Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3XE29

Protein Details
Accession W3XE29    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-52SEDPFAKKVKKAKKDKKYNKTREEPVVEEBasic
86-112VAGNDENKSKKKRKKNKKAAKEDDGEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-43KRQRMSEDPFAKKVKKAKKDKKYNK
93-106KSKKKRKKNKKAAK
249-310GRREKIKAKNEKLNDERHRRALEEEKQKVKKEQERLLKEGEKKGGADGIHPSRRGRVPGGRR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pfy:PFICI_02284  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MAKRKSEDNPATSDGDAKKRQRMSEDPFAKKVKKAKKDKKYNKTREEPVVEEDVVDLAMTDLDNGKIEQQQTKKDEQEEPAAENGVAGNDENKSKKKRKKNKKAAKEDDGEKATNADGEGAENDETAAAAVAGSNEGGENNKRQSAKKSRFIVFVGNLPYSATAEDVERHFTAVQPTAIRLLHEKTNPNKSRGIAFLEFAGYDRMKTCLKTMHHTTLKCQGRDHRGRPKLEERVINVELTAGGGGNTEGRREKIKAKNEKLNDERHRRALEEEKQKVKKEQERLLKEGEKKGGADGIHPSRRGRVPGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.47
4 0.46
5 0.5
6 0.53
7 0.57
8 0.58
9 0.62
10 0.62
11 0.64
12 0.69
13 0.67
14 0.68
15 0.71
16 0.67
17 0.64
18 0.65
19 0.64
20 0.65
21 0.7
22 0.74
23 0.78
24 0.87
25 0.92
26 0.93
27 0.95
28 0.95
29 0.94
30 0.93
31 0.89
32 0.87
33 0.82
34 0.74
35 0.67
36 0.61
37 0.5
38 0.41
39 0.33
40 0.23
41 0.17
42 0.14
43 0.09
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.07
52 0.09
53 0.11
54 0.14
55 0.2
56 0.23
57 0.31
58 0.35
59 0.41
60 0.43
61 0.44
62 0.47
63 0.44
64 0.48
65 0.42
66 0.39
67 0.34
68 0.3
69 0.26
70 0.21
71 0.18
72 0.1
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.1
78 0.14
79 0.2
80 0.28
81 0.38
82 0.48
83 0.58
84 0.68
85 0.76
86 0.84
87 0.9
88 0.92
89 0.94
90 0.96
91 0.94
92 0.91
93 0.86
94 0.78
95 0.73
96 0.65
97 0.54
98 0.43
99 0.34
100 0.26
101 0.2
102 0.16
103 0.09
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.06
126 0.08
127 0.1
128 0.14
129 0.16
130 0.18
131 0.26
132 0.36
133 0.43
134 0.49
135 0.54
136 0.53
137 0.53
138 0.53
139 0.48
140 0.38
141 0.34
142 0.27
143 0.21
144 0.18
145 0.16
146 0.15
147 0.11
148 0.1
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.11
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.17
170 0.2
171 0.26
172 0.29
173 0.4
174 0.43
175 0.43
176 0.44
177 0.41
178 0.4
179 0.36
180 0.37
181 0.27
182 0.24
183 0.21
184 0.19
185 0.18
186 0.15
187 0.16
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.18
196 0.21
197 0.28
198 0.33
199 0.41
200 0.46
201 0.46
202 0.47
203 0.5
204 0.55
205 0.49
206 0.47
207 0.45
208 0.49
209 0.58
210 0.63
211 0.64
212 0.65
213 0.67
214 0.7
215 0.71
216 0.7
217 0.66
218 0.63
219 0.56
220 0.56
221 0.54
222 0.46
223 0.37
224 0.28
225 0.22
226 0.17
227 0.13
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.12
236 0.14
237 0.18
238 0.21
239 0.31
240 0.36
241 0.46
242 0.55
243 0.61
244 0.69
245 0.72
246 0.79
247 0.75
248 0.77
249 0.77
250 0.77
251 0.74
252 0.72
253 0.68
254 0.6
255 0.6
256 0.59
257 0.58
258 0.59
259 0.62
260 0.64
261 0.68
262 0.71
263 0.72
264 0.72
265 0.71
266 0.7
267 0.71
268 0.72
269 0.72
270 0.72
271 0.73
272 0.71
273 0.69
274 0.67
275 0.63
276 0.55
277 0.48
278 0.45
279 0.41
280 0.34
281 0.3
282 0.31
283 0.35
284 0.38
285 0.4
286 0.4
287 0.43
288 0.48
289 0.5
290 0.49