FuNGI

C1H0U6

Protein Details

Accession

C1H0U6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
134-158	KGGKSVSTSKPKRERENKRALVQPP	Hydrophilic
626-647	ENAQVVKRRHEKEEKSRNHDEE	Basic
708-728	QIAKRNRIIAKNRMLRRNRKN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
125-152	EPRHRKVDEKGGKSVSTSKPKRERENKR
549-560	KLRKSKGKGIIR
710-728	AKRNRIIAKNRMLRRNRKN

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034809 Nop4_RRM4 IPR034808 Nop4p_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	pbl:PAAG_04390 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12676 RRM3_Nop4p cd12677 RRM4_Nop4p

Amino Acid Sequences

MTDTRDRRRLSDSGSFQEDGKVPATNQQTEALPDGDAALSPIKAKNRRTLFVRSLPLSATTESLTDYFSQSYPLKHATVVLDPQTKQSKGYGFVTFADCEDVARALEEFNGSAFDGKKLKIEVAEPRHRKVDEKGGKSVSTSKPKRERENKRALVQPPKLIIRNLPWSIAEPEQLEALFRSFGKVKHAVIPKKGNKHSGFGFVVLRGRKNAEKALEAVNGKEVDGRTLAVDWAAEKNIWDELQNHTDGVKDDGTEKEDNNSGEDDEETKNKDDDVAMGEVDDEDEEEDDDDDEDDDEEVHAEVEDDRNASTIFIRNLPFTATDESLYEHFVQFGPLRYARVVFDPETDRPRGTAFVCFWDKENANSCLRDAPKRTDLPRAEDAKAKTSAIKYSVLEDEKKDPSGKYTMDGRVLQLSPAVSKSQAVKLEAEGSSRRETRDKDKRRLFLLSEGTIPSNCALYKQLTSSEIAMREASAKQRQKLIKSNPVLHLSLTRLSVRNLPRNIDSKALKALAREAVVGFAKDVKSGLREPLSREELHRSNEDMKEAEKLRKSKGKGIIRQAKVVFEGKEGSKINEKSGAGRSRGYGFIEYYSHRSALMGLRWLNGHAVAGPDGKKKRLIVEFAIENAQVVKRRHEKEEKSRNHDEEGQKQQKRASRNEVSYQRDSSRFNSNTLKGIKRKRVESDGQGNENMTRASKPNDSKPEKDNQIAKRNRIIAKNRMLRRNRKN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.53
3	0.47
4	0.47
5	0.42
6	0.34
7	0.29
8	0.25
9	0.2
10	0.26
11	0.32
12	0.29
13	0.3
14	0.3
15	0.3
16	0.3
17	0.32
18	0.26
19	0.2
20	0.17
21	0.16
22	0.13
23	0.12
24	0.11
25	0.1
26	0.09
27	0.11
28	0.16
29	0.23
30	0.31
31	0.36
32	0.44
33	0.5
34	0.56
35	0.59
36	0.64
37	0.64
38	0.65
39	0.68
40	0.61
41	0.55
42	0.5
43	0.47
44	0.41
45	0.33
46	0.26
47	0.19
48	0.17
49	0.17
50	0.16
51	0.14
52	0.13
53	0.14
54	0.14
55	0.13
56	0.18
57	0.19
58	0.2
59	0.24
60	0.26
61	0.25
62	0.24
63	0.27
64	0.24
65	0.27
66	0.3
67	0.32
68	0.34
69	0.33
70	0.4
71	0.44
72	0.41
73	0.38
74	0.38
75	0.36
76	0.34
77	0.38
78	0.35
79	0.29
80	0.31
81	0.33
82	0.29
83	0.25
84	0.23
85	0.19
86	0.16
87	0.15
88	0.13
89	0.1
90	0.1
91	0.1
92	0.08
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.1
100	0.11
101	0.14
102	0.16
103	0.17
104	0.2
105	0.2
106	0.22
107	0.21
108	0.24
109	0.3
110	0.37
111	0.47
112	0.49
113	0.51
114	0.56
115	0.54
116	0.54
117	0.5
118	0.51
119	0.5
120	0.51
121	0.54
122	0.52
123	0.51
124	0.49
125	0.52
126	0.49
127	0.51
128	0.51
129	0.54
130	0.61
131	0.69
132	0.78
133	0.8
134	0.83
135	0.82
136	0.88
137	0.86
138	0.82
139	0.82
140	0.78
141	0.78
142	0.71
143	0.66
144	0.6
145	0.57
146	0.53
147	0.46
148	0.43
149	0.39
150	0.42
151	0.38
152	0.34
153	0.3
154	0.3
155	0.32
156	0.3
157	0.26
158	0.18
159	0.18
160	0.17
161	0.16
162	0.14
163	0.11
164	0.1
165	0.09
166	0.08
167	0.11
168	0.13
169	0.14
170	0.2
171	0.23
172	0.24
173	0.31
174	0.4
175	0.42
176	0.48
177	0.57
178	0.58
179	0.64
180	0.67
181	0.68
182	0.62
183	0.61
184	0.55
185	0.52
186	0.45
187	0.38
188	0.34
189	0.27
190	0.3
191	0.27
192	0.26
193	0.21
194	0.23
195	0.24
196	0.26
197	0.29
198	0.26
199	0.26
200	0.27
201	0.29
202	0.3
203	0.28
204	0.25
205	0.24
206	0.21
207	0.19
208	0.2
209	0.16
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.14
229	0.17
230	0.17
231	0.16
232	0.15
233	0.16
234	0.16
235	0.17
236	0.13
237	0.1
238	0.12
239	0.13
240	0.16
241	0.16
242	0.16
243	0.16
244	0.18
245	0.18
246	0.18
247	0.17
248	0.13
249	0.13
250	0.13
251	0.13
252	0.12
253	0.14
254	0.15
255	0.15
256	0.15
257	0.14
258	0.15
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.11
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.06
297	0.07
298	0.09
299	0.1
300	0.13
301	0.14
302	0.14
303	0.14
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.15
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.13
314	0.12
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.1
319	0.09
320	0.11
321	0.12
322	0.12
323	0.13
324	0.13
325	0.14
326	0.13
327	0.14
328	0.15
329	0.12
330	0.14
331	0.17
332	0.19
333	0.22
334	0.22
335	0.2
336	0.18
337	0.19
338	0.18
339	0.15
340	0.16
341	0.13
342	0.18
343	0.19
344	0.19
345	0.2
346	0.22
347	0.21
348	0.2
349	0.24
350	0.22
351	0.22
352	0.22
353	0.21
354	0.22
355	0.24
356	0.26
357	0.24
358	0.26
359	0.3
360	0.35
361	0.36
362	0.4
363	0.4
364	0.42
365	0.46
366	0.45
367	0.4
368	0.4
369	0.4
370	0.35
371	0.34
372	0.28
373	0.24
374	0.21
375	0.21
376	0.18
377	0.19
378	0.15
379	0.17
380	0.2
381	0.2
382	0.2
383	0.2
384	0.22
385	0.22
386	0.23
387	0.22
388	0.18
389	0.19
390	0.21
391	0.2
392	0.18
393	0.22
394	0.23
395	0.25
396	0.25
397	0.23
398	0.23
399	0.23
400	0.2
401	0.15
402	0.13
403	0.1
404	0.11
405	0.11
406	0.08
407	0.09
408	0.11
409	0.14
410	0.16
411	0.17
412	0.16
413	0.17
414	0.2
415	0.19
416	0.19
417	0.16
418	0.17
419	0.2
420	0.2
421	0.22
422	0.22
423	0.26
424	0.34
425	0.43
426	0.5
427	0.57
428	0.63
429	0.66
430	0.65
431	0.65
432	0.57
433	0.53
434	0.48
435	0.39
436	0.33
437	0.29
438	0.27
439	0.22
440	0.21
441	0.14
442	0.1
443	0.09
444	0.08
445	0.09
446	0.11
447	0.12
448	0.12
449	0.14
450	0.14
451	0.15
452	0.16
453	0.17
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.13
458	0.14
459	0.14
460	0.18
461	0.24
462	0.27
463	0.29
464	0.36
465	0.4
466	0.44
467	0.52
468	0.55
469	0.56
470	0.58
471	0.62
472	0.59
473	0.59
474	0.53
475	0.44
476	0.38
477	0.31
478	0.27
479	0.23
480	0.2
481	0.18
482	0.18
483	0.25
484	0.29
485	0.35
486	0.35
487	0.36
488	0.38
489	0.41
490	0.42
491	0.41
492	0.37
493	0.3
494	0.32
495	0.32
496	0.28
497	0.24
498	0.26
499	0.22
500	0.21
501	0.19
502	0.15
503	0.15
504	0.15
505	0.15
506	0.12
507	0.12
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.09
512	0.12
513	0.14
514	0.18
515	0.21
516	0.22
517	0.26
518	0.33
519	0.37
520	0.34
521	0.36
522	0.39
523	0.38
524	0.4
525	0.38
526	0.34
527	0.36
528	0.36
529	0.36
530	0.29
531	0.25
532	0.28
533	0.29
534	0.32
535	0.33
536	0.34
537	0.4
538	0.46
539	0.49
540	0.51
541	0.58
542	0.61
543	0.63
544	0.7
545	0.73
546	0.68
547	0.72
548	0.64
549	0.56
550	0.49
551	0.45
552	0.35
553	0.26
554	0.28
555	0.21
556	0.27
557	0.26
558	0.26
559	0.3
560	0.31
561	0.31
562	0.34
563	0.33
564	0.31
565	0.39
566	0.42
567	0.36
568	0.36
569	0.36
570	0.33
571	0.34
572	0.32
573	0.26
574	0.21
575	0.21
576	0.22
577	0.22
578	0.24
579	0.24
580	0.22
581	0.2
582	0.19
583	0.19
584	0.22
585	0.22
586	0.23
587	0.22
588	0.23
589	0.23
590	0.24
591	0.22
592	0.17
593	0.15
594	0.1
595	0.1
596	0.11
597	0.14
598	0.16
599	0.23
600	0.26
601	0.29
602	0.32
603	0.32
604	0.38
605	0.41
606	0.43
607	0.39
608	0.43
609	0.42
610	0.4
611	0.4
612	0.32
613	0.26
614	0.23
615	0.22
616	0.21
617	0.21
618	0.28
619	0.36
620	0.4
621	0.49
622	0.58
623	0.65
624	0.7
625	0.79
626	0.8
627	0.8
628	0.85
629	0.79
630	0.74
631	0.73
632	0.69
633	0.67
634	0.68
635	0.7
636	0.65
637	0.64
638	0.64
639	0.61
640	0.62
641	0.61
642	0.6
643	0.59
644	0.61
645	0.68
646	0.72
647	0.74
648	0.72
649	0.68
650	0.63
651	0.58
652	0.56
653	0.49
654	0.51
655	0.45
656	0.45
657	0.48
658	0.45
659	0.49
660	0.52
661	0.57
662	0.56
663	0.64
664	0.69
665	0.68
666	0.73
667	0.73
668	0.74
669	0.73
670	0.74
671	0.74
672	0.72
673	0.68
674	0.63
675	0.56
676	0.48
677	0.42
678	0.34
679	0.25
680	0.2
681	0.19
682	0.23
683	0.31
684	0.37
685	0.45
686	0.55
687	0.61
688	0.63
689	0.65
690	0.71
691	0.69
692	0.7
693	0.69
694	0.68
695	0.71
696	0.74
697	0.74
698	0.73
699	0.74
700	0.73
701	0.74
702	0.72
703	0.72
704	0.74
705	0.78
706	0.78
707	0.8
708	0.83

C1H0U6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer