Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3XF83

Protein Details
Accession W3XF83    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-40RQATSAQRADSRKRKRREGTLPEDNSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-30RKRKRR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
KEGG pfy:PFICI_05732  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MVGGPFALPLPVWRQATSAQRADSRKRKRREGTLPEDNSSQDDEPLTPSALPSDSINPRSHSPDTLRQFAVAGLSPDEEVPSKLYPRFPHRSLPSGWQTGEVPRRRRSRSRTSGVTSESEAEGAETDGETVRRLTKNGRGELMSSHADIFKHMSTLMAILHRCIHEGDMRRAKRAFGLLLGTRHVDVRLNDMWTLGTEILMRDGETNKRQQARSSEASTDHSHTDGDGPDAANGDARPPPPARWGSADNMQKVRDYIETLAQHHPYDVHFTRSVSAVDFWPALYNIEIYNVDAEHRRALHRLEDSAALEDEDDGNDEFDMPYDDQYPDGDGDGDYEARLERRSQQREAVRARKQCAARDEIQNETRVAAQQIAERMDNLMMAVPYTTHVELLRLRGMLSLFIGDLQLPTRLLHRCNLIGYTTSELRLTTLKERVRNQVQSQEDWEAVWRWESEVDKAKLQFEKLAEKGIRLEPWLAKYLEPDEDVDTSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.39
4 0.44
5 0.44
6 0.42
7 0.47
8 0.54
9 0.62
10 0.66
11 0.69
12 0.71
13 0.75
14 0.82
15 0.84
16 0.87
17 0.88
18 0.89
19 0.87
20 0.88
21 0.84
22 0.76
23 0.69
24 0.59
25 0.5
26 0.44
27 0.34
28 0.25
29 0.21
30 0.18
31 0.2
32 0.2
33 0.19
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.14
38 0.15
39 0.14
40 0.2
41 0.25
42 0.29
43 0.32
44 0.33
45 0.36
46 0.42
47 0.42
48 0.39
49 0.4
50 0.45
51 0.48
52 0.51
53 0.48
54 0.42
55 0.4
56 0.35
57 0.31
58 0.22
59 0.18
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.13
68 0.14
69 0.17
70 0.2
71 0.25
72 0.3
73 0.39
74 0.46
75 0.46
76 0.53
77 0.54
78 0.57
79 0.55
80 0.57
81 0.55
82 0.51
83 0.49
84 0.41
85 0.38
86 0.4
87 0.46
88 0.45
89 0.45
90 0.49
91 0.57
92 0.63
93 0.71
94 0.72
95 0.74
96 0.77
97 0.78
98 0.78
99 0.75
100 0.73
101 0.67
102 0.6
103 0.5
104 0.42
105 0.33
106 0.25
107 0.19
108 0.14
109 0.11
110 0.09
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.13
119 0.14
120 0.16
121 0.2
122 0.27
123 0.34
124 0.37
125 0.39
126 0.34
127 0.34
128 0.34
129 0.34
130 0.27
131 0.2
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.17
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.16
153 0.21
154 0.29
155 0.36
156 0.37
157 0.4
158 0.41
159 0.4
160 0.37
161 0.34
162 0.26
163 0.18
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.19
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.11
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.13
181 0.14
182 0.09
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.13
192 0.16
193 0.21
194 0.25
195 0.3
196 0.31
197 0.33
198 0.36
199 0.39
200 0.41
201 0.39
202 0.36
203 0.32
204 0.35
205 0.34
206 0.3
207 0.24
208 0.19
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.21
231 0.23
232 0.23
233 0.29
234 0.32
235 0.3
236 0.31
237 0.3
238 0.26
239 0.24
240 0.23
241 0.16
242 0.14
243 0.12
244 0.15
245 0.16
246 0.19
247 0.22
248 0.22
249 0.21
250 0.2
251 0.19
252 0.14
253 0.2
254 0.17
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.19
259 0.19
260 0.19
261 0.13
262 0.13
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.18
293 0.17
294 0.12
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.06
299 0.07
300 0.05
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.06
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.17
328 0.27
329 0.32
330 0.35
331 0.42
332 0.47
333 0.55
334 0.63
335 0.64
336 0.62
337 0.63
338 0.64
339 0.63
340 0.61
341 0.58
342 0.54
343 0.51
344 0.48
345 0.5
346 0.49
347 0.49
348 0.47
349 0.44
350 0.39
351 0.33
352 0.29
353 0.22
354 0.2
355 0.15
356 0.14
357 0.14
358 0.17
359 0.19
360 0.18
361 0.16
362 0.17
363 0.15
364 0.14
365 0.11
366 0.09
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.1
376 0.12
377 0.14
378 0.18
379 0.19
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.18
384 0.15
385 0.14
386 0.11
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.14
397 0.17
398 0.19
399 0.22
400 0.26
401 0.27
402 0.28
403 0.29
404 0.26
405 0.24
406 0.24
407 0.26
408 0.23
409 0.22
410 0.2
411 0.19
412 0.19
413 0.19
414 0.21
415 0.21
416 0.28
417 0.33
418 0.4
419 0.44
420 0.52
421 0.59
422 0.63
423 0.62
424 0.63
425 0.62
426 0.58
427 0.58
428 0.51
429 0.42
430 0.35
431 0.33
432 0.26
433 0.23
434 0.21
435 0.17
436 0.15
437 0.19
438 0.2
439 0.24
440 0.32
441 0.34
442 0.37
443 0.39
444 0.43
445 0.43
446 0.43
447 0.41
448 0.35
449 0.41
450 0.36
451 0.43
452 0.39
453 0.37
454 0.4
455 0.39
456 0.38
457 0.32
458 0.36
459 0.32
460 0.35
461 0.39
462 0.35
463 0.31
464 0.32
465 0.34
466 0.32
467 0.29
468 0.27
469 0.24