Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W3XDD6

Protein Details
Accession W3XDD6    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-109DAVPKHARAPKKKKANLHTPAPRQVAHydrophilic
476-497LEGRQSQKTKWRKVQDDLDNNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-98KHARAPKKKKA
302-317DKEAHKKAEVSKKPAP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pfy:PFICI_05303  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSVAQLSRLLPLPEEELKQVLDYAATLSKAEAVEHFGNLLGDTPDAIDFISSFNSRRQEPKAAASQSRSQSHSQTQSPSHSDIDAVPKHARAPKKKKANLHTPAPRQVASLGPTPGTAYSKKNIQDDYISRKPSPGTSSNAFPLPGASRPPPKSATPPPPKLPPSAAGHLISEAPRAKPKSTPGSRSSTPAPKTKVNISGGTAMHGASTALSDLDAAIRALEMTTNPTRDTDDAARKCNCVAARHPLLAAAPNCLQCGKVVCLKEGLGPCTFCGTPILSSTEVQSMIHELKQERGRERMAADKEAHKKAEVSKKPAPFSKPREVTGNLSEAEAKAKEHRDRLLGFQAQNAQRTTVRDEASDFDVTGASMWASPEERARELKRQQKLMREMEWNARPEYEKRKQVVSIDIVKGKVVRKIAAMERPDSPEDDVEIPSAPVLEVTSGNRGKNGGAFSRNPLLGGLIKPVFDAKGKGAELEGRQSQKTKWRKVQDDLDNNEGVILDGGAYGGPSANEQATTGDEPACG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.24
5 0.23
6 0.22
7 0.17
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.11
15 0.15
16 0.14
17 0.15
18 0.13
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.18
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.16
27 0.1
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.18
41 0.22
42 0.25
43 0.31
44 0.36
45 0.41
46 0.43
47 0.49
48 0.53
49 0.55
50 0.57
51 0.56
52 0.58
53 0.57
54 0.58
55 0.55
56 0.48
57 0.48
58 0.51
59 0.53
60 0.49
61 0.48
62 0.47
63 0.5
64 0.51
65 0.49
66 0.42
67 0.35
68 0.32
69 0.28
70 0.33
71 0.28
72 0.28
73 0.27
74 0.26
75 0.31
76 0.36
77 0.42
78 0.45
79 0.53
80 0.59
81 0.69
82 0.75
83 0.79
84 0.83
85 0.85
86 0.82
87 0.82
88 0.82
89 0.79
90 0.8
91 0.74
92 0.65
93 0.55
94 0.48
95 0.41
96 0.34
97 0.31
98 0.23
99 0.2
100 0.19
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.18
106 0.2
107 0.26
108 0.3
109 0.33
110 0.33
111 0.32
112 0.36
113 0.39
114 0.45
115 0.46
116 0.46
117 0.42
118 0.42
119 0.41
120 0.38
121 0.38
122 0.34
123 0.32
124 0.32
125 0.35
126 0.35
127 0.35
128 0.31
129 0.25
130 0.23
131 0.19
132 0.17
133 0.18
134 0.2
135 0.27
136 0.3
137 0.34
138 0.35
139 0.36
140 0.42
141 0.47
142 0.54
143 0.55
144 0.6
145 0.6
146 0.65
147 0.65
148 0.6
149 0.54
150 0.48
151 0.44
152 0.4
153 0.39
154 0.31
155 0.29
156 0.27
157 0.25
158 0.2
159 0.18
160 0.16
161 0.15
162 0.2
163 0.22
164 0.23
165 0.25
166 0.31
167 0.38
168 0.43
169 0.48
170 0.47
171 0.52
172 0.52
173 0.52
174 0.52
175 0.49
176 0.46
177 0.46
178 0.45
179 0.42
180 0.44
181 0.45
182 0.46
183 0.41
184 0.38
185 0.34
186 0.35
187 0.31
188 0.29
189 0.25
190 0.17
191 0.14
192 0.12
193 0.1
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.18
218 0.19
219 0.27
220 0.28
221 0.33
222 0.34
223 0.33
224 0.32
225 0.32
226 0.28
227 0.22
228 0.23
229 0.26
230 0.27
231 0.27
232 0.27
233 0.24
234 0.22
235 0.23
236 0.2
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.1
244 0.13
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.13
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.11
277 0.17
278 0.22
279 0.25
280 0.25
281 0.28
282 0.28
283 0.28
284 0.29
285 0.31
286 0.28
287 0.28
288 0.28
289 0.32
290 0.38
291 0.39
292 0.38
293 0.31
294 0.3
295 0.34
296 0.43
297 0.41
298 0.42
299 0.46
300 0.5
301 0.53
302 0.56
303 0.55
304 0.53
305 0.56
306 0.58
307 0.55
308 0.51
309 0.53
310 0.51
311 0.49
312 0.43
313 0.38
314 0.27
315 0.24
316 0.23
317 0.18
318 0.17
319 0.14
320 0.12
321 0.13
322 0.19
323 0.23
324 0.26
325 0.28
326 0.31
327 0.32
328 0.35
329 0.38
330 0.37
331 0.33
332 0.32
333 0.37
334 0.35
335 0.37
336 0.33
337 0.28
338 0.25
339 0.27
340 0.29
341 0.27
342 0.25
343 0.22
344 0.23
345 0.24
346 0.25
347 0.23
348 0.19
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.11
353 0.08
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.11
361 0.14
362 0.16
363 0.22
364 0.26
365 0.34
366 0.41
367 0.49
368 0.52
369 0.59
370 0.61
371 0.65
372 0.7
373 0.67
374 0.64
375 0.6
376 0.57
377 0.56
378 0.57
379 0.5
380 0.42
381 0.38
382 0.35
383 0.36
384 0.42
385 0.43
386 0.45
387 0.45
388 0.48
389 0.49
390 0.5
391 0.51
392 0.47
393 0.46
394 0.42
395 0.43
396 0.39
397 0.37
398 0.37
399 0.33
400 0.31
401 0.25
402 0.22
403 0.21
404 0.26
405 0.31
406 0.35
407 0.36
408 0.34
409 0.35
410 0.39
411 0.38
412 0.34
413 0.3
414 0.23
415 0.23
416 0.23
417 0.2
418 0.16
419 0.16
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.08
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.08
428 0.09
429 0.18
430 0.21
431 0.21
432 0.22
433 0.23
434 0.22
435 0.24
436 0.27
437 0.24
438 0.26
439 0.28
440 0.32
441 0.37
442 0.37
443 0.33
444 0.29
445 0.26
446 0.24
447 0.22
448 0.24
449 0.19
450 0.18
451 0.19
452 0.2
453 0.19
454 0.18
455 0.19
456 0.15
457 0.22
458 0.22
459 0.22
460 0.22
461 0.26
462 0.26
463 0.3
464 0.34
465 0.31
466 0.33
467 0.36
468 0.39
469 0.43
470 0.52
471 0.56
472 0.59
473 0.66
474 0.72
475 0.78
476 0.83
477 0.84
478 0.84
479 0.79
480 0.74
481 0.64
482 0.56
483 0.47
484 0.37
485 0.26
486 0.16
487 0.11
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.1
501 0.11
502 0.15
503 0.17
504 0.18