Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W3X2H3

Protein Details
Accession W3X2H3    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-72QRAQRGQESNTKKRRRGYGKNDIRVKMHydrophilic
266-285VYDKNNKRHKKDKSPPMMMSHydrophilic
436-464SEEVAPKRKKSKSASPQPRKKTEKDTEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-61KRRR
407-457PKRAEPVTSPKLKSIESPPAKRKASEEPASEEVAPKRKKSKSASPQPRKKT
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 9.333, cyto 8.5, cyto_mito 7.333, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG pfy:PFICI_09450  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MAASKPVLDGLFAVNKPTGMSSAQVIRDCQEQFNPSTFFKPMIDEQRAQRGQESNTKKRRRGYGKNDIRVKMGHGGTLDPLATGVLILGLGKGTKSLQSFLDCTKTYETVVLFGASTDTYDRVGKILKKTSYDHITKPMVEEALNGFRGKLQQMPPLYSALKMEGKPLYEYAREGKPIPREIATREVTVTDLELVEYYEPGTHDHRWPAEDATQFEKSFAEQVWKIEKDQMTKEKRTPEEEEEEKAALERYERVKQKADERVDELVYDKNNKRHKKDKSPPMMMSGALGDHPPEKKQGKGSNLLPPPHDPNTPPPWTDKGPPAARIRMTVTSGFYVRSFCHDLGAKIGSSAMMAELSRSRQGDFKLGTENCLEYHDIMKGEEVWAPQVEAALMQWHEKSKPGAAQAPKRAEPVTSPKLKSIESPPAKRKASEEPASEEVAPKRKKSKSASPQPRKKTEKDTEEEWKGFDDPAVPQQDGAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.21
4 0.21
5 0.19
6 0.13
7 0.14
8 0.15
9 0.21
10 0.26
11 0.27
12 0.27
13 0.27
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.3
18 0.3
19 0.31
20 0.35
21 0.37
22 0.33
23 0.35
24 0.33
25 0.3
26 0.27
27 0.29
28 0.31
29 0.36
30 0.4
31 0.42
32 0.45
33 0.53
34 0.55
35 0.51
36 0.49
37 0.44
38 0.43
39 0.48
40 0.54
41 0.54
42 0.62
43 0.7
44 0.71
45 0.74
46 0.8
47 0.81
48 0.82
49 0.82
50 0.83
51 0.84
52 0.88
53 0.89
54 0.8
55 0.72
56 0.62
57 0.55
58 0.51
59 0.41
60 0.33
61 0.25
62 0.25
63 0.23
64 0.23
65 0.19
66 0.11
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.06
81 0.09
82 0.11
83 0.13
84 0.15
85 0.18
86 0.21
87 0.23
88 0.29
89 0.26
90 0.27
91 0.28
92 0.27
93 0.24
94 0.25
95 0.22
96 0.17
97 0.17
98 0.15
99 0.12
100 0.1
101 0.11
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.16
111 0.2
112 0.25
113 0.32
114 0.34
115 0.37
116 0.4
117 0.46
118 0.49
119 0.48
120 0.45
121 0.44
122 0.44
123 0.41
124 0.39
125 0.34
126 0.27
127 0.22
128 0.21
129 0.17
130 0.18
131 0.19
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.17
136 0.17
137 0.2
138 0.18
139 0.23
140 0.25
141 0.28
142 0.28
143 0.29
144 0.29
145 0.23
146 0.21
147 0.19
148 0.21
149 0.18
150 0.21
151 0.19
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.2
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.2
160 0.2
161 0.21
162 0.24
163 0.27
164 0.29
165 0.3
166 0.28
167 0.27
168 0.28
169 0.34
170 0.32
171 0.27
172 0.24
173 0.22
174 0.2
175 0.19
176 0.16
177 0.09
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.15
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.21
197 0.21
198 0.21
199 0.22
200 0.25
201 0.23
202 0.22
203 0.21
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.13
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.23
214 0.25
215 0.24
216 0.29
217 0.35
218 0.36
219 0.39
220 0.42
221 0.45
222 0.45
223 0.47
224 0.46
225 0.41
226 0.41
227 0.39
228 0.37
229 0.31
230 0.29
231 0.24
232 0.2
233 0.16
234 0.1
235 0.08
236 0.1
237 0.13
238 0.2
239 0.23
240 0.26
241 0.3
242 0.33
243 0.4
244 0.44
245 0.44
246 0.39
247 0.39
248 0.38
249 0.33
250 0.31
251 0.25
252 0.19
253 0.17
254 0.21
255 0.21
256 0.26
257 0.35
258 0.41
259 0.47
260 0.54
261 0.62
262 0.67
263 0.75
264 0.78
265 0.79
266 0.8
267 0.75
268 0.7
269 0.61
270 0.49
271 0.4
272 0.29
273 0.19
274 0.12
275 0.11
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.16
281 0.17
282 0.2
283 0.27
284 0.33
285 0.35
286 0.41
287 0.44
288 0.46
289 0.5
290 0.49
291 0.44
292 0.4
293 0.41
294 0.37
295 0.35
296 0.28
297 0.3
298 0.36
299 0.36
300 0.34
301 0.32
302 0.34
303 0.35
304 0.37
305 0.35
306 0.36
307 0.37
308 0.42
309 0.43
310 0.43
311 0.41
312 0.4
313 0.38
314 0.32
315 0.31
316 0.26
317 0.23
318 0.21
319 0.21
320 0.19
321 0.16
322 0.15
323 0.13
324 0.17
325 0.19
326 0.17
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.23
331 0.24
332 0.19
333 0.15
334 0.15
335 0.11
336 0.09
337 0.09
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.08
343 0.1
344 0.14
345 0.14
346 0.15
347 0.18
348 0.19
349 0.25
350 0.25
351 0.25
352 0.3
353 0.3
354 0.31
355 0.29
356 0.28
357 0.22
358 0.22
359 0.21
360 0.13
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.12
382 0.14
383 0.15
384 0.18
385 0.2
386 0.21
387 0.25
388 0.28
389 0.34
390 0.4
391 0.48
392 0.54
393 0.59
394 0.57
395 0.56
396 0.52
397 0.45
398 0.43
399 0.43
400 0.44
401 0.45
402 0.45
403 0.47
404 0.49
405 0.49
406 0.48
407 0.45
408 0.47
409 0.48
410 0.56
411 0.59
412 0.65
413 0.67
414 0.64
415 0.61
416 0.6
417 0.61
418 0.59
419 0.55
420 0.52
421 0.53
422 0.54
423 0.5
424 0.44
425 0.41
426 0.43
427 0.43
428 0.42
429 0.48
430 0.51
431 0.6
432 0.63
433 0.69
434 0.7
435 0.78
436 0.84
437 0.86
438 0.9
439 0.91
440 0.93
441 0.9
442 0.86
443 0.86
444 0.85
445 0.83
446 0.79
447 0.76
448 0.75
449 0.76
450 0.7
451 0.6
452 0.52
453 0.43
454 0.37
455 0.31
456 0.24
457 0.18
458 0.25
459 0.29
460 0.26
461 0.25