Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3XLZ4

Protein Details
Accession W3XLZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MLRQIKPRNARSKRALEKKAPKAIENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-22KPRNARSKRALEKKAPK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 11.5, mito 9.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG pfy:PFICI_00823  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRQIKPRNARSKRALEKKAPKAIENPKTCLFLRGTSCSQIVQDAITDLYQLRVPLAKKFTKKNAIHPFEDPSSLEFFSEKNDASLMVFGSSSKKRPHTLTMVRLFGHKTLDMLELHLDPESHRKIDQFKGRKFAVGLRPMIHFAGTAFDSPVTNEYTLAKSFFLDFFKGEGSDKIDVEGLQYMVSISAEEPVGENDKPVIHLRVYLISTKRSGQKMPRVEVEEMGPRMDFRVGRVQEAEEAMWKEAMKKAKTNEERTKKNVSTDSMGDKLGRIHLGRQDLGELQTRKMKGLKRSRDMEDEQAGGDDDDEAPKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.85
4 0.88
5 0.88
6 0.88
7 0.8
8 0.72
9 0.71
10 0.73
11 0.72
12 0.67
13 0.63
14 0.57
15 0.59
16 0.56
17 0.51
18 0.43
19 0.39
20 0.39
21 0.4
22 0.39
23 0.38
24 0.38
25 0.34
26 0.32
27 0.27
28 0.22
29 0.16
30 0.13
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.1
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.13
41 0.14
42 0.2
43 0.27
44 0.33
45 0.39
46 0.47
47 0.55
48 0.61
49 0.64
50 0.68
51 0.72
52 0.71
53 0.68
54 0.62
55 0.59
56 0.5
57 0.48
58 0.38
59 0.29
60 0.26
61 0.22
62 0.2
63 0.15
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.09
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.12
78 0.14
79 0.19
80 0.23
81 0.27
82 0.3
83 0.34
84 0.4
85 0.44
86 0.5
87 0.54
88 0.55
89 0.53
90 0.5
91 0.48
92 0.43
93 0.35
94 0.29
95 0.2
96 0.14
97 0.13
98 0.15
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.14
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.17
112 0.22
113 0.29
114 0.38
115 0.41
116 0.42
117 0.47
118 0.47
119 0.46
120 0.43
121 0.42
122 0.4
123 0.36
124 0.34
125 0.29
126 0.3
127 0.3
128 0.29
129 0.22
130 0.14
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.1
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.17
193 0.19
194 0.2
195 0.2
196 0.21
197 0.24
198 0.29
199 0.28
200 0.32
201 0.35
202 0.43
203 0.48
204 0.5
205 0.52
206 0.51
207 0.49
208 0.45
209 0.4
210 0.36
211 0.3
212 0.26
213 0.21
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.15
218 0.12
219 0.22
220 0.22
221 0.24
222 0.25
223 0.25
224 0.24
225 0.25
226 0.22
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.18
234 0.26
235 0.25
236 0.29
237 0.33
238 0.42
239 0.51
240 0.59
241 0.66
242 0.68
243 0.73
244 0.73
245 0.78
246 0.69
247 0.68
248 0.63
249 0.56
250 0.51
251 0.48
252 0.48
253 0.4
254 0.39
255 0.32
256 0.27
257 0.25
258 0.23
259 0.23
260 0.18
261 0.2
262 0.25
263 0.29
264 0.29
265 0.28
266 0.28
267 0.26
268 0.28
269 0.32
270 0.28
271 0.26
272 0.32
273 0.32
274 0.33
275 0.37
276 0.41
277 0.43
278 0.52
279 0.6
280 0.62
281 0.68
282 0.71
283 0.73
284 0.71
285 0.69
286 0.62
287 0.52
288 0.44
289 0.38
290 0.33
291 0.24
292 0.2
293 0.13
294 0.1
295 0.1
296 0.12