Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H5Z0

Protein Details
Accession C1H5Z0    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-84DPDAFRTTKRDKRQIKHSIFLSKIEKSRSKTLKRRRPSKKLIANLDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-77KRQIKHSIFLSKIEKSRSKTLKRRRPSKK
128-149TLKHKPGAMKRKEKLDRRERER
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG pbl:PAAG_06100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MATFNAPIAPQKLTATRANSSRQPIASSPSNHISPFTDPDAFRTTKRDKRQIKHSIFLSKIEKSRSKTLKRRRPSKKLIANLDSLVDALPDAGDGDDNGTFNHHHKNGPANNKRQMLDSQVNTIRQKTLKHKPGAMKRKEKLDRRERERFARNLAQMAVPPITSGTNTNANAAVNAQTQVQTQAETQPSTSNRWAALRNFISQTIDQNPESEVAALTCSPPRDGGIDDMQSPHAEMIEERAGVPMLKDSYPAVAWTETI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.36
4 0.39
5 0.44
6 0.47
7 0.49
8 0.5
9 0.46
10 0.45
11 0.41
12 0.42
13 0.44
14 0.41
15 0.4
16 0.4
17 0.41
18 0.37
19 0.36
20 0.33
21 0.29
22 0.3
23 0.28
24 0.28
25 0.26
26 0.3
27 0.35
28 0.34
29 0.32
30 0.35
31 0.41
32 0.45
33 0.54
34 0.61
35 0.64
36 0.7
37 0.8
38 0.83
39 0.8
40 0.78
41 0.74
42 0.72
43 0.64
44 0.62
45 0.56
46 0.5
47 0.48
48 0.47
49 0.48
50 0.45
51 0.53
52 0.57
53 0.62
54 0.67
55 0.75
56 0.78
57 0.82
58 0.88
59 0.89
60 0.9
61 0.89
62 0.9
63 0.88
64 0.86
65 0.85
66 0.77
67 0.69
68 0.59
69 0.49
70 0.39
71 0.29
72 0.2
73 0.11
74 0.07
75 0.05
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.09
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.17
93 0.26
94 0.31
95 0.41
96 0.47
97 0.48
98 0.54
99 0.57
100 0.56
101 0.5
102 0.45
103 0.41
104 0.38
105 0.32
106 0.3
107 0.29
108 0.32
109 0.3
110 0.3
111 0.26
112 0.22
113 0.26
114 0.29
115 0.36
116 0.41
117 0.42
118 0.47
119 0.52
120 0.6
121 0.66
122 0.67
123 0.67
124 0.61
125 0.69
126 0.72
127 0.72
128 0.73
129 0.73
130 0.74
131 0.73
132 0.8
133 0.74
134 0.74
135 0.73
136 0.66
137 0.62
138 0.58
139 0.51
140 0.43
141 0.39
142 0.32
143 0.25
144 0.24
145 0.18
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.14
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.2
175 0.21
176 0.25
177 0.27
178 0.24
179 0.23
180 0.26
181 0.3
182 0.26
183 0.34
184 0.31
185 0.32
186 0.32
187 0.31
188 0.32
189 0.28
190 0.3
191 0.26
192 0.28
193 0.25
194 0.24
195 0.23
196 0.21
197 0.21
198 0.17
199 0.12
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.16
211 0.19
212 0.22
213 0.22
214 0.23
215 0.24
216 0.24
217 0.22
218 0.21
219 0.16
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.15
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.16
235 0.15
236 0.18
237 0.18
238 0.19
239 0.17