Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X0D7

Protein Details
Accession W3X0D7    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-35QTLHDETRSKRAQKRPDKALVEDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 8.5, cyto_mito 6.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
KEGG pfy:PFICI_09456  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFPFRYICDLLQTLHDETRSKRAQKRPDKALVEDWFHKHRKLLDEPSTNGVAVLSTLLPGNRPDRVYGIQVNRLQSIISRAMGLGISRLRVLQEYNTLPSSDKDLADCVEELLTNTPNPKQLEEITVEEIDAALHHVASGCKFSSKEVQASRNKDGQTISLGDFYNRLTARDAKWFTRLVLKDFAPVVMPETVVIKAYDYRLPEALAVREDFATAISLIREGGLASRPENLIKLGCKVARQPWYKAHSIKHCVGMIGTRQVSCEQKIDGEYCQIHIDLSKPRNQELKIYSKSGKESTKDRKNLHPAIRASLNIGKKACPLKQGCILEGELVVYSDRDRKILPFHKIRKHVSRSGAFLGTVGDSQRHDHEHLMIIYYDILMLDGTSFLGMQHSDRFQRLTKLITTRKGHAELIQRQIIDFRRKDAQRLLLAAFAKCIVARGEGLVLKPDDPYFTFGRKKKRYASCAIKLKKAYIKGFGDVGDFAVIGASHDARTAKSSKIENLKYTHFFLACLDNPTEAQARTHKPKYIVTNIVTLNDTQLKYFRQYCNPPMVRPEDHTSSEFDFRGLGNADRPTVIFSDPPVFDIYCFSFDKAPNSAMWTMRFPQVSKIHLDRDFLDVLSFVQLQEAAHDAVEEPEMEDSQEMRLWLAKLEATDPERKCLAYDSQSTVSTISTNQTASVVASTDSEAEGEQVQANPVVRPEDTPAAVAPQRGLITPPRSSATHATAATNVGARGSTAPNTRSSSRKRSSTAVEVTSPSKKPKTNTQNRDIQTTKRKPLGARDANDSQRSTRSGRSVSPPLSIGELEATPPVEGHFPSSVTGSFYTANEPPSSPSGRTPRKGRNAVGNGTMSKDESQVVERCRHVASKKRCAFKGCAFLLSPCIREYAWIDDLLKGHGIFGFQTIPEVWARQASSRSSSAASTPRSGSPTPGSINSATKRREQRLCLVDSRRADATRDFIKAIEVAGLTCRNGEREWISVYDWRILEDITSMESRAYRKGGPDPWRARYLGLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.31
4 0.29
5 0.3
6 0.39
7 0.43
8 0.48
9 0.54
10 0.61
11 0.69
12 0.77
13 0.84
14 0.84
15 0.85
16 0.82
17 0.78
18 0.77
19 0.73
20 0.69
21 0.65
22 0.61
23 0.59
24 0.58
25 0.55
26 0.5
27 0.5
28 0.51
29 0.53
30 0.58
31 0.59
32 0.62
33 0.63
34 0.64
35 0.59
36 0.51
37 0.42
38 0.32
39 0.22
40 0.14
41 0.13
42 0.08
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.14
48 0.17
49 0.2
50 0.21
51 0.23
52 0.26
53 0.29
54 0.34
55 0.38
56 0.41
57 0.45
58 0.47
59 0.48
60 0.44
61 0.41
62 0.35
63 0.29
64 0.28
65 0.23
66 0.2
67 0.18
68 0.17
69 0.18
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.16
81 0.22
82 0.24
83 0.27
84 0.28
85 0.28
86 0.28
87 0.27
88 0.29
89 0.26
90 0.23
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.22
95 0.21
96 0.16
97 0.13
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.16
104 0.17
105 0.23
106 0.24
107 0.24
108 0.25
109 0.26
110 0.29
111 0.3
112 0.31
113 0.29
114 0.27
115 0.26
116 0.22
117 0.19
118 0.15
119 0.11
120 0.09
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.1
127 0.12
128 0.11
129 0.14
130 0.15
131 0.18
132 0.26
133 0.29
134 0.36
135 0.39
136 0.48
137 0.54
138 0.6
139 0.63
140 0.6
141 0.56
142 0.51
143 0.46
144 0.38
145 0.34
146 0.3
147 0.26
148 0.24
149 0.24
150 0.21
151 0.21
152 0.2
153 0.23
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.24
158 0.26
159 0.35
160 0.38
161 0.34
162 0.38
163 0.38
164 0.36
165 0.4
166 0.4
167 0.34
168 0.36
169 0.34
170 0.33
171 0.32
172 0.31
173 0.23
174 0.21
175 0.2
176 0.14
177 0.14
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.11
185 0.13
186 0.16
187 0.16
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.07
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.16
221 0.18
222 0.21
223 0.21
224 0.23
225 0.26
226 0.32
227 0.39
228 0.42
229 0.44
230 0.47
231 0.51
232 0.56
233 0.56
234 0.57
235 0.57
236 0.59
237 0.57
238 0.54
239 0.49
240 0.43
241 0.38
242 0.34
243 0.27
244 0.27
245 0.25
246 0.2
247 0.21
248 0.23
249 0.26
250 0.24
251 0.24
252 0.18
253 0.18
254 0.2
255 0.2
256 0.18
257 0.21
258 0.19
259 0.18
260 0.19
261 0.17
262 0.15
263 0.14
264 0.16
265 0.19
266 0.22
267 0.27
268 0.27
269 0.31
270 0.37
271 0.37
272 0.41
273 0.39
274 0.45
275 0.43
276 0.46
277 0.46
278 0.43
279 0.46
280 0.44
281 0.43
282 0.37
283 0.43
284 0.49
285 0.55
286 0.6
287 0.61
288 0.64
289 0.69
290 0.74
291 0.72
292 0.69
293 0.61
294 0.57
295 0.56
296 0.47
297 0.41
298 0.38
299 0.33
300 0.29
301 0.29
302 0.25
303 0.28
304 0.33
305 0.31
306 0.33
307 0.33
308 0.34
309 0.41
310 0.42
311 0.37
312 0.34
313 0.32
314 0.25
315 0.22
316 0.18
317 0.1
318 0.08
319 0.08
320 0.06
321 0.06
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.13
326 0.14
327 0.23
328 0.3
329 0.38
330 0.43
331 0.51
332 0.59
333 0.66
334 0.71
335 0.72
336 0.72
337 0.7
338 0.68
339 0.62
340 0.58
341 0.53
342 0.47
343 0.37
344 0.3
345 0.24
346 0.17
347 0.14
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.1
352 0.12
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.16
357 0.18
358 0.17
359 0.17
360 0.15
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.05
366 0.05
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.07
379 0.1
380 0.12
381 0.13
382 0.15
383 0.16
384 0.21
385 0.21
386 0.22
387 0.24
388 0.3
389 0.35
390 0.4
391 0.42
392 0.41
393 0.44
394 0.43
395 0.4
396 0.37
397 0.41
398 0.38
399 0.41
400 0.39
401 0.35
402 0.32
403 0.36
404 0.36
405 0.35
406 0.29
407 0.27
408 0.33
409 0.34
410 0.37
411 0.38
412 0.38
413 0.32
414 0.34
415 0.32
416 0.27
417 0.28
418 0.24
419 0.2
420 0.14
421 0.12
422 0.09
423 0.1
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.12
439 0.13
440 0.17
441 0.24
442 0.28
443 0.39
444 0.44
445 0.49
446 0.54
447 0.61
448 0.62
449 0.64
450 0.69
451 0.67
452 0.72
453 0.69
454 0.65
455 0.58
456 0.56
457 0.51
458 0.47
459 0.4
460 0.37
461 0.35
462 0.31
463 0.31
464 0.27
465 0.23
466 0.17
467 0.15
468 0.08
469 0.07
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.03
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.15
484 0.16
485 0.2
486 0.28
487 0.3
488 0.31
489 0.32
490 0.35
491 0.33
492 0.34
493 0.31
494 0.22
495 0.2
496 0.18
497 0.19
498 0.16
499 0.17
500 0.15
501 0.13
502 0.13
503 0.14
504 0.15
505 0.11
506 0.12
507 0.14
508 0.19
509 0.26
510 0.29
511 0.3
512 0.31
513 0.35
514 0.39
515 0.4
516 0.41
517 0.35
518 0.38
519 0.35
520 0.34
521 0.3
522 0.24
523 0.19
524 0.18
525 0.16
526 0.11
527 0.13
528 0.13
529 0.16
530 0.21
531 0.23
532 0.26
533 0.3
534 0.34
535 0.42
536 0.43
537 0.4
538 0.39
539 0.41
540 0.36
541 0.35
542 0.36
543 0.29
544 0.3
545 0.3
546 0.28
547 0.25
548 0.26
549 0.23
550 0.18
551 0.15
552 0.13
553 0.13
554 0.12
555 0.1
556 0.11
557 0.11
558 0.12
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.08
565 0.09
566 0.13
567 0.12
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.14
573 0.14
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.15
578 0.16
579 0.19
580 0.19
581 0.19
582 0.15
583 0.18
584 0.2
585 0.18
586 0.18
587 0.18
588 0.18
589 0.21
590 0.22
591 0.19
592 0.24
593 0.27
594 0.27
595 0.29
596 0.3
597 0.32
598 0.33
599 0.34
600 0.27
601 0.27
602 0.25
603 0.21
604 0.18
605 0.12
606 0.11
607 0.11
608 0.1
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.08
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.06
629 0.07
630 0.06
631 0.06
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.08
638 0.1
639 0.13
640 0.14
641 0.22
642 0.22
643 0.24
644 0.24
645 0.24
646 0.23
647 0.23
648 0.24
649 0.21
650 0.24
651 0.26
652 0.28
653 0.28
654 0.28
655 0.26
656 0.21
657 0.17
658 0.14
659 0.11
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.07
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.1
685 0.11
686 0.1
687 0.11
688 0.14
689 0.15
690 0.15
691 0.16
692 0.15
693 0.17
694 0.18
695 0.17
696 0.14
697 0.13
698 0.13
699 0.13
700 0.14
701 0.17
702 0.2
703 0.21
704 0.23
705 0.23
706 0.24
707 0.27
708 0.29
709 0.28
710 0.29
711 0.28
712 0.27
713 0.25
714 0.25
715 0.22
716 0.19
717 0.14
718 0.09
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.1
723 0.13
724 0.15
725 0.17
726 0.21
727 0.26
728 0.28
729 0.34
730 0.4
731 0.47
732 0.5
733 0.55
734 0.54
735 0.55
736 0.57
737 0.58
738 0.55
739 0.48
740 0.44
741 0.4
742 0.4
743 0.41
744 0.38
745 0.35
746 0.35
747 0.36
748 0.38
749 0.47
750 0.55
751 0.6
752 0.66
753 0.69
754 0.72
755 0.7
756 0.74
757 0.66
758 0.64
759 0.64
760 0.63
761 0.62
762 0.58
763 0.6
764 0.55
765 0.62
766 0.64
767 0.62
768 0.56
769 0.57
770 0.58
771 0.6
772 0.61
773 0.53
774 0.43
775 0.39
776 0.39
777 0.35
778 0.32
779 0.33
780 0.32
781 0.35
782 0.4
783 0.44
784 0.42
785 0.41
786 0.38
787 0.33
788 0.31
789 0.27
790 0.2
791 0.15
792 0.13
793 0.11
794 0.11
795 0.1
796 0.08
797 0.08
798 0.09
799 0.09
800 0.09
801 0.11
802 0.12
803 0.12
804 0.13
805 0.14
806 0.14
807 0.14
808 0.15
809 0.14
810 0.14
811 0.14
812 0.17
813 0.18
814 0.19
815 0.18
816 0.18
817 0.19
818 0.22
819 0.25
820 0.23
821 0.29
822 0.37
823 0.44
824 0.51
825 0.57
826 0.63
827 0.7
828 0.75
829 0.72
830 0.72
831 0.7
832 0.67
833 0.63
834 0.56
835 0.47
836 0.42
837 0.39
838 0.29
839 0.23
840 0.21
841 0.17
842 0.15
843 0.19
844 0.22
845 0.25
846 0.29
847 0.29
848 0.31
849 0.32
850 0.36
851 0.38
852 0.43
853 0.49
854 0.55
855 0.61
856 0.67
857 0.69
858 0.69
859 0.7
860 0.67
861 0.67
862 0.58
863 0.55
864 0.47
865 0.44
866 0.46
867 0.41
868 0.35
869 0.25
870 0.25
871 0.2
872 0.22
873 0.23
874 0.22
875 0.22
876 0.22
877 0.23
878 0.24
879 0.25
880 0.24
881 0.23
882 0.17
883 0.15
884 0.14
885 0.13
886 0.11
887 0.12
888 0.12
889 0.1
890 0.12
891 0.11
892 0.13
893 0.13
894 0.14
895 0.13
896 0.15
897 0.17
898 0.19
899 0.23
900 0.24
901 0.28
902 0.29
903 0.3
904 0.28
905 0.27
906 0.29
907 0.32
908 0.32
909 0.31
910 0.32
911 0.33
912 0.37
913 0.36
914 0.36
915 0.33
916 0.35
917 0.35
918 0.34
919 0.35
920 0.33
921 0.4
922 0.41
923 0.44
924 0.42
925 0.47
926 0.54
927 0.59
928 0.64
929 0.63
930 0.67
931 0.67
932 0.7
933 0.7
934 0.67
935 0.65
936 0.6
937 0.59
938 0.53
939 0.47
940 0.44
941 0.38
942 0.39
943 0.36
944 0.36
945 0.33
946 0.28
947 0.28
948 0.26
949 0.23
950 0.19
951 0.14
952 0.12
953 0.15
954 0.17
955 0.15
956 0.17
957 0.17
958 0.17
959 0.17
960 0.22
961 0.21
962 0.23
963 0.26
964 0.25
965 0.27
966 0.29
967 0.31
968 0.32
969 0.29
970 0.27
971 0.25
972 0.23
973 0.21
974 0.17
975 0.16
976 0.13
977 0.14
978 0.13
979 0.13
980 0.17
981 0.18
982 0.22
983 0.24
984 0.24
985 0.28
986 0.36
987 0.43
988 0.49
989 0.58
990 0.61
991 0.64
992 0.67
993 0.63