Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X415

Protein Details
Accession W3X415    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-116GVWVIRKQTRRKRPGEEDEIHydrophilic
289-317AKTPKTPNSGISKPKRKKTKTGLTPGATPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-308GTKEAKTPKTPNSGISKPKRKKTK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, pero 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pfy:PFICI_08329  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MGSTDIPLDEIQWHHPQLADSMQGIHSNSVLFYFAESPFFDKTSNNAVIANQAMFNPAMYQYIQTREAFEGRLKTMSGVEFIVAEQPAQMAPGTGTGVWVIRKQTRRKRPGEEDEIIVHSSYYVVGYNIYMAPTLADILSFRMATITNSLRKCFPAADEARTWSPAQGHAYKPQPATTNSRERQLAASKEATPLPDSQAAAGKPSEPKKSAQSSILDARLAEHSFAVQMQYGGEYMDENPITGHPGSFHLSSTGRKERPRAPTLNPLTTNLKNPVSTKAVDKKDGTKEAKTPKTPNSGISKPKRKKTKTGLTPGATPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.25
4 0.25
5 0.26
6 0.23
7 0.17
8 0.19
9 0.19
10 0.2
11 0.2
12 0.18
13 0.16
14 0.14
15 0.13
16 0.11
17 0.11
18 0.09
19 0.09
20 0.12
21 0.11
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.17
28 0.15
29 0.19
30 0.24
31 0.26
32 0.24
33 0.23
34 0.22
35 0.24
36 0.24
37 0.21
38 0.14
39 0.12
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.11
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.19
52 0.21
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.24
57 0.23
58 0.22
59 0.23
60 0.2
61 0.19
62 0.19
63 0.18
64 0.16
65 0.13
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.1
87 0.13
88 0.19
89 0.27
90 0.37
91 0.47
92 0.56
93 0.65
94 0.71
95 0.76
96 0.8
97 0.81
98 0.8
99 0.72
100 0.63
101 0.56
102 0.5
103 0.41
104 0.31
105 0.21
106 0.13
107 0.1
108 0.08
109 0.06
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.1
133 0.12
134 0.17
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.21
139 0.21
140 0.18
141 0.16
142 0.18
143 0.19
144 0.22
145 0.22
146 0.24
147 0.23
148 0.24
149 0.23
150 0.16
151 0.14
152 0.13
153 0.16
154 0.18
155 0.19
156 0.23
157 0.26
158 0.29
159 0.29
160 0.29
161 0.28
162 0.27
163 0.33
164 0.34
165 0.41
166 0.38
167 0.41
168 0.39
169 0.37
170 0.38
171 0.37
172 0.33
173 0.26
174 0.27
175 0.24
176 0.26
177 0.25
178 0.22
179 0.18
180 0.17
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.14
185 0.17
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.18
191 0.22
192 0.26
193 0.24
194 0.27
195 0.32
196 0.38
197 0.39
198 0.37
199 0.35
200 0.35
201 0.38
202 0.37
203 0.3
204 0.24
205 0.23
206 0.22
207 0.2
208 0.16
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.09
232 0.12
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.17
238 0.21
239 0.28
240 0.34
241 0.37
242 0.4
243 0.46
244 0.51
245 0.58
246 0.63
247 0.61
248 0.57
249 0.63
250 0.66
251 0.68
252 0.62
253 0.57
254 0.55
255 0.52
256 0.52
257 0.46
258 0.42
259 0.36
260 0.36
261 0.38
262 0.35
263 0.34
264 0.37
265 0.41
266 0.44
267 0.47
268 0.48
269 0.51
270 0.55
271 0.63
272 0.6
273 0.56
274 0.58
275 0.63
276 0.69
277 0.69
278 0.66
279 0.65
280 0.7
281 0.66
282 0.65
283 0.63
284 0.62
285 0.65
286 0.7
287 0.73
288 0.73
289 0.81
290 0.85
291 0.83
292 0.86
293 0.87
294 0.87
295 0.87
296 0.88
297 0.88
298 0.81