
419 0.31
420 0.34
421 0.35
422 0.35
423 0.43
424 0.43
425 0.4
426 0.33
427 0.25
428 0.26
429 0.25
430 0.26
431 0.19
432 0.15
433 0.13
434 0.14
435 0.12
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.1
440 0.13
441 0.12
442 0.13
443 0.2
444 0.26
445 0.3
446 0.31
447 0.28
448 0.32
449 0.34
450 0.39
451 0.37
452 0.33
453 0.32
454 0.32
455 0.3
456 0.24
457 0.23
458 0.17
459 0.12
460 0.1
461 0.07
462 0.05
463 0.04
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.11
469 0.15
470 0.21
471 0.21
472 0.18
473 0.18
474 0.17
475 0.16
476 0.16
477 0.12
478 0.09
479 0.11
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.13
486 0.11
487 0.13
488 0.14
489 0.2
490 0.28
491 0.36
492 0.41
493 0.5
494 0.56
495 0.6
496 0.68
497 0.72
498 0.73
499 0.76
500 0.79
501 0.8
502 0.82
503 0.84
504 0.85
505 0.8
506 0.71
507 0.63
508 0.55
509 0.47
510 0.39
511 0.32
512 0.24
513 0.21
514 0.24
515 0.23
516 0.23
517 0.2
518 0.19
519 0.17
520 0.16
521 0.14
522 0.11
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.09
528 0.11
529 0.11
530 0.1
531 0.09
532 0.12
533 0.14
534 0.14
535 0.18
536 0.15
537 0.17
538 0.21
539 0.23
540 0.26
541 0.31
542 0.36
543 0.41
544 0.52
545 0.57
546 0.61
547 0.67
548 0.68
549 0.67
550 0.64
551 0.59
552 0.55
553 0.5
554 0.42
555 0.35
556 0.28
557 0.22
558 0.2
559 0.16
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.1
566 0.15
567 0.26
568 0.29
569 0.35
570 0.4
571 0.46
572 0.53
573 0.57
574 0.61
575 0.59
576 0.63
577 0.59
578 0.58
579 0.52
580 0.43
581 0.38
582 0.28
583 0.21
584 0.14
585 0.11
586 0.09
587 0.08
588 0.09
589 0.09
590 0.1
591 0.1
592 0.08
593 0.13
594 0.14
595 0.14
596 0.15
597 0.16
598 0.18
599 0.18
600 0.19
601 0.15
602 0.15
603 0.16
604 0.18
605 0.19
606 0.18
607 0.22
608 0.25
609 0.3
610 0.33
611 0.33
612 0.34
613 0.35
614 0.36
615 0.3
616 0.28
617 0.23
618 0.2
619 0.21
620 0.18
621 0.16
622 0.16
623 0.18
624 0.19
625 0.22
626 0.25
627 0.26
628 0.32
629 0.36
630 0.37
631 0.39
632 0.46
633 0.49
634 0.46
635 0.44
636 0.37
637 0.33
638 0.3
639 0.28
640 0.21
641 0.14
642 0.11
643 0.1
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.08
649 0.09
650 0.12
651 0.12
652 0.12
653 0.16
654 0.17
655 0.18
656 0.2
657 0.21
658 0.19
659 0.2
660 0.23
661 0.25
662 0.29
663 0.28
664 0.33
665 0.34
666 0.35
667 0.39
668 0.41
669 0.36
670 0.33
671 0.35
672 0.34
673 0.33
674 0.33
675 0.3
676 0.28
677 0.27
678 0.25
679 0.24
680 0.19
681 0.2
682 0.21
683 0.21
684 0.19
685 0.19
686 0.2
687 0.19
688 0.18
689 0.15
690 0.15
691 0.15
692 0.17
693 0.16
694 0.16
695 0.16
696 0.18
697 0.2
698 0.18
699 0.17
700 0.16
701 0.18
702 0.2
703 0.18
704 0.17
705 0.16
706 0.19
707 0.21
708 0.18
709 0.17
710 0.15
711 0.18