FuNGI

C1H5H3

Protein Details

Accession

C1H5H3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-82	FPEHRKRSRICTFKQQRAVR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	pbl:PAAG_06014 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MAVRGERFHINLSSDDEDDNVHDYCPSLASPSLDFVGDIRERAPSATPLPPAPPRLPSTSTGFPEHRKRSRICTFKQQRAVRDSVAHKQPPPRRASTTPAASLASSTTAEKNSIDEENEKRLAAMSPAEIERERGELISALPQSLIERFLRRANIDEDHQQEGIRPRTSRENKDSNCTLEEQPEQSGITSTSTQPQKPTNSVSFDVPSSPPPTTENQSQQPTIEDLPPHHPPSELCSASAFPTGPIHFPKPPPRQSPMPNLDPSSPSFLEDLQTHYFPDTPHDPSLLSWLQPDSYSSATDYGPYPPASPYHPDSSATSISPASLRFSLAGNILAPRTSLAIPTTLGLHHHANDPEAAGYTISELAILSRSSFPAQRCLAWQVLGRLLYRLGKGEFGEKESALVEGLWSAVEREGVVAGMLVEAGGGGGGGGGGSNAASGANVAGRIGKHASAKAWATEAVWLWRRGGGGDRGLTREGTLRSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.23
4	0.21
5	0.2
6	0.21
7	0.15
8	0.12
9	0.11
10	0.12
11	0.12
12	0.13
13	0.11
14	0.11
15	0.13
16	0.15
17	0.16
18	0.17
19	0.18
20	0.16
21	0.16
22	0.13
23	0.19
24	0.17
25	0.17
26	0.15
27	0.17
28	0.17
29	0.18
30	0.21
31	0.17
32	0.21
33	0.25
34	0.27
35	0.27
36	0.32
37	0.35
38	0.39
39	0.38
40	0.39
41	0.38
42	0.42
43	0.43
44	0.41
45	0.43
46	0.45
47	0.45
48	0.46
49	0.46
50	0.48
51	0.55
52	0.61
53	0.62
54	0.62
55	0.63
56	0.66
57	0.72
58	0.74
59	0.7
60	0.71
61	0.74
62	0.76
63	0.82
64	0.78
65	0.76
66	0.73
67	0.71
68	0.63
69	0.6
70	0.55
71	0.54
72	0.57
73	0.54
74	0.52
75	0.57
76	0.61
77	0.62
78	0.64
79	0.6
80	0.59
81	0.59
82	0.61
83	0.6
84	0.59
85	0.53
86	0.48
87	0.43
88	0.35
89	0.31
90	0.25
91	0.18
92	0.13
93	0.12
94	0.13
95	0.13
96	0.14
97	0.14
98	0.14
99	0.15
100	0.16
101	0.16
102	0.19
103	0.22
104	0.27
105	0.28
106	0.26
107	0.24
108	0.23
109	0.22
110	0.18
111	0.16
112	0.11
113	0.12
114	0.13
115	0.15
116	0.14
117	0.15
118	0.14
119	0.14
120	0.14
121	0.11
122	0.11
123	0.1
124	0.1
125	0.14
126	0.13
127	0.12
128	0.11
129	0.11
130	0.12
131	0.12
132	0.14
133	0.1
134	0.13
135	0.15
136	0.19
137	0.21
138	0.22
139	0.24
140	0.25
141	0.26
142	0.27
143	0.3
144	0.3
145	0.3
146	0.29
147	0.26
148	0.25
149	0.29
150	0.31
151	0.29
152	0.26
153	0.26
154	0.37
155	0.45
156	0.49
157	0.51
158	0.56
159	0.54
160	0.61
161	0.61
162	0.53
163	0.47
164	0.42
165	0.35
166	0.29
167	0.29
168	0.23
169	0.21
170	0.19
171	0.17
172	0.14
173	0.13
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.16
179	0.19
180	0.2
181	0.22
182	0.27
183	0.29
184	0.3
185	0.35
186	0.32
187	0.33
188	0.33
189	0.32
190	0.28
191	0.25
192	0.24
193	0.2
194	0.18
195	0.16
196	0.15
197	0.14
198	0.15
199	0.17
200	0.2
201	0.24
202	0.27
203	0.3
204	0.33
205	0.33
206	0.31
207	0.29
208	0.27
209	0.23
210	0.2
211	0.15
212	0.14
213	0.18
214	0.21
215	0.22
216	0.2
217	0.19
218	0.17
219	0.22
220	0.27
221	0.23
222	0.19
223	0.18
224	0.19
225	0.19
226	0.2
227	0.15
228	0.08
229	0.1
230	0.1
231	0.11
232	0.13
233	0.15
234	0.17
235	0.21
236	0.31
237	0.37
238	0.44
239	0.47
240	0.5
241	0.53
242	0.56
243	0.62
244	0.58
245	0.54
246	0.49
247	0.46
248	0.42
249	0.37
250	0.34
251	0.29
252	0.23
253	0.19
254	0.17
255	0.16
256	0.16
257	0.15
258	0.18
259	0.14
260	0.14
261	0.13
262	0.13
263	0.15
264	0.13
265	0.17
266	0.16
267	0.17
268	0.17
269	0.18
270	0.18
271	0.16
272	0.22
273	0.19
274	0.16
275	0.13
276	0.13
277	0.13
278	0.12
279	0.13
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.14
294	0.15
295	0.19
296	0.2
297	0.22
298	0.23
299	0.23
300	0.24
301	0.27
302	0.26
303	0.22
304	0.2
305	0.15
306	0.15
307	0.14
308	0.13
309	0.12
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.09
324	0.08
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.09
332	0.1
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.17
337	0.17
338	0.17
339	0.17
340	0.17
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.1
357	0.12
358	0.17
359	0.17
360	0.24
361	0.25
362	0.25
363	0.27
364	0.29
365	0.29
366	0.27
367	0.28
368	0.24
369	0.26
370	0.26
371	0.24
372	0.21
373	0.22
374	0.22
375	0.2
376	0.21
377	0.18
378	0.18
379	0.19
380	0.24
381	0.23
382	0.24
383	0.26
384	0.22
385	0.22
386	0.2
387	0.19
388	0.14
389	0.12
390	0.08
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.02
412	0.02
413	0.02
414	0.02
415	0.02
416	0.02
417	0.02
418	0.02
419	0.02
420	0.02
421	0.02
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.08
431	0.09
432	0.12
433	0.14
434	0.17
435	0.2
436	0.22
437	0.24
438	0.27
439	0.29
440	0.27
441	0.27
442	0.25
443	0.22
444	0.23
445	0.24
446	0.26
447	0.29
448	0.29
449	0.28
450	0.29
451	0.29
452	0.27
453	0.31
454	0.28
455	0.29
456	0.33
457	0.35
458	0.36
459	0.38
460	0.36
461	0.31
462	0.32

C1H5H3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer