Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3WM44

Protein Details
Accession W3WM44    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-47DILFQQGPRKRQKQDPAALKAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
521-585KGKDKALPAPAPAARGGANQRGNQRGGPQRGGPQGRGGRGGNSQGRGRGGPPRASHAPGHMGRAG
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 7, pero 4, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG pfy:PFICI_13427  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MGPPDLAQSLANLQITAAADNVNIDDILFQQGPRKRQKQDPAALKAQLENDYLNPSNKFSNEWLNRLQQRWDCPTDLTELFRIAPTQTRTVTRFTRQGLEGKVTGYKNVTVPANSATAKNSTSFSRKPASRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVDSIAASEDQMLRPGAAAPNGTGNKLERVIKLGAEGGLLEVAPGLERGIDFSKKKAKVDDSDAKAVEEVLDQEPEDAPNADGVDGIPAPQPTEEELDGEDGEDIDALLPVEFPALEPHSALAASSARKAGKEWAHMVDINRGIPNFRELVPDMAREWPFELDNFQKEAIYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAARHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRETFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDFERGVVWEEVIIMLPEHVSLILLSATVPNTKEFAQWVGRTKQKDIYVISTPKRPVPLEHYLWAGKNIHKIVDADKKFNEKGWKEADLALKGKDKALPAPAPAARGGANQRGNQRGGPQRGGPQGRGGRGGNSQGRGRGGPPRASHAPGHMGRAGRPGGFTSLNQDKNLWVHMVQYLKKSTLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTAHEKSHIHMIVEKSVARLRPEDRALPQIIRIRELLSRGIAVHHGGLLPIVKELVELLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHTFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGTVIIVPPGGGDEAPPVVDLQNMITGQPNKLKSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKGVKIAEADLAKIKREACEKCDATLDDCHDASMKYRELTQELHKGMLSIPIGRKMFSQGRLIVFSKDGVRTPGILLSDGISTKTTGGQPSIHVFEIRSMRETRDSTDLLPFLPAFRSLFTQLPQSKRLIYFKTQHIAVGDVEYLTKTVTKGILPDIFQGNESHAKAKDRIFQICKSWEADIWEEIDLSKIKSMQLQELIGKRHQEARRAVDTAPIHCESFLKHFAMCHDQWLIKEHISTLLATMADQNLQLLPDYEQRIQVLKDLSFIDNETRIQLKGKVACEIHSADELVLTELILDNVLADYEPAEIAALLSAFVFQEKTDSVPNLPGKLEQGIKTIVEISEKVNNVQTLHQVIQSSEESNDFVVRPRFGLVEVVYEWARGMSFRNITDLTDVLEGTIVRTITRLDETCREVKNAARIIGDPALYQKMQEAQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.13
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.2
18 0.26
19 0.34
20 0.45
21 0.52
22 0.54
23 0.64
24 0.74
25 0.77
26 0.82
27 0.83
28 0.81
29 0.79
30 0.75
31 0.67
32 0.6
33 0.53
34 0.46
35 0.37
36 0.31
37 0.25
38 0.29
39 0.3
40 0.31
41 0.28
42 0.27
43 0.3
44 0.29
45 0.31
46 0.29
47 0.37
48 0.38
49 0.42
50 0.46
51 0.51
52 0.56
53 0.56
54 0.6
55 0.55
56 0.57
57 0.6
58 0.59
59 0.51
60 0.47
61 0.46
62 0.44
63 0.4
64 0.35
65 0.29
66 0.26
67 0.25
68 0.23
69 0.23
70 0.18
71 0.23
72 0.24
73 0.27
74 0.29
75 0.34
76 0.36
77 0.42
78 0.46
79 0.46
80 0.49
81 0.47
82 0.5
83 0.48
84 0.52
85 0.49
86 0.48
87 0.42
88 0.37
89 0.4
90 0.34
91 0.33
92 0.29
93 0.28
94 0.24
95 0.27
96 0.28
97 0.23
98 0.24
99 0.24
100 0.26
101 0.24
102 0.24
103 0.22
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.22
109 0.29
110 0.3
111 0.34
112 0.4
113 0.42
114 0.45
115 0.53
116 0.54
117 0.54
118 0.55
119 0.56
120 0.52
121 0.49
122 0.5
123 0.4
124 0.34
125 0.27
126 0.24
127 0.18
128 0.14
129 0.15
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.09
147 0.09
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.21
161 0.21
162 0.23
163 0.26
164 0.29
165 0.22
166 0.26
167 0.26
168 0.25
169 0.24
170 0.22
171 0.18
172 0.15
173 0.14
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.08
186 0.12
187 0.18
188 0.19
189 0.25
190 0.35
191 0.38
192 0.42
193 0.46
194 0.49
195 0.49
196 0.57
197 0.61
198 0.58
199 0.6
200 0.58
201 0.51
202 0.44
203 0.38
204 0.29
205 0.2
206 0.16
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.11
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.18
267 0.24
268 0.26
269 0.3
270 0.33
271 0.32
272 0.34
273 0.36
274 0.37
275 0.35
276 0.32
277 0.28
278 0.25
279 0.22
280 0.2
281 0.19
282 0.2
283 0.16
284 0.15
285 0.17
286 0.17
287 0.22
288 0.23
289 0.24
290 0.22
291 0.26
292 0.26
293 0.23
294 0.23
295 0.19
296 0.18
297 0.17
298 0.2
299 0.18
300 0.21
301 0.21
302 0.2
303 0.19
304 0.18
305 0.21
306 0.2
307 0.18
308 0.16
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.13
314 0.09
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.1
344 0.11
345 0.15
346 0.16
347 0.18
348 0.21
349 0.24
350 0.24
351 0.27
352 0.36
353 0.38
354 0.47
355 0.47
356 0.52
357 0.54
358 0.56
359 0.61
360 0.52
361 0.46
362 0.44
363 0.44
364 0.37
365 0.33
366 0.3
367 0.2
368 0.19
369 0.16
370 0.09
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.09
409 0.07
410 0.06
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.1
418 0.1
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.14
452 0.17
453 0.19
454 0.25
455 0.29
456 0.33
457 0.34
458 0.36
459 0.38
460 0.36
461 0.37
462 0.33
463 0.32
464 0.35
465 0.39
466 0.39
467 0.38
468 0.37
469 0.35
470 0.37
471 0.33
472 0.28
473 0.29
474 0.35
475 0.33
476 0.33
477 0.34
478 0.32
479 0.31
480 0.31
481 0.27
482 0.21
483 0.23
484 0.22
485 0.19
486 0.19
487 0.2
488 0.23
489 0.3
490 0.3
491 0.28
492 0.3
493 0.34
494 0.33
495 0.36
496 0.39
497 0.3
498 0.33
499 0.34
500 0.35
501 0.31
502 0.35
503 0.35
504 0.3
505 0.3
506 0.27
507 0.27
508 0.25
509 0.24
510 0.22
511 0.19
512 0.18
513 0.22
514 0.21
515 0.18
516 0.22
517 0.22
518 0.21
519 0.2
520 0.19
521 0.14
522 0.15
523 0.17
524 0.19
525 0.23
526 0.25
527 0.28
528 0.31
529 0.31
530 0.3
531 0.34
532 0.34
533 0.34
534 0.33
535 0.31
536 0.33
537 0.39
538 0.4
539 0.34
540 0.33
541 0.33
542 0.32
543 0.33
544 0.28
545 0.23
546 0.23
547 0.28
548 0.23
549 0.23
550 0.23
551 0.21
552 0.22
553 0.21
554 0.2
555 0.22
556 0.23
557 0.26
558 0.25
559 0.3
560 0.31
561 0.33
562 0.32
563 0.27
564 0.31
565 0.26
566 0.28
567 0.25
568 0.23
569 0.21
570 0.24
571 0.23
572 0.16
573 0.15
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.15
579 0.21
580 0.23
581 0.23
582 0.22
583 0.21
584 0.21
585 0.22
586 0.17
587 0.09
588 0.09
589 0.11
590 0.15
591 0.15
592 0.18
593 0.18
594 0.18
595 0.19
596 0.18
597 0.19
598 0.19
599 0.2
600 0.17
601 0.18
602 0.18
603 0.18
604 0.18
605 0.16
606 0.2
607 0.19
608 0.25
609 0.25
610 0.27
611 0.27
612 0.33
613 0.34
614 0.34
615 0.38
616 0.33
617 0.31
618 0.29
619 0.28
620 0.23
621 0.19
622 0.13
623 0.08
624 0.08
625 0.13
626 0.13
627 0.13
628 0.18
629 0.18
630 0.17
631 0.24
632 0.24
633 0.19
634 0.21
635 0.22
636 0.19
637 0.2
638 0.19
639 0.14
640 0.15
641 0.16
642 0.14
643 0.16
644 0.15
645 0.19
646 0.21
647 0.23
648 0.22
649 0.25
650 0.25
651 0.23
652 0.26
653 0.25
654 0.24
655 0.22
656 0.21
657 0.18
658 0.18
659 0.19
660 0.16
661 0.11
662 0.11
663 0.1
664 0.1
665 0.09
666 0.08
667 0.07
668 0.06
669 0.06
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.04
689 0.05
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.06
695 0.05
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.06
705 0.06
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.08
710 0.1
711 0.13
712 0.19
713 0.23
714 0.28
715 0.28
716 0.29
717 0.34
718 0.36
719 0.38
720 0.41
721 0.41
722 0.36
723 0.41
724 0.4
725 0.34
726 0.29
727 0.25
728 0.19
729 0.15
730 0.15
731 0.09
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.11
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.12
741 0.12
742 0.12
743 0.11
744 0.09
745 0.09
746 0.08
747 0.07
748 0.06
749 0.06
750 0.04
751 0.04
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.03
756 0.03
757 0.04
758 0.04
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.05
765 0.05
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.11
770 0.12
771 0.14
772 0.19
773 0.21
774 0.2
775 0.27
776 0.31
777 0.3
778 0.38
779 0.42
780 0.4
781 0.45
782 0.45
783 0.45
784 0.43
785 0.41
786 0.33
787 0.27
788 0.24
789 0.17
790 0.15
791 0.09
792 0.07
793 0.06
794 0.05
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.09
799 0.11
800 0.13
801 0.14
802 0.14
803 0.14
804 0.15
805 0.17
806 0.17
807 0.19
808 0.19
809 0.23
810 0.25
811 0.25
812 0.24
813 0.26
814 0.26
815 0.24
816 0.22
817 0.19
818 0.17
819 0.18
820 0.17
821 0.14
822 0.14
823 0.12
824 0.11
825 0.13
826 0.12
827 0.12
828 0.17
829 0.16
830 0.16
831 0.18
832 0.18
833 0.17
834 0.24
835 0.26
836 0.25
837 0.34
838 0.34
839 0.33
840 0.37
841 0.34
842 0.3
843 0.31
844 0.3
845 0.23
846 0.22
847 0.21
848 0.18
849 0.17
850 0.17
851 0.18
852 0.17
853 0.14
854 0.16
855 0.18
856 0.19
857 0.22
858 0.25
859 0.29
860 0.28
861 0.28
862 0.26
863 0.25
864 0.23
865 0.24
866 0.19
867 0.16
868 0.17
869 0.22
870 0.22
871 0.22
872 0.22
873 0.24
874 0.29
875 0.28
876 0.31
877 0.28
878 0.3
879 0.34
880 0.34
881 0.29
882 0.25
883 0.23
884 0.21
885 0.19
886 0.18
887 0.16
888 0.16
889 0.16
890 0.16
891 0.16
892 0.14
893 0.13
894 0.12
895 0.11
896 0.12
897 0.11
898 0.11
899 0.09
900 0.09
901 0.09
902 0.11
903 0.12
904 0.12
905 0.14
906 0.14
907 0.15
908 0.19
909 0.21
910 0.19
911 0.17
912 0.16
913 0.2
914 0.24
915 0.23
916 0.23
917 0.22
918 0.23
919 0.29
920 0.3
921 0.27
922 0.28
923 0.28
924 0.26
925 0.28
926 0.27
927 0.21
928 0.21
929 0.18
930 0.14
931 0.13
932 0.13
933 0.1
934 0.11
935 0.13
936 0.15
937 0.17
938 0.17
939 0.25
940 0.29
941 0.33
942 0.35
943 0.34
944 0.35
945 0.38
946 0.42
947 0.38
948 0.39
949 0.42
950 0.45
951 0.47
952 0.44
953 0.41
954 0.36
955 0.33
956 0.27
957 0.21
958 0.15
959 0.11
960 0.1
961 0.09
962 0.08
963 0.07
964 0.08
965 0.06
966 0.08
967 0.09
968 0.1
969 0.11
970 0.16
971 0.19
972 0.19
973 0.22
974 0.23
975 0.22
976 0.22
977 0.21
978 0.2
979 0.22
980 0.22
981 0.22
982 0.22
983 0.25
984 0.28
985 0.32
986 0.36
987 0.35
988 0.43
989 0.44
990 0.45
991 0.48
992 0.48
993 0.46
994 0.4
995 0.37
996 0.31
997 0.3
998 0.28
999 0.23
1000 0.21
1001 0.18
1002 0.16
1003 0.15
1004 0.16
1005 0.13
1006 0.11
1007 0.12
1008 0.12
1009 0.12
1010 0.16
1011 0.18
1012 0.2
1013 0.22
1014 0.24
1015 0.27
1016 0.31
1017 0.34
1018 0.33
1019 0.34
1020 0.31
1021 0.37
1022 0.38
1023 0.41
1024 0.43
1025 0.46
1026 0.49
1027 0.48
1028 0.47
1029 0.45
1030 0.44
1031 0.39
1032 0.38
1033 0.32
1034 0.27
1035 0.25
1036 0.25
1037 0.2
1038 0.24
1039 0.25
1040 0.21
1041 0.2
1042 0.21
1043 0.24
1044 0.31
1045 0.29
1046 0.26
1047 0.26
1048 0.26
1049 0.27
1050 0.31
1051 0.3
1052 0.23
1053 0.24
1054 0.21
1055 0.21
1056 0.2
1057 0.19
1058 0.15
1059 0.14
1060 0.13
1061 0.12
1062 0.13
1063 0.1
1064 0.1
1065 0.1
1066 0.1
1067 0.08
1068 0.09
1069 0.09
1070 0.08
1071 0.1
1072 0.15
1073 0.2
1074 0.21
1075 0.22
1076 0.23
1077 0.25
1078 0.25
1079 0.27
1080 0.25
1081 0.2
1082 0.22
1083 0.23
1084 0.22
1085 0.21
1086 0.22
1087 0.2
1088 0.19
1089 0.19
1090 0.19
1091 0.18
1092 0.18
1093 0.2
1094 0.22
1095 0.26
1096 0.29
1097 0.3
1098 0.34
1099 0.33
1100 0.34
1101 0.36
1102 0.34
1103 0.3
1104 0.25
1105 0.24
1106 0.17
1107 0.17
1108 0.16
1109 0.13
1110 0.11
1111 0.09
1112 0.07
1113 0.07
1114 0.07
1115 0.06
1116 0.05
1117 0.04
1118 0.04
1119 0.05
1120 0.04
1121 0.04
1122 0.04
1123 0.05
1124 0.05
1125 0.05
1126 0.05
1127 0.05
1128 0.05
1129 0.05
1130 0.05
1131 0.04
1132 0.04
1133 0.05
1134 0.05
1135 0.05
1136 0.06
1137 0.05
1138 0.08
1139 0.08
1140 0.11
1141 0.15
1142 0.17
1143 0.18
1144 0.26
1145 0.29
1146 0.29
1147 0.29
1148 0.28
1149 0.26
1150 0.29
1151 0.32
1152 0.26
1153 0.26
1154 0.26
1155 0.25
1156 0.25
1157 0.24
1158 0.2
1159 0.18
1160 0.17
1161 0.17
1162 0.22
1163 0.23
1164 0.23
1165 0.26
1166 0.27
1167 0.26
1168 0.27
1169 0.29
1170 0.27
1171 0.27
1172 0.28
1173 0.25
1174 0.23
1175 0.26
1176 0.26
1177 0.23
1178 0.19
1179 0.18
1180 0.17
1181 0.17
1182 0.19
1183 0.14
1184 0.19
1185 0.21
1186 0.21
1187 0.21
1188 0.22
1189 0.22
1190 0.2
1191 0.24
1192 0.19
1193 0.19
1194 0.19
1195 0.21
1196 0.19
1197 0.19
1198 0.18
1199 0.14
1200 0.13
1201 0.1
1202 0.13
1203 0.17
1204 0.21
1205 0.21
1206 0.26
1207 0.26
1208 0.27
1209 0.29
1210 0.26
1211 0.21
1212 0.18
1213 0.18
1214 0.13
1215 0.14
1216 0.12
1217 0.11
1218 0.13
1219 0.11
1220 0.1
1221 0.11
1222 0.11
1223 0.13
1224 0.19
1225 0.2
1226 0.22
1227 0.28
1228 0.34
1229 0.4
1230 0.42
1231 0.42
1232 0.39
1233 0.41
1234 0.45
1235 0.45
1236 0.42
1237 0.37
1238 0.35
1239 0.38
1240 0.39
1241 0.34
1242 0.26
1243 0.24
1244 0.26
1245 0.24
1246 0.23
1247 0.21
1248 0.24
1249 0.25
1250 0.26
1251 0.25
1252 0.25
1253 0.31
1254 0.36
1255 0.35
1256 0.32
1257 0.31
1258 0.29
1259 0.3
1260 0.26
1261 0.23