Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H5L4

Protein Details
Accession C1H5L4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-47TEGNVRKRVCKACDRCRLKKSKCDGANPCGRCHydrophilic
289-316QQQQQQQQQQRQQRQQRQQQPPHDSQQRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pbl:PAAG_06055  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MVAHQPSSPLDASSPTEGNVRKRVCKACDRCRLKKSKCDGANPCGRCKTDNAICVFGERKKAHDKVYPKGYVEMLEQQQAQLVTGLQALYKLTLEGEGWPGGPLKKSGNGHPLTHDILERLGALKQEGHSIDEPFEDDIQLVQKRLIANGAGLMQRQDSSDGSESERSPTFPARPSPFEAPYSLNHNQFPPTPPSPNIFPVRAHQIQEHMLDVMAPQQQQHQFALQQQQQQQQQQRQQEQNKELFRNHFHQKTLSHNQRFQGQQTEMQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRQQRQQRQQQPPHDSQQRLPQPPAPNPPIFFNSSGVQPSMNPNLFQQQQPWPQEGGLDDAMDITSLNVPPMSFEALQQAQAFCRPVALAGGLNSCLPMQHDWTEDADFKAFLNPTATMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.27
4 0.3
5 0.35
6 0.41
7 0.44
8 0.46
9 0.54
10 0.62
11 0.63
12 0.69
13 0.73
14 0.75
15 0.8
16 0.82
17 0.84
18 0.86
19 0.89
20 0.87
21 0.87
22 0.85
23 0.84
24 0.82
25 0.83
26 0.8
27 0.79
28 0.8
29 0.74
30 0.73
31 0.69
32 0.62
33 0.54
34 0.5
35 0.5
36 0.47
37 0.5
38 0.46
39 0.43
40 0.42
41 0.43
42 0.43
43 0.36
44 0.39
45 0.33
46 0.35
47 0.4
48 0.45
49 0.47
50 0.51
51 0.54
52 0.54
53 0.62
54 0.62
55 0.54
56 0.53
57 0.48
58 0.42
59 0.39
60 0.37
61 0.29
62 0.28
63 0.26
64 0.23
65 0.25
66 0.23
67 0.2
68 0.13
69 0.11
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.07
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.2
93 0.22
94 0.27
95 0.35
96 0.37
97 0.37
98 0.38
99 0.39
100 0.35
101 0.34
102 0.29
103 0.2
104 0.17
105 0.16
106 0.13
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.14
114 0.14
115 0.17
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.16
120 0.17
121 0.13
122 0.13
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.08
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.15
150 0.18
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.19
158 0.2
159 0.26
160 0.28
161 0.31
162 0.34
163 0.36
164 0.35
165 0.34
166 0.32
167 0.28
168 0.25
169 0.29
170 0.28
171 0.26
172 0.25
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.26
177 0.24
178 0.23
179 0.24
180 0.25
181 0.27
182 0.28
183 0.31
184 0.31
185 0.26
186 0.24
187 0.24
188 0.3
189 0.29
190 0.28
191 0.23
192 0.22
193 0.23
194 0.23
195 0.21
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.13
205 0.15
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.18
211 0.26
212 0.25
213 0.28
214 0.31
215 0.36
216 0.39
217 0.44
218 0.47
219 0.46
220 0.49
221 0.52
222 0.54
223 0.57
224 0.6
225 0.61
226 0.61
227 0.61
228 0.6
229 0.56
230 0.51
231 0.47
232 0.45
233 0.43
234 0.44
235 0.41
236 0.37
237 0.37
238 0.37
239 0.41
240 0.48
241 0.52
242 0.51
243 0.51
244 0.51
245 0.53
246 0.53
247 0.46
248 0.42
249 0.34
250 0.34
251 0.35
252 0.42
253 0.38
254 0.42
255 0.45
256 0.41
257 0.45
258 0.45
259 0.48
260 0.48
261 0.55
262 0.59
263 0.61
264 0.66
265 0.67
266 0.69
267 0.68
268 0.68
269 0.66
270 0.64
271 0.64
272 0.64
273 0.64
274 0.64
275 0.64
276 0.64
277 0.64
278 0.64
279 0.64
280 0.65
281 0.66
282 0.66
283 0.67
284 0.69
285 0.71
286 0.74
287 0.77
288 0.79
289 0.8
290 0.84
291 0.86
292 0.88
293 0.87
294 0.87
295 0.85
296 0.81
297 0.8
298 0.78
299 0.7
300 0.63
301 0.63
302 0.63
303 0.59
304 0.56
305 0.53
306 0.51
307 0.55
308 0.61
309 0.57
310 0.51
311 0.48
312 0.49
313 0.46
314 0.43
315 0.38
316 0.31
317 0.27
318 0.25
319 0.26
320 0.22
321 0.19
322 0.16
323 0.2
324 0.25
325 0.25
326 0.23
327 0.23
328 0.3
329 0.32
330 0.32
331 0.31
332 0.32
333 0.4
334 0.42
335 0.44
336 0.38
337 0.36
338 0.36
339 0.32
340 0.28
341 0.2
342 0.17
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.12
356 0.16
357 0.13
358 0.14
359 0.2
360 0.21
361 0.24
362 0.24
363 0.23
364 0.2
365 0.23
366 0.25
367 0.17
368 0.18
369 0.15
370 0.14
371 0.15
372 0.15
373 0.13
374 0.13
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.13
380 0.12
381 0.13
382 0.13
383 0.16
384 0.18
385 0.21
386 0.22
387 0.25
388 0.28
389 0.28
390 0.27
391 0.24
392 0.21
393 0.19
394 0.23
395 0.21
396 0.19
397 0.2