Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H1Q1

Protein Details
Accession C1H1Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27DGGHVSKKRKKDASEHKAQSSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-27KKRKKDASEHKAQSSK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, plas 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG pbl:PAAG_04837  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MTGLLDGGHVSKKRKKDASEHKAQSSKRRAVADDVEEKGRIEQLENQIAESRKYYNNIVTLLSLFITEDATKSPNLTAALSLCRVFCRLIAGGQFNKSKGASEQDLILVAWLKERYQEYQHGLITVLKRADPSAQIAALALCMRLVKEQSVNGGAGAEIGVWKGGYFSDLIVALIETQDGDPVRSEFVKTFLNKYHDVAFYTLLHLSDYASSQKSTQFLDVVISLLSALGQPPSPDHEFENFYCGLSSVGQKHKSTLLSISSYKQRVQAAWLAVLRNNTLNESQRKTLLRMMSHAIAPWFLKPEMLMDFLTDSYDHGGSTSLLALSGLFYLIQEKNLDYPQFYPKLYSLLDANLLHFKHRSRFFRLLDTFLSSSHLPATLVASFIKRLSRLALNAPPAAIVVIVPWIYNLLKSHPTCTFMLHRVMRDDLQSNLQTHGMPDPFDPLEPDPTQTGALESSLWEIQTLQSHYHPNVASLAKIISEQFTKQAYNLEDFLDHSYQGMVEIELGKEERELKKVPVVEFQIPKRIFTDRLLEEDGGVDGEAGALVRRLWDFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.68
4 0.75
5 0.78
6 0.82
7 0.81
8 0.8
9 0.8
10 0.78
11 0.77
12 0.76
13 0.74
14 0.69
15 0.66
16 0.6
17 0.6
18 0.62
19 0.6
20 0.56
21 0.52
22 0.48
23 0.44
24 0.41
25 0.35
26 0.31
27 0.24
28 0.19
29 0.23
30 0.28
31 0.36
32 0.35
33 0.35
34 0.38
35 0.39
36 0.38
37 0.33
38 0.3
39 0.26
40 0.29
41 0.31
42 0.31
43 0.33
44 0.33
45 0.32
46 0.28
47 0.25
48 0.22
49 0.19
50 0.14
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.17
70 0.17
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.16
75 0.15
76 0.17
77 0.21
78 0.26
79 0.27
80 0.33
81 0.35
82 0.31
83 0.33
84 0.3
85 0.27
86 0.24
87 0.27
88 0.24
89 0.22
90 0.23
91 0.21
92 0.22
93 0.2
94 0.18
95 0.14
96 0.1
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.15
101 0.17
102 0.2
103 0.23
104 0.29
105 0.31
106 0.36
107 0.36
108 0.32
109 0.31
110 0.32
111 0.28
112 0.26
113 0.22
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.2
118 0.17
119 0.19
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.08
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.12
135 0.14
136 0.16
137 0.18
138 0.17
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.09
143 0.08
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.12
175 0.17
176 0.18
177 0.21
178 0.25
179 0.29
180 0.29
181 0.3
182 0.32
183 0.28
184 0.28
185 0.26
186 0.22
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.13
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.08
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.14
224 0.16
225 0.19
226 0.19
227 0.23
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.12
233 0.09
234 0.12
235 0.13
236 0.19
237 0.23
238 0.23
239 0.24
240 0.27
241 0.26
242 0.25
243 0.22
244 0.19
245 0.18
246 0.19
247 0.21
248 0.23
249 0.24
250 0.24
251 0.26
252 0.24
253 0.21
254 0.22
255 0.24
256 0.19
257 0.2
258 0.2
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.16
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.16
268 0.19
269 0.22
270 0.22
271 0.25
272 0.26
273 0.27
274 0.29
275 0.28
276 0.24
277 0.23
278 0.24
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.15
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.14
327 0.19
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.19
332 0.22
333 0.21
334 0.19
335 0.14
336 0.12
337 0.16
338 0.14
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.18
344 0.19
345 0.23
346 0.3
347 0.34
348 0.38
349 0.46
350 0.47
351 0.55
352 0.55
353 0.51
354 0.44
355 0.44
356 0.36
357 0.28
358 0.29
359 0.19
360 0.17
361 0.14
362 0.13
363 0.09
364 0.09
365 0.11
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.11
372 0.13
373 0.11
374 0.12
375 0.14
376 0.17
377 0.18
378 0.23
379 0.26
380 0.28
381 0.28
382 0.27
383 0.23
384 0.2
385 0.18
386 0.12
387 0.07
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.11
398 0.19
399 0.2
400 0.24
401 0.24
402 0.28
403 0.27
404 0.3
405 0.32
406 0.28
407 0.36
408 0.35
409 0.35
410 0.34
411 0.36
412 0.33
413 0.31
414 0.29
415 0.23
416 0.25
417 0.27
418 0.25
419 0.24
420 0.23
421 0.21
422 0.2
423 0.23
424 0.18
425 0.16
426 0.15
427 0.18
428 0.18
429 0.18
430 0.19
431 0.16
432 0.22
433 0.21
434 0.22
435 0.19
436 0.2
437 0.2
438 0.17
439 0.17
440 0.11
441 0.11
442 0.09
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.16
451 0.17
452 0.17
453 0.2
454 0.24
455 0.25
456 0.31
457 0.29
458 0.25
459 0.28
460 0.27
461 0.23
462 0.2
463 0.2
464 0.14
465 0.15
466 0.15
467 0.12
468 0.14
469 0.14
470 0.17
471 0.19
472 0.2
473 0.2
474 0.25
475 0.25
476 0.26
477 0.26
478 0.23
479 0.21
480 0.22
481 0.26
482 0.21
483 0.18
484 0.15
485 0.14
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.08
490 0.08
491 0.1
492 0.09
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.19
498 0.2
499 0.24
500 0.27
501 0.28
502 0.34
503 0.39
504 0.39
505 0.4
506 0.43
507 0.46
508 0.51
509 0.51
510 0.55
511 0.51
512 0.5
513 0.45
514 0.43
515 0.38
516 0.35
517 0.4
518 0.33
519 0.38
520 0.41
521 0.38
522 0.34
523 0.32
524 0.28
525 0.19
526 0.16
527 0.11
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.08