Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3WWQ0

Protein Details
Accession W3WWQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
463-493DELKTWKTNRRANYHRKRRRWARVRHIVDTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
473-485RANYHRKRRRWAR
624-646KPAAGKVEARGKGLRNKKRKVGE
Subcellular Location(s) cyto 13.5, nucl 9, cyto_mito 9, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG pfy:PFICI_11436  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSLVQPDAWVALKLPNGTLRVLQVTPNTTISLGKYGSFPSNLIIQRPYHLTYELQSKLESENFHRLRIVPASELYADILASRDSSNSPDSPTSDPEDDDEDGADAAVTSGAEYTLVDASSGAVVAKSDETAVLNDVAAASATQTLSMEEIEALKKDGSGAGQDIIAKLMLSHTALDQKTEYSLAKYKLLKTRKYIRRFTVLPMDVPLFDHWLLEERDSTKILEMREEMIGLLGCWANVHWGGEDDRENEAEDVNDDESTEIDNAQGRYLVVDDTGGLLVAAMAERLGILYPSEKRGSLDEYLEAQKTPQQRREERNRTKAAIENDGVTEDLKQEEDEEAPRAQQQESEVKIEETDEAQPEPEPEAVNDRTETSSAPKKYPSGSGKRGDDGVPYAKSNTLTLVHANSQPNLSLLKYYDFDITNPTQSLDHPLARNLMALSWLQLLEPTADTTYMAEPPAVSSDELKTWKTNRRANYHRKRRRWARVRHIVDTARAGSFSGLVVASTMDPISIMKHAVPLLAGGAPIAIYSPTIEPLTKLADCYSIARRGAWISDPPEGVAEKTPEELEHWGGTEEYPLNPTLVLGAALQTSRVRKWQVLPGRTHPLMTSRGGAEGYVFTAWKVKPAAGKVEARGKGLRNKKRKVGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.22
4 0.23
5 0.24
6 0.25
7 0.24
8 0.25
9 0.25
10 0.26
11 0.26
12 0.28
13 0.29
14 0.29
15 0.27
16 0.23
17 0.24
18 0.23
19 0.23
20 0.2
21 0.18
22 0.18
23 0.21
24 0.24
25 0.23
26 0.22
27 0.19
28 0.26
29 0.27
30 0.28
31 0.29
32 0.26
33 0.28
34 0.32
35 0.33
36 0.27
37 0.28
38 0.26
39 0.26
40 0.33
41 0.33
42 0.3
43 0.28
44 0.27
45 0.28
46 0.31
47 0.31
48 0.27
49 0.35
50 0.35
51 0.36
52 0.37
53 0.35
54 0.36
55 0.37
56 0.34
57 0.26
58 0.26
59 0.27
60 0.25
61 0.25
62 0.21
63 0.16
64 0.13
65 0.1
66 0.1
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.17
74 0.17
75 0.21
76 0.22
77 0.25
78 0.27
79 0.29
80 0.32
81 0.29
82 0.28
83 0.27
84 0.28
85 0.26
86 0.23
87 0.2
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.1
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.14
162 0.14
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.14
170 0.2
171 0.2
172 0.26
173 0.29
174 0.34
175 0.41
176 0.48
177 0.49
178 0.52
179 0.6
180 0.64
181 0.69
182 0.71
183 0.68
184 0.68
185 0.65
186 0.62
187 0.61
188 0.52
189 0.44
190 0.38
191 0.34
192 0.26
193 0.26
194 0.22
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.1
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.07
219 0.07
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.05
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.03
277 0.05
278 0.07
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.14
288 0.15
289 0.17
290 0.17
291 0.15
292 0.12
293 0.14
294 0.2
295 0.24
296 0.29
297 0.35
298 0.41
299 0.5
300 0.61
301 0.69
302 0.71
303 0.75
304 0.73
305 0.67
306 0.62
307 0.58
308 0.49
309 0.43
310 0.34
311 0.25
312 0.21
313 0.2
314 0.18
315 0.13
316 0.1
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.19
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.15
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.2
362 0.21
363 0.22
364 0.23
365 0.24
366 0.25
367 0.33
368 0.36
369 0.38
370 0.43
371 0.47
372 0.48
373 0.47
374 0.47
375 0.39
376 0.33
377 0.27
378 0.24
379 0.19
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.16
385 0.15
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.14
390 0.15
391 0.19
392 0.2
393 0.19
394 0.18
395 0.17
396 0.16
397 0.15
398 0.13
399 0.09
400 0.09
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.15
405 0.14
406 0.14
407 0.18
408 0.19
409 0.19
410 0.18
411 0.18
412 0.15
413 0.15
414 0.2
415 0.18
416 0.21
417 0.19
418 0.2
419 0.21
420 0.21
421 0.21
422 0.16
423 0.12
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.11
450 0.15
451 0.17
452 0.18
453 0.2
454 0.25
455 0.34
456 0.41
457 0.46
458 0.49
459 0.57
460 0.66
461 0.74
462 0.79
463 0.82
464 0.84
465 0.87
466 0.91
467 0.92
468 0.93
469 0.92
470 0.91
471 0.91
472 0.91
473 0.88
474 0.82
475 0.78
476 0.69
477 0.61
478 0.54
479 0.44
480 0.34
481 0.27
482 0.23
483 0.16
484 0.14
485 0.11
486 0.08
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.04
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.07
499 0.08
500 0.07
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.06
518 0.08
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.12
523 0.17
524 0.16
525 0.16
526 0.15
527 0.16
528 0.17
529 0.21
530 0.24
531 0.25
532 0.26
533 0.25
534 0.26
535 0.25
536 0.26
537 0.25
538 0.26
539 0.23
540 0.27
541 0.27
542 0.25
543 0.26
544 0.24
545 0.23
546 0.21
547 0.19
548 0.16
549 0.18
550 0.18
551 0.16
552 0.18
553 0.19
554 0.18
555 0.16
556 0.16
557 0.15
558 0.15
559 0.15
560 0.16
561 0.15
562 0.13
563 0.14
564 0.14
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.1
576 0.13
577 0.16
578 0.17
579 0.23
580 0.26
581 0.3
582 0.35
583 0.44
584 0.5
585 0.55
586 0.6
587 0.61
588 0.67
589 0.63
590 0.58
591 0.5
592 0.44
593 0.41
594 0.36
595 0.32
596 0.24
597 0.25
598 0.24
599 0.23
600 0.19
601 0.16
602 0.15
603 0.12
604 0.11
605 0.1
606 0.16
607 0.16
608 0.2
609 0.21
610 0.22
611 0.27
612 0.31
613 0.39
614 0.39
615 0.44
616 0.45
617 0.53
618 0.53
619 0.51
620 0.52
621 0.5
622 0.53
623 0.59
624 0.64
625 0.64
626 0.71